Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
HOXA3
Ідентифікатори
Символи
HOXA3 , HOX1, HOX1E, homeobox A3
Зовнішні ІД
OMIM : 142954 MGI: 96175 HomoloGene: 40725 GeneCards: HOXA3
Онтологія гена
Молекулярна функція
• sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • HMG box domain binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
Клітинна компонента
• нуклеоплазма • клітинне ядро
Біологічний процес
• embryonic skeletal system morphogenesis • glossopharyngeal nerve morphogenesis • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • thymus development • transcription, DNA-templated • embryonic skeletal system development • multicellular organism development • animal organ formation • blood vessel remodeling • thyroid gland development • cartilage development • parathyroid gland development • Ангіогенез • positive regulation of cell population proliferation • animal organ morphogenesis • specification of animal organ position • anterior/posterior pattern specification • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • calcium ion transport • експресія генів • magnesium ion homeostasis • bone mineralization • negative regulation of calcium ion transport • phosphate ion homeostasis • calcium ion homeostasis • positive regulation of receptor binding • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 7: 27.11 – 27.15 Mb
Хр. 6: 52.15 – 52.19 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
HOXA3 (англ. Homeobox A3 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 443 амінокислот , а молекулярна маса — 46 369[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MQKATYYDSS AIYGGYPYQA ANGFAYNANQ QPYPASAALG ADGEYHRPAC
SLQSPSSAGG HPKAHELSEA CLRTLSAPPS QPPSLGEPPL HPPPPQAAPP
APQPPQPAPQ PPAPTPAAPP PPSSASPPQN ASNNPTPANA AKSPLLNSPT
VAKQIFPWMK ESRQNTKQKT SSSSSGESCA GDKSPPGQAS SKRARTAYTS
AQLVELEKEF HFNRYLCRPR RVEMANLLNL TERQIKIWFQ NRRMKYKKDQ
KGKGMLTSSG GQSPSRSPVP PGAGGYLNSM HSLVNSVPYE PQSPPPFSKP
PQGTYGLPPA SYPASLPSCA PPPPPQKRYT AAGAGAGGTP DYDPHAHGLQ
GNGSYGTPHI QGSPVFVGGS YVEPMSNSGP ALFGLTHLPH AASGAMDYGG
AGPLGSGHHH GPGPGEPHPT YTDLTGHHPS QGRIQEAPKL THL
Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку .
Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція , регуляція транскрипції .
Білок має сайт для зв'язування з ДНК .
Локалізований у ядрі .
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res . 14 : 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
(1) Основні домени
(1.1) Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями (Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4) Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші