Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
MKX
Ідентифікатори
Символи
MKX , C10orf48, IFRX, IRXL1, mohawk homeobox
Зовнішні ІД
OMIM : 601332 MGI: 2687286 HomoloGene: 72239 GeneCards: MKX
Пов'язані генетичні захворювання
натуральна віспа [ 1]
Онтологія гена
Молекулярна функція
• sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• клітинне ядро
Біологічний процес
• GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • muscle organ development • multicellular organism development • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 10: 27.67 – 27.75 Mb
Хр. 18: 6.93 – 7 Mb
PubMed search
[ 2]
[ 3] Вікідані
MKX (англ. Mohawk homeobox ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 10-ї хромосоми.[ 4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 352 амінокислот , а молекулярна маса — 39 331[ 5] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MNTIVFNKLS GAVLFEDGGA SERERGGRPY SGVLDSPHAR PEVGIPDGPP
LKDNLGLRHR RTGARQNGGK VRHKRQALQD MARPLKQWLY KHRDNPYPTK
TEKILLALGS QMTLVQVSNW FANARRRLKN TVRQPDLSWA LRIKLYNKYV
QGNAERLSVS SDDSCSEDGE NPPRTHMNEG GYNTPVHHPV IKSENSVIKA
GVRPESRASE DYVAPPKYKS SLLNRYLNDS LRHVMATNTT MMGKTRQRNH
SGSFSSNEFE EELVSPSSSE TEGNFVYRTD TLENGSNKGE SAANRKGPSK
DDTYWKEINA AMALTNLAQG KDKLQGTTSC IIQKSSHIAE VKTVKVPLVQ
QF
Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші