Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
NKX3-1
Ідентифікатори
Символи
NKX3-1 , BAPX2, NKX3, NKX3.1, NKX3A, NK3 homeobox 1
Зовнішні ІД
OMIM : 602041 MGI: 97352 HomoloGene: 4494 GeneCards: NKX3-1
Онтологія гена
Молекулярна функція
• sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • transcription factor binding • histone deacetylase binding • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding • GO:0000983 RNA polymerase II general transcription initiation factor activity • estrogen receptor activity • protein kinase activator activity • protein self-association • MADS box domain binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • cysteine-type endopeptidase activator activity involved in apoptotic process • estrogen receptor binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0038050, GO:0004886, GO:0038051 nuclear receptor activity
Клітинна компонента
• внутрішньоклітинний • клітинне ядро • site of DNA damage
Біологічний процес
• somitogenesis • androgen receptor signaling pathway • cellular response to steroid hormone stimulus • dorsal aorta development • positive regulation of protein phosphorylation • male gonad development • positive regulation of cell death • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • protein kinase B signaling • response to testosterone • epithelial cell proliferation involved in salivary gland morphogenesis • cellular response to tumor necrosis factor • positive regulation of androgen secretion • positive regulation of mitotic cell cycle • positive regulation of apoptotic signaling pathway • prostate gland development • negative regulation of gene expression • transcription, DNA-templated • multicellular organism development • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • salivary gland development • heart development • positive regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process • GO:1901313 positive regulation of gene expression • positive regulation of response to DNA damage stimulus • branching involved in prostate gland morphogenesis • negative regulation of epithelial cell proliferation involved in prostate gland development • positive regulation of cell population proliferation • cellular response to interleukin-1 • negative regulation of epithelial cell proliferation • negative regulation of insulin-like growth factor receptor signaling pathway • urogenital system development • positive regulation of phosphatidylinositol 3-kinase signaling • metanephros development • GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated • activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process • branching morphogenesis of an epithelial tube • positive regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway • positive regulation of cell division • cellular response to hypoxia • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of cell population proliferation • negative regulation of mitotic cell cycle • pharyngeal system development • activation of protein kinase activity • regulation of protein localization • positive regulation of DNA-binding transcription factor activity • диференціація клітин
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 8: 23.68 – 23.68 Mb
Хр. 14: 69.43 – 69.43 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
NKX3-1 (англ. NK3 homeobox 1 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 234 амінокислот , а молекулярна маса — 26 350[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MLRVPEPRPG EAKAEGAAPP TPSKPLTSFL IQDILRDGAQ RQGGRTSSQR
QRDPEPEPEP EPEGGRSRAG AQNDQLSTGP RAAPEEAETL AETEPERHLG
SYLLDSENTS GALPRLPQTP KQPQKRSRAA FSHTQVIELE RKFSHQKYLS
APERAHLAKN LKLTETQVKI WFQNRRYKTK RKQLSSELGD LEKHSSLPAL
KEEAFSRASL VSVYNSYPYY PYLYCVGSWS PAFW
Кодований геном білок за функцією належить до репресорів .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції , альтернативний сплайсинг .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші