ITGAM

ITGAM
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1BHO, 1BHQ, 1IDN, 1IDO, 1JLM, 1M1U, 1MF7, 1N9Z, 1NA5, 2LKE, 2LKJ, 3Q3G, 3QA3, 4M76, 4XW2
Ідентифікатори
Символи	ITGAM, CD11B, CR3A, MAC-1, MAC1A, MO1A, SLEB6, integrin subunit alpha M
Зовнішні ІД	OMIM: 120980 MGI: 96607 HomoloGene: 526 GeneCards: ITGAM
Пов'язані генетичні захворювання
системний червоний вовчак
Онтологія гена Молекулярна функція • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein heterodimerization activity • heat shock protein binding • amyloid-beta binding • complement component C3b binding • cargo receptor activity Клітинна компонента • екзосома • клітинна мембрана • cell surface • мембрана • integral component of membrane • integrin complex • міжклітинний простір • specific granule membrane • tertiary granule membrane • external side of plasma membrane • integrin alphaM-beta2 complex • plasma membrane raft • membrane raft Біологічний процес • ectodermal cell differentiation • toll-like receptor 4 signaling pathway • integrin-mediated signaling pathway • leukocyte migration • extracellular matrix organization • адгезія клітин • neutrophil degranulation • microglial cell activation • процес імунної системи • рецептор-опосередкований ендоцитоз • phagocytosis, engulfment • cytokine-mediated signaling pathway • positive regulation of superoxide anion generation • positive regulation of neutrophil degranulation • вроджений імунітет • negative regulation of dopamine metabolic process • positive regulation of protein targeting to membrane • amyloid-beta clearance • cell-cell adhesion via plasma-membrane adhesion molecules • complement-mediated synapse pruning • vertebrate eye-specific patterning • positive regulation of neuron death • positive regulation of microglial cell activation • positive regulation of microglial cell mediated cytotoxicity • cell surface receptor signaling pathway involved in cell-cell signaling • positive regulation of prostaglandin-E synthase activity • forebrain development • apoptotic signaling pathway • positive regulation of hippocampal neuron apoptotic process Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	3684	16409
Ensembl	ENSG00000169896	ENSMUSG00000030786
UniProt	P11215	P05555
RefSeq (мРНК)	NM_000632 NM_001145808	NM_001082960 NM_008401
RefSeq (білок)	NP_000623 NP_001139280	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 16: 31.26 – 31.33 Mb	Хр. 7: 127.66 – 127.72 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ITGAM (англ. Integrin subunit alpha M) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 152 амінокислот, а молекулярна маса — 127 179.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MALRVLLLTA		LTLCHGFNLD		TENAMTFQEN		ARGFGQSVVQ		LQGSRVVVGA
PQEIVAANQR		GSLYQCDYST		GSCEPIRLQV		PVEAVNMSLG		LSLAATTSPP
QLLACGPTVH		QTCSENTYVK		GLCFLFGSNL		RQQPQKFPEA		LRGCPQEDSD
IAFLIDGSGS		IIPHDFRRMK		EFVSTVMEQL		KKSKTLFSLM		QYSEEFRIHF
TFKEFQNNPN		PRSLVKPITQ		LLGRTHTATG		IRKVVRELFN		ITNGARKNAF
KILVVITDGE		KFGDPLGYED		VIPEADREGV		IRYVIGVGDA		FRSEKSRQEL
NTIASKPPRD		HVFQVNNFEA		LKTIQNQLRE		KIFAIEGTQT		GSSSSFEHEM
SQEGFSAAIT		SNGPLLSTVG		SYDWAGGVFL		YTSKEKSTFI		NMTRVDSDMN
DAYLGYAAAI		ILRNRVQSLV		LGAPRYQHIG		LVAMFRQNTG		MWESNANVKG
TQIGAYFGAS		LCSVDVDSNG		STDLVLIGAP		HYYEQTRGGQ		VSVCPLPRGR
ARWQCDAVLY		GEQGQPWGRF		GAALTVLGDV		NGDKLTDVAI		GAPGEEDNRG
AVYLFHGTSG		SGISPSHSQR		IAGSKLSPRL		QYFGQSLSGG		QDLTMDGLVD
LTVGAQGHVL		LLRSQPVLRV		KAIMEFNPRE		VARNVFECND		QVVKGKEAGE
VRVCLHVQKS		TRDRLREGQI		QSVVTYDLAL		DSGRPHSRAV		FNETKNSTRR
QTQVLGLTQT		CETLKLQLPN		CIEDPVSPIV		LRLNFSLVGT		PLSAFGNLRP
VLAEDAQRLF		TALFPFEKNC		GNDNICQDDL		SITFSFMSLD		CLVVGGPREF
NVTVTVRNDG		EDSYRTQVTF		FFPLDLSYRK		VSTLQNQRSQ		RSWRLACESA
SSTEVSGALK		STSCSINHPI		FPENSEVTFN		ITFDVDSKAS		LGNKLLLKAN
VTSENNMPRT		NKTEFQLELP		VKYAVYMVVT		SHGVSTKYLN		FTASENTSRV
MQHQYQVSNL		GQRSLPISLV		FLVPVRLNQT		VIWDRPQVTF		SENLSSTCHT
KERLPSHSDF		LAELRKAPVV		NCSIAVCQRI		QCDIPFFGIQ		EEFNATLKGN
LSFDWYIKTS		HNHLLIVSTA		EILFNDSVFT		LLPGQGAFVR		SQTETKVEPF
EVPNPLPLIV		GSSVGGLLLL		ALITAALYKL		GFFKRQYKDM		MSEGGPPGAE
PQ

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, інтегринів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію, іоном магнію. Локалізований у мембрані.

Література

• Arnaout M.A., Remold-O'Donnell E., Pierce M.W., Harris P., Tenen D.G. (1988). Molecular cloning of the alpha subunit of human and guinea pig leukocyte adhesion glycoprotein Mo1: chromosomal localization and homology to the alpha subunits of integrins. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 85: 2776—2780. PMID 2833753 DOI:10.1073/pnas.85.8.2776
• Arnaout M.A., Gupta S.K., Pierce M.W., Tenen D.G. (1988). Amino acid sequence of the alpha subunit of human leukocyte adhesion receptor Mo1 (complement receptor type 3). J. Cell Biol. 106: 2153—2158. PMID 2454931 DOI:10.1083/jcb.106.6.2153
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Shelley C.S., Arnaout M.A. (1991). The promoter of the CD11b gene directs myeloid-specific and developmentally regulated expression. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 88: 10525—10529. PMID 1683702 DOI:10.1073/pnas.88.23.10525
• Pierce M.W., Remold-O'Donnell E., Todd R.F. III, Arnaout M.A. (1986). N-terminal sequence of human leukocyte glycoprotein Mo1: conservation across species and homology to platelet IIb/IIIa. Biochim. Biophys. Acta. 874: 368—371. PMID 3539202 DOI:10.1016/0167-4838(86)90037-3
• Lee J.O., Rieu P., Arnaout M.A., Liddington R. (1995). Crystal structure of the A domain from the alpha subunit of integrin CR3 (CD11b/CD18). Cell. 80: 631—638. PMID 7867070 DOI:10.1016/0092-8674(95)90517-0

Див. також

• Хромосома 16