SOX2

SOX2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1O4X, 2LE4
Ідентифікатори
Символи	SOX2, ANOP3, MCOPS3, SRY-box 2, Sox2, SRY-box transcription factor 2
Зовнішні ІД	OMIM: 184429 MGI: 98364 HomoloGene: 68298 GeneCards: SOX2
Пов'язані генетичні захворювання
syndromic microphthalmia 3
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • sequence-specific DNA binding • miRNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • transcription regulator complex • нуклеоплазма • клітинне ядро Біологічний процес • розвиток ока • pituitary gland development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of neuron differentiation • somatic stem cell population maintenance • endodermal cell fate specification • positive regulation of cell-cell adhesion • tissue regeneration • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization • transcription by RNA polymerase II • regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process • adenohypophysis development • transcription, DNA-templated • neuronal stem cell population maintenance • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • multicellular organism development • glial cell fate commitment • response to wounding • osteoblast differentiation • positive regulation of cell differentiation • negative regulation of epithelial cell proliferation • регуляція експресії генів • inner ear development • forebrain development • response to growth factor • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway • positive regulation of MAPK cascade • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • cytokine-mediated signaling pathway • диференціація клітин • cell fate commitment • central nervous system development • neuron differentiation Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6657	20674
Ensembl	ENSG00000181449	ENSMUSG00000074637
UniProt	P48431	P48432
RefSeq (мРНК)	NM_003106	NM_011443
RefSeq (білок)	NP_003097	NP_035573
Локус (UCSC)	Хр. 3: 181.71 – 181.71 Mb	Хр. 3: 34.7 – 34.71 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SOX2 (англ. SRY-box 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 317 амінокислот, а молекулярна маса — 34 310.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MYNMMETELK		PPGPQQTSGG		GGGNSTAAAA		GGNQKNSPDR		VKRPMNAFMV
WSRGQRRKMA		QENPKMHNSE		ISKRLGAEWK		LLSETEKRPF		IDEAKRLRAL
HMKEHPDYKY		RPRRKTKTLM		KKDKYTLPGG		LLAPGGNSMA		SGVGVGAGLG
AGVNQRMDSY		AHMNGWSNGS		YSMMQDQLGY		PQHPGLNAHG		AAQMQPMHRY
DVSALQYNSM		TSSQTYMNGS		PTYSMSYSQQ		GTPGMALGSM		GSVVKSEASS
SPPVVTSSSH		SRAPCQAGDL		RDMISMYLPG		AEVPEPAAPS		RLHMSQHYQS
GPVPGTAING		TLPLSHM

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до активаторів, білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Stevanovic M., Zuffardi O., Collignon J., Lovell-Badge R., Goodfellow P. (1994). The cDNA sequence and chromosomal location of the human SOX2 gene. Mamm. Genome. 5: 640—642. PMID 7849401 DOI:10.1007/BF00411460
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 3