Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
POU4F1
Ідентифікатори
Символи
POU4F1 , BRN3A, Oct-T1, RDC-1, brn-3A, POU class 4 homeobox 1, ATITHS
Зовнішні ІД
OMIM : 601632 MGI: 102525 HomoloGene: 21255 GeneCards: POU4F1
Онтологія гена
Молекулярна функція
• GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • transcription factor activity, RNA polymerase II distal enhancer sequence-specific binding • chromatin binding • single-stranded DNA binding • sequence-specific DNA binding • GTPase binding • GO:0001105 transcription coactivator activity • GO:0001106 transcription corepressor activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• neuron projection • нуклеоплазма • клітинне ядро • цитоплазма
Біологічний процес
• peripheral nervous system neuron development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • habenula development • аксоноґенеза • trigeminal nerve development • neuron fate specification • ventricular compact myocardium morphogenesis • cell migration in hindbrain • negative regulation of apoptotic process • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • transcription, DNA-templated • нейробіологія розвитку • multicellular organism development • negative regulation of transcription elongation by RNA polymerase I • central nervous system neuron differentiation • neuron differentiation • positive regulation of apoptotic process • synapse assembly • peripheral nervous system neuron differentiation • mesoderm development • іннервація • proprioception involved in equilibrioception • regulation of neurogenesis • sensory system development • suckling behavior • regulation of signal transduction by p53 class mediator • GO:1901313 positive regulation of gene expression • neuron projection development • GO:1904089 negative regulation of neuron apoptotic process • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of programmed cell death • positive regulation of osteoclast differentiation • regulation of DNA-binding transcription factor activity • cellular response to cytokine stimulus • cellular response to estradiol stimulus • intrinsic apoptotic signaling pathway by p53 class mediator • positive regulation of transcription regulatory region DNA binding • heart development • negative regulation of gene expression
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 13: 78.6 – 78.6 Mb
н/д
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
POU4F1 (англ. POU class 4 homeobox 1 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми.[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 419 амінокислот , а молекулярна маса — 42 697[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MMSMNSKQPH FAMHPTLPEH KYPSLHSSSE AIRRACLPTP PLQSNLFASL
DETLLARAEA LAAVDIAVSQ GKSHPFKPDA TYHTMNSVPC TSTSTVPLAH
HHHHHHHHQA LEPGDLLDHI SSPSLALMAG AGGAGAAAGG GGAHDGPGGG
GGPGGGGGPG GGPGGGGGGG PGGGGGGPGG GLLGGSAHPH PHMHSLGHLS
HPAAAAAMNM PSGLPHPGLV AAAAHHGAAA AAAAAAAGQV AAASAAAAVV
GAAGLASICD SDTDPRELEA FAERFKQRRI KLGVTQADVG SALANLKIPG
VGSLSQSTIC RFESLTLSHN NMIALKPILQ AWLEEAEGAQ REKMNKPELF
NGGEKKRKRT SIAAPEKRSL EAYFAVQPRP SSEKIAAIAE KLDLKKNVVR
VWFCNQRQKQ KRMKFSATY
Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції , альтернативний сплайсинг .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у цитоплазмі , ядрі .
Bhargava A.K., Li Z., Weissman S.M. (1993). Differential expression of four members of the POU family of proteins in activated and phorbol 12-myristate 13-acetate-treated Jurkat T cells. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A . 90 : 10260—10264. PMID 8234287 DOI :10.1073/pnas.90.21.10260
Calissano M., Latchman D.S. (2003). Functional interaction between the small GTP-binding protein Rin and the N-terminal of Brn-3a transcription factor. Oncogene . 22 : 5408—5414. PMID 12934100 DOI :10.1038/sj.onc.1206635
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші