VCAM1

VCAM1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1IJ9, 1VCA, 1VSC
Ідентифікатори
Символи	VCAM1, CD106, INCAM-100, vascular cell adhesion molecule 1
Зовнішні ІД	OMIM: 192225 MGI: 98926 HomoloGene: 838 GeneCards: VCAM1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• primary amine oxidase activity; • integrin binding; • cell adhesion molecule binding;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • комплекс Ґольджі; • alpha9-beta1 integrin-vascular cell adhesion molecule-1 complex; • мембрана; • Філоподія; • клітинна мембрана; • apical part of cell; • Мікроворсинки; • cell surface; • early endosome; • ендоплазматичний ретикулум; • podosome; • Сарколема; • екзосома; • external side of plasma membrane; • міжклітинний простір; • integral component of plasma membrane;
Біологічний процес	• leukocyte cell-cell adhesion; • response to ionizing radiation; • heterophilic cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules; • response to hypoxia; • response to nutrient; • interferon-gamma-mediated signaling pathway; • cellular response to tumor necrosis factor; • response to nicotine; • GO:0010260 старіння людини; • response to zinc ion; • extracellular matrix organization; • amine metabolic process; • response to lipopolysaccharide; • адгезія клітин; • acute inflammatory response; • positive regulation of T cell proliferation; • membrane to membrane docking; • regulation of immune response; • leukocyte tethering or rolling; • cell chemotaxis; • B cell differentiation; • cellular response to vascular endothelial growth factor stimulus; • cell-matrix adhesion; • GO:0022415 viral process; • response to ethanol; • calcium-mediated signaling using intracellular calcium source; • chronic inflammatory response; • cell-cell adhesion; • cytokine-mediated signaling pathway; • heterotypic cell-cell adhesion; • іннервація; • cardiac neuron differentiation; • cell-cell adhesion in response to extracellular stimulus; • cellular response to amyloid-beta;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	7412
	22329
	ENSG00000162692
	ENSMUSG00000027962
	P19320
	P29533
	NM_080682; NM_001078; NM_001199834
	NM_011693
	NP_001069; NP_001186763; NP_542413
	NP_035823
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

VCAM1 (англ. Vascular cell adhesion molecule 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 739 амінокислот, а молекулярна маса — 81 276^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MPGKMVVILG	ASNILWIMFA	ASQAFKIETT	PESRYLAQIG	DSVSLTCSTT
GCESPFFSWR	TQIDSPLNGK	VTNEGTTSTL	TMNPVSFGNE	HSYLCTATCE
SRKLEKGIQV	EIYSFPKDPE	IHLSGPLEAG	KPITVKCSVA	DVYPFDRLEI
DLLKGDHLMK	SQEFLEDADR	KSLETKSLEV	TFTPVIEDIG	KVLVCRAKLH
IDEMDSVPTV	RQAVKELQVY	ISPKNTVISV	NPSTKLQEGG	SVTMTCSSEG
LPAPEIFWSK	KLDNGNLQHL	SGNATLTLIA	MRMEDSGIYV	CEGVNLIGKN
RKEVELIVQE	KPFTVEISPG	PRIAAQIGDS	VMLTCSVMGC	ESPSFSWRTQ
IDSPLSGKVR	SEGTNSTLTL	SPVSFENEHS	YLCTVTCGHK	KLEKGIQVEL
YSFPRDPEIE	MSGGLVNGSS	VTVSCKVPSV	YPLDRLEIEL	LKGETILENI
EFLEDTDMKS	LENKSLEMTF	IPTIEDTGKA	LVCQAKLHID	DMEFEPKQRQ
STQTLYVNVA	PRDTTVLVSP	SSILEEGSSV	NMTCLSQGFP	APKILWSRQL
PNGELQPLSE	NATLTLISTK	MEDSGVYLCE	GINQAGRSRK	EVELIIQVTP
KDIKLTAFPS	ESVKEGDTVI	ISCTCGNVPE	TWIILKKKAE	TGDTVLKSID
GAYTIRKAQL	KDAGVYECES	KNKVGSQLRS	LTLDVQGREN	NKDYFSPELL
VLYFASSLII	PAIGMIIYFA	RKANMKGSYS	LVEAQKSKV

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, взаємодія хазяїн-вірус. Локалізований у мембрані.

Література

Polte T., Newman W., Gopal T.V. (1990). Full length vascular cell adhesion molecule 1 (VCAM-1). Nucleic Acids Res. 18: 5901—5901. PMID 1699207 DOI:10.1093/nar/18.19.5901
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Osborn L., Vassallo C., Benjamin C.D. (1992). Activated endothelium binds lymphocytes through a novel binding site in the alternately spliced domain of vascular cell adhesion molecule-1. J. Exp. Med. 176: 99—107. PMID 1377228 DOI:10.1084/jem.176.1.99
Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites. Protein Sci. 13: 2819—2824. PMID 15340161 DOI:10.1110/ps.04682504
Iademarco M.F., McQuillan J.J., Rosen G.D., Dean D.C. (1992). Characterization of the promoter for vascular cell adhesion molecule-1 (VCAM-1). J. Biol. Chem. 267: 16323—16329. PMID 1379595

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12663 (англ.) . Процитовано 25 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P19320 (англ.) . Архів оригіналу за 3 жовтня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 1

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:12663 (англ.) . Процитовано 25 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, P19320 (англ.) . Архів оригіналу за 3 жовтня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

п о р Білки: кластери диференціації
1-50	CD1 a-c 1A 1D 1E CD2 CD3^[en] γ δ ε CD4 CD5 CD6 CD7 CD8 a CD9 CD10 CD11 a b c d CD13 CD14 CD15 CD16 A B CD18 CD19 CD20 CD21 CD22 CD23 CD24 CD25 CD26 CD27 CD28 CD29 CD30 CD31 CD32 A B CD33 CD34 CD35 CD36 CD37 CD38 CD39 CD40 CD41 CD42 a b c d CD43 CD44 CD45 CD46 CD47 CD48 CD49 a b c d e f CD50
51-100	CD51 CD52 CD53 CD54 CD55 CD56 CD57 CD58 CD59 CD61 CD62 E L P CD63 CD64^[en] A B C CD66 a b c d e f CD68 CD69 CD70 CD71 CD72 CD73 CD74 CD78 CD79 a b CD80 CD81 CD82 CD83 CD84 CD85 a d e h j k CD86 CD87 CD88 CD89 CD90 CD91 CD92 CD93 CD94 CD95 CD96 CD97 CD98 CD99 CD100
101-150	CD101 CD102 CD103 CD104 CD105 CD106 CD107 a b CD108 CD109 CD110 CD111 CD112 CD113 CD114 CD115 CD116 CD117 CD118 CD119 CD120 a b CD121 a b CD122 CD123 CD124 CD125 CD126 CD127 CD129 CD130 CD131 CD132 CD133 CD134 CD135 CD136 CD137 CD138 CD140b CD141 CD142 CD143 CD144 CD146 CD147 CD148 CD150
151-200	CD151 CD152 CD153 CD154 CD155 CD156 a b c CD157 CD158 (a d e i k) CD159 a c CD160 CD161 CD162 CD163 CD164 CD166 CD167 a b CD168 CD169 CD170 CD171 CD172 a b g CD174 CD177 CD178 CD179 a b CD180 CD181 CD182 CD183 CD184 CD185 CD186 CD191 CD192 CD193 CD194 CD195 CD196 CD197 CDw198 CDw199 CD200
201-250	CD201 CD202b CD204 CD205 CD206 CD207 CD208 CD209 CDw210 a b CD212 CD213a 1 2 CD217 CD218 (a b) CD220 CD221 CD222 CD223 CD224 CD225 CD226 CD227 CD228 CD229 CD230 CD233 CD234 CD235 a b CD236 CD238 CD239 CD240CE CD240D CD241 CD243 CD244 CD246 CD247 CD248 CD249
251-300	CD252 CD253 CD254 CD256 CD257 CD258 CD261 CD262 CD263 CD264 CD265 CD266 CD267 CD268 CD269 CD271 CD272 CD273 CD274 CD275 CD276 CD278 CD279 CD280 CD281 CD282 CD283 CD284 CD286 CD288 CD289 CD290 CD292 CDw293 CD294 CD295 CD297 CD298 CD299
301-350	CD300A CD301 CD302 CD303 CD304 CD305 CD306 CD307 CD309 CD312 CD314 CD315 CD316 CD317 CD318 CD320 CD321 CD322 CD324 CD325 CD326 CD328 CD329 CD331 CD332 CD333 CD334 CD335 CD336 CD337 CD338 CD339 CD340 CD344 CD349 CD350