Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
DDIT3
Ідентифікатори
Символи
DDIT3 , CEBPZ, CHOP, CHOP-10, CHOP10, GADD153, DNA damage-inducible transcript 3, DNA damage inducible transcript 3, C/EBPzeta, AltDDIT3
Зовнішні ІД
OMIM : 126337 MGI: 109247 HomoloGene: 3012 GeneCards: DDIT3
Онтологія гена
Молекулярна функція
• DNA binding • cAMP response element binding protein binding • GO:0001106 transcription corepressor activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • transcription factor binding • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • leucine zipper domain binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein heterodimerization activity • protein homodimerization activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• цитоплазма • гіалоплазма • late endosome • CHOP-C/EBP complex • нуклеоплазма • transcription factor AP-1 complex • protein-DNA complex • CHOP-ATF4 complex • CHOP-ATF3 complex • клітинне ядро
Біологічний процес
• GO:0097285 апоптоз • release of sequestered calcium ion into cytosol • negative regulation of protein kinase B signaling • negative regulation of fat cell differentiation • negative regulation of myoblast differentiation • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of endoplasmic reticulum stress-induced intrinsic apoptotic signaling pathway • positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to endoplasmic reticulum stress • negative regulation of DNA binding • mRNA transcription by RNA polymerase II • positive regulation of neuron death • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • Wnt signaling pathway • cell redox homeostasis • response to endoplasmic reticulum stress • PERK-mediated unfolded protein response • ER overload response • cellular response to DNA damage stimulus • transcription, DNA-templated • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • ATF6-mediated unfolded protein response • positive regulation of neuron apoptotic process • response to unfolded protein • intrinsic apoptotic signaling pathway in response to endoplasmic reticulum stress • negative regulation of RNA polymerase II regulatory region sequence-specific DNA binding • positive regulation of interleukin-8 production • response to starvation • negative regulation of determination of dorsal identity • клітинний цикл • regulation of DNA-templated transcription in response to stress • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process • blood vessel maturation • negative regulation of CREB transcription factor activity • Відповідь на незгорнуті білки • establishment of protein localization to mitochondrion • intrinsic apoptotic signaling pathway in response to nitrosative stress • negative regulation of DNA-binding transcription factor activity • positive regulation of DNA-binding transcription factor activity • protein complex oligomerization • negative regulation of cold-induced thermogenesis • regulation of autophagy • positive regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 12: 57.52 – 57.52 Mb
Хр. 10: 127.13 – 127.13 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
DDIT3 (англ. DNA damage inducible transcript 3 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 169 амінокислот , а молекулярна маса — 19 175[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MAAESLPFSF GTLSSWELEA WYEDLQEVLS SDENGGTYVS PPGNEEEESK
IFTTLDPASL AWLTEEEPEP AEVTSTSQSP HSPDSSQSSL AQEEEEEDQG
RTRKRKQSGH SPARAGKQRM KEKEQENERK VAQLAEENER LKQEIERLTR
EVEATRRALI DRMVNLHQA
Кодований геном білок за функціями належить до репресорів , активаторів , фосфопротеїнів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як апоптоз , відповідь на стрес , транскрипція , регуляція транскрипції , відповідь на порушення конформації білку, клітинний цикл , сигнальний шлях Wnt, альтернативний сплайсинг .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у цитоплазмі , ядрі .
Crozat A., Aman P., Mandahl N., Ron D. (1993). Fusion of CHOP to a novel RNA-binding protein in human myxoid liposarcoma. Nature . 363 : 640—644. PMID 8510758 DOI :10.1038/363640a0
Rabbitts T.H., Forster A., Larson R., Nathan P. (1993). Fusion of the dominant negative transcription regulator CHOP with a novel gene FUS by translocation t(12;16) in malignant liposarcoma. Nat. Genet . 4 : 175—180. PMID 7503811 DOI :10.1038/ng0693-175
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
Oyadomari S., Mori M. (2004). Roles of CHOP/GADD153 in endoplasmic reticulum stress. Cell Death Differ . 11 : 381—389. PMID 14685163 DOI :10.1038/sj.cdd.4401373
Yamaguchi H., Wang H.G. (2004). CHOP is involved in endoplasmic reticulum stress-induced apoptosis by enhancing DR5 expression in human carcinoma cells. J. Biol. Chem . 279 : 45495—45502. PMID 15322075 DOI :10.1074/jbc.M406933200
Ohoka N., Yoshii S., Hattori T., Onozaki K., Hayashi H. (2005). TRB3, a novel ER stress-inducible gene, is induced via ATF4-CHOP pathway and is involved in cell death. EMBO J . 24 : 1243—1255. PMID 15775988 DOI :10.1038/sj.emboj.7600596
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші