ITGA4

ITGA4
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4HKC, 3V4P, 3V4V, 5FPI, 5C7Z
Ідентифікатори
Символи	ITGA4, CD49D, IA4, integrin subunit alpha 4
Зовнішні ІД	OMIM: 192975 MGI: 96603 HomoloGene: 37364 GeneCards: ITGA4
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein antigen binding • зв'язування з іоном металу • GO:0003823, GO:0051635 antigen binding • fibronectin binding • cell adhesion molecule binding • coreceptor activity • C-X3-C chemokine binding • protein heterodimerization activity Клітинна компонента • екзосома • integral component of membrane • мембрана • focal adhesion • cell surface • integrin alpha4-beta7 complex • integrin complex • клітинна мембрана • growth cone • soma • GO:0009327 protein-containing complex Біологічний процес • endodermal cell differentiation • B cell differentiation • positive regulation of T cell migration • extracellular matrix organization • heterotypic cell-cell adhesion • substrate adhesion-dependent cell spreading • cellular response to cytokine stimulus • cell-matrix adhesion involved in ameboidal cell migration • cell-matrix adhesion • leukocyte tethering or rolling • Діапедез • regulation of immune response • integrin-mediated signaling pathway • leukocyte migration • positive regulation of leukocyte tethering or rolling • positive regulation of leukocyte cell-cell adhesion • positive regulation of leukocyte migration • import into cell • leukocyte cell-cell adhesion • negative regulation of protein homodimerization activity • clathrin-dependent extracellular exosome endocytosis • адгезія клітин • receptor clustering • cell-cell adhesion mediated by integrin • axonogenesis involved in innervation • cell-cell adhesion in response to extracellular stimulus • cellular response to amyloid-beta • positive regulation of vascular endothelial cell proliferation • neuron projection extension • positive regulation of endothelial cell apoptotic process Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3676	16401
Ensembl	ENSG00000115232	ENSMUSG00000027009
UniProt	P13612	Q00651
RefSeq (мРНК)	NM_000885 NM_001316312	NM_010576
RefSeq (білок)	NP_000876 NP_001303241	NP_034706
Локус (UCSC)	Хр. 2: 181.46 – 181.54 Mb	Хр. 2: 79.09 – 79.16 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ITGA4 (англ. Integrin subunit alpha 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 032 амінокислот, а молекулярна маса — 114 900.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAWEARREPG		PRRAAVRETV		MLLLCLGVPT		GRPYNVDTES		ALLYQGPHNT
LFGYSVVLHS		HGANRWLLVG		APTANWLANA		SVINPGAIYR		CRIGKNPGQT
CEQLQLGSPN		GEPCGKTCLE		ERDNQWLGVT		LSRQPGENGS		IVTCGHRWKN
IFYIKNENKL		PTGGCYGVPP		DLRTELSKRI		APCYQDYVKK		FGENFASCQA
GISSFYTKDL		IVMGAPGSSY		WTGSLFVYNI		TTNKYKAFLD		KQNQVKFGSY
LGYSVGAGHF		RSQHTTEVVG		GAPQHEQIGK		AYIFSIDEKE		LNILHEMKGK
KLGSYFGASV		CAVDLNADGF		SDLLVGAPMQ		STIREEGRVF		VYINSGSGAV
MNAMETNLVG		SDKYAARFGE		SIVNLGDIDN		DGFEDVAIGA		PQEDDLQGAI
YIYNGRADGI		SSTFSQRIEG		LQISKSLSMF		GQSISGQIDA		DNNGYVDVAV
GAFRSDSAVL		LRTRPVVIVD		ASLSHPESVN		RTKFDCVENG		WPSVCIDLTL
CFSYKGKEVP		GYIVLFYNMS		LDVNRKAESP		PRFYFSSNGT		SDVITGSIQV
SSREANCRTH		QAFMRKDVRD		ILTPIQIEAA		YHLGPHVISK		RSTEEFPPLQ
PILQQKKEKD		IMKKTINFAR		FCAHENCSAD		LQVSAKIGFL		KPHENKTYLA
VGSMKTLMLN		VSLFNAGDDA		YETTLHVKLP		VGLYFIKILE		LEEKQINCEV
TDNSGVVQLD		CSIGYIYVDH		LSRIDISFLL		DVSSLSRAEE		DLSITVHATC
ENEEEMDNLK		HSRVTVAIPL		KYEVKLTVHG		FVNPTSFVYG		SNDENEPETC
MVEKMNLTFH		VINTGNSMAP		NVSVEIMVPN		SFSPQTDKLF		NILDVQTTTG
ECHFENYQRV		CALEQQKSAM		QTLKGIVRFL		SKTDKRLLYC		IKADPHCLNF
LCNFGKMESG		KEASVHIQLE		GRPSILEMDE		TSALKFEIRA		TGFPEPNPRV
IELNKDENVA		HVLLEGLHHQ		RPKRYFTIVI		ISSSLLLGLI		VLLLISYVMW
KAGFFKRQYK		SILQEENRRD		SWSYINSKSN		DD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, інтегринів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у мембрані.

Література

• Rubio M., Nueda A., Vara A., Corbi-Lopez A.L. (1992). A single mRNA encodes the alpha 150 and alpha 80/70 forms of the alpha subunit of VLA4. Eur. J. Immunol. 22: 1099—1102. PMID 1551405 DOI:10.1002/eji.1830220434
• Szabo M.C., McIntyre B.W. (1995). Identification of two variants of the human integrin alpha 4 subunit. Mol. Immunol. 32: 1453—1454. PMID 8643114 DOI:10.1016/0161-5890(96)00001-6
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Rosen G.D., Birkenmeier T.M., Dean D.C. (1991). Characterization of the alpha 4 integrin gene promoter. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 88: 4094—4098. PMID 2034655 DOI:10.1073/pnas.88.10.4094
• Takada Y., Strominger J.L., Hemler M.E. (1987). The very late antigen family of heterodimers is part of a superfamily of molecules involved in adhesion and embryogenesis. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 84: 3239—3243. PMID 3033641 DOI:10.1073/pnas.84.10.3239
• Luissint A.C., Lutz P.G., Calderwood D.A., Couraud P.O., Bourdoulous S. (2008). JAM-L-mediated leukocyte adhesion to endothelial cells is regulated in cis by alpha4beta1 integrin activation. J. Cell Biol. 183: 1159—1173. PMID 19064666 DOI:10.1083/jcb.200805061

Див. також

• Хромосома 2