BATF

BATF
Ідентифікатори
Символи	BATF, B-ATF, BATF1, SFA-2, SFA2, basic leucine zipper ATF-like transcription factor
Зовнішні ІД	OMIM: 612476 MGI: 1859147 HomoloGene: 4666 GeneCards: BATF
Пов'язані генетичні захворювання
розсіяний склероз
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • цитоплазма • нуклеоплазма • клітинне ядро Біологічний процес • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • диференціація клітин • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • T-helper 2 cell differentiation • GO:0032617 cytokine production • DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator • myeloid dendritic cell differentiation • lymphoid progenitor cell differentiation • T-helper 17 cell lineage commitment • cellular response to DNA damage stimulus • hematopoietic stem cell differentiation • Перемикання класу імуноглобулінів • T-helper 17 cell differentiation • defense response to protozoan • cytokine-mediated signaling pathway Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10538	53314
Ensembl	ENSG00000156127	ENSMUSG00000034266
UniProt	Q16520	O35284
RefSeq (мРНК)	NM_006399	NM_016767
RefSeq (білок)	NP_006390	NP_058047
Локус (UCSC)	Хр. 14: 75.52 – 75.55 Mb	Хр. 12: 85.73 – 85.76 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

BATF (англ. Basic leucine zipper ATF-like transcription factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 125 амінокислот, а молекулярна маса — 14 120.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MPHSSDSSDS		SFSRSPPPGK		QDSSDDVRRV		QRREKNRIAA		QKSRQRQTQK
ADTLHLESED		LEKQNAALRK		EIKQLTEELK		YFTSVLNSHE		PLCSVLAAST
PSPPEVVYSA		HAFHQPHVSS		PRFQP

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до репресорів, активаторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції, диференціація клітин. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Wang X., Johansen L.M., Tae H.-J., Taparowsky E.J. (1996). IFP 35 forms complexes with B-ATF, a member of the AP1 family of transcription factors. Biochem. Biophys. Res. Commun. 229: 316—322. PMID 8954125 DOI:10.1006/bbrc.1996.1799
• Echlin D.R., Tae H.-J., Mitin N., Taparowsky E.J. (2000). B-ATF functions as a negative regulator of AP-1 mediated transcription and blocks cellular transformation by Ras and Fos. Oncogene. 19: 1752—1763. PMID 10777209 DOI:10.1038/sj.onc.1203491

Див. також

• Хромосома 14