SOX1

SOX1
Ідентифікатори
Символи	SOX1, SRY-box 1, SRY-box transcription factor 1
Зовнішні ІД	OMIM: 602148 MGI: 98357 HomoloGene: 133765 GeneCards: SOX1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • DNA binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • core promoter sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента • клітинне ядро Біологічний процес • forebrain neuron development • ventral spinal cord interneuron specification • forebrain development • neuron migration • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • GO:0031497, GO:0006336, GO:0034724, GO:0001301, GO:0007580, GO:0034652, GO:0010847 chromatin organization • lens morphogenesis in camera-type eye • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • нейробіологія розвитку • forebrain neuron differentiation • cellular response to leukemia inhibitory factor • диференціація клітин • central nervous system development • neuron differentiation Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6656	20664
Ensembl	ENSG00000182968	ENSMUSG00000096014
UniProt	O00570	P53783
RefSeq (мРНК)	NM_005986	NM_009233
RefSeq (білок)	NP_005977	NP_033259
Локус (UCSC)	Хр. 13: 112.07 – 112.07 Mb	Хр. 8: 12.45 – 12.45 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SOX1 (англ. SRY-box 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 13-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 391 амінокислоту, а молекулярна маса — 39 023.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MYSMMMETDL		HSPGGAQAPT		NLSGPAGAGG		GGGGGGGGGG		GGGAKANQDR
VKRPMNAFMV		WSRGQRRKMA		QENPKMHNSE		ISKRLGAEWK		VMSEAEKRPF
IDEAKRLRAL		HMKEHPDYKY		RPRRKTKTLL		KKDKYSLAGG		LLAAGAGGGG
AAVAMGVGVG		VGAAAVGQRL		ESPGGAAGGG		YAHVNGWANG		AYPGSVAAAA
AAAAMMQEAQ		LAYGQHPGAG		GAHPHAHPAH		PHPHHPHAHP		HNPQPMHRYD
MGALQYSPIS		NSQGYMSASP		SGYGGLPYGA		AAAAAAAAGG		AHQNSAVAAA
AAAAAASSGA		LGALGSLVKS		EPSGSPPAPA		HSRAPCPGDL		REMISMYLPA
GEGGDPAAAA		AAAAQSRLHS		LPQHYQGAGA		GVNGTVPLTH		I

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Malas S., Duthie S.M., Mohri F., Lovell-Badge R., Episkopou V. (1997). Cloning and mapping of the human SOX1: a highly conserved gene expressed in the developing brain. Mamm. Genome. 8: 866—868. PMID 9337405 DOI:10.1007/s003359900597

Див. також

• Хромосома 13