TNFSF11

TNFSF11
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3URF, 5BNQ
Ідентифікатори
Символи	TNFSF11, CD254, ODF, OPGL, OPTB2, RANKL, TRANCE, hRANKL2, sOdf, TNLG6B, tumor necrosis factor superfamily member 11, TNF superfamily member 11
Зовнішні ІД	OMIM: 602642 MGI: 1100089 HomoloGene: 2744 GeneCards: TNFSF11
Пов'язані генетичні захворювання
autosomal recessive osteopetrosis 2, Malignant infantile osteopetrosis
Онтологія гена Молекулярна функція • cytokine activity • tumor necrosis factor receptor superfamily binding • tumor necrosis factor receptor binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding Клітинна компонента • цитоплазма • integral component of membrane • мембрана • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • extracellular region • міжклітинний простір Біологічний процес • mammary gland epithelial cell proliferation • диференціація клітин • positive regulation of protein kinase B signaling • positive regulation of corticotropin-releasing hormone secretion • positive regulation of MAP kinase activity • calcium ion homeostasis • осифікація • monocyte chemotaxis • cytokine-mediated signaling pathway • osteoclast differentiation • ERK1 and ERK2 cascade • paracrine signaling • positive regulation of DNA-binding transcription factor activity • positive regulation of osteoclast differentiation • tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • GO:0010740 positive regulation of intracellular signal transduction • positive regulation of bone resorption • mammary gland alveolus development • positive regulation of JNK cascade • кісткова резорбція • positive regulation of osteoclast development • multicellular organism development • positive regulation of T cell activation • positive regulation of homotypic cell-cell adhesion • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity • positive regulation of fever generation by positive regulation of prostaglandin secretion • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade via TNFSF11-mediated signaling • regulation of osteoclast differentiation • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • animal organ morphogenesis • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • TNFSF11-mediated signaling pathway • positive regulation of phosphorylation • protein homooligomerization • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • osteoclast proliferation • calcium-mediated signaling • cellular response to leukemia inhibitory factor • regulation of signaling receptor activity • Прорізування зубів • bone development • GO:1901313 positive regulation of gene expression • osteoclast development • regulation of actin binding Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	8600	21943
Ensembl	ENSG00000120659	ENSMUSG00000022015
UniProt	O14788	O35235
RefSeq (мРНК)	NM_003701 NM_033012	NM_011613
RefSeq (білок)	NP_003692 NP_143026	NP_035743
Локус (UCSC)	Хр. 13: 42.56 – 42.61 Mb	Хр. 14: 78.51 – 78.55 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

TNFSF11 (англ. TNF superfamily member 11) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 13-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 317 амінокислот, а молекулярна маса — 35 478.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MRRASRDYTK		YLRGSEEMGG		GPGAPHEGPL		HAPPPPAPHQ		PPAASRSMFV
ALLGLGLGQV		VCSVALFFYF		RAQMDPNRIS		EDGTHCIYRI		LRLHENADFQ
DTTLESQDTK		LIPDSCRRIK		QAFQGAVQKE		LQHIVGSQHI		RAEKAMVDGS
WLDLAKRSKL		EAQPFAHLTI		NATDIPSGSH		KVSLSSWYHD		RGWAKISNMT
FSNGKLIVNQ		DGFYYLYANI		CFRHHETSGD		LATEYLQLMV		YVTKTSIKIP
SSHTLMKGGS		TKYWSGNSEF		HFYSINVGGF		FKLRSGEEIS		IEVSNPSLLD
PDQDATYFGA		FKVRDID

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, цитокінів, білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як диференціація клітин, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані. Також секретований назовні.

Література

• Nagai M., Kyakumoto S., Sato N. (2000). Cancer cells responsible for humoral hypercalcemia express mRNA encoding a secreted form of ODF/TRANCE that induces osteoclast formation. Biochem. Biophys. Res. Commun. 269: 532—536. PMID 10708588 DOI:10.1006/bbrc.2000.2314
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 13