CDH2

CDH2
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1NCG, 1NCH, 1NCI, 1NCJ, 1OP4, 2QVI, 3Q2W, 4NUM, 4NUP, 4NUQ
Ідентифікатори
Символи	CDH2, CD325, CDHN, CDw325, NCAD, cadherin 2, ACOGS, ARVD14
Зовнішні ІД	OMIM: 114020 MGI: 88355 HomoloGene: 20424 GeneCards: CDH2
Пов'язані генетичні захворювання
ожиріння
Онтологія гена Молекулярна функція • calcium ion binding • gamma-catenin binding • зв'язування з іоном металу • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • enzyme binding • protein phosphatase binding • alpha-catenin binding • protein kinase binding • beta-catenin binding • identical protein binding • cytoskeletal protein binding • protein homodimerization activity • cadherin binding Клітинна компонента • цитоплазма • integral component of membrane • мембрана • intercalated disc • cell-cell junction • focal adhesion • plasma membrane raft • Адгезивні контакти • клітинна мембрана • синапс • basolateral plasma membrane • apical plasma membrane • cortical actin cytoskeleton • catenin complex • fascia adherens • екзосома • lamellipodium • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення • Сарколема • endoplasmic reticulum lumen • cell surface • міжклітинні контакти • GO:0005578 Позаклітинна матриця • integral component of plasma membrane • neuron projection • apical part of cell • collagen-containing extracellular matrix • integral component of presynaptic active zone membrane • integral component of postsynaptic specialization membrane Біологічний процес • calcium-dependent cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules • heterophilic cell-cell adhesion via plasma membrane cell adhesion molecules • blood vessel morphogenesis • homeostasis of number of cells • positive regulation of muscle cell differentiation • regulation of postsynaptic density protein 95 clustering • glial cell differentiation • neuroepithelial cell differentiation • cell-cell adhesion mediated by cadherin • radial glial cell differentiation • neuronal stem cell population maintenance • regulation of oligodendrocyte progenitor proliferation • telencephalon development • neuroligin clustering involved in postsynaptic membrane assembly • positive regulation of synaptic vesicle clustering • адгезія клітин • regulation of signal transduction • cerebral cortex development • striated muscle cell differentiation • adherens junction organization • cell migration • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway • positive regulation of MAPK cascade • homophilic cell adhesion via plasma membrane adhesion molecules • brain morphogenesis • посттрансляційна модифікація • protein localization to plasma membrane • GO:0000767 cell morphogenesis • cell-cell junction assembly • synapse assembly • regulation of axonogenesis • regulation of synaptic transmission, glutamatergic • cell-cell adhesion Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	1000	12558
Ensembl	ENSG00000170558	ENSMUSG00000024304
UniProt	P19022	P15116
RefSeq (мРНК)	NM_001308176 NM_001792	NM_007664
RefSeq (білок)	NP_001295105 NP_001783 NP_001783.2	NP_031690
Локус (UCSC)	Хр. 18: 27.93 – 28.18 Mb	Хр. 18: 16.72 – 16.94 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

CDH2 (англ. Cadherin 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 18-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 906 амінокислот, а молекулярна маса — 99 809.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MCRIAGALRT		LLPLLAALLQ		ASVEASGEIA		LCKTGFPEDV		YSAVLSKDVH
EGQPLLNVKF		SNCNGKRKVQ		YESSEPADFK		VDEDGMVYAV		RSFPLSSEHA
KFLIYAQDKE		TQEKWQVAVK		LSLKPTLTEE		SVKESAEVEE		IVFPRQFSKH
SGHLQRQKRD		WVIPPINLPE		NSRGPFPQEL		VRIRSDRDKN		LSLRYSVTGP
GADQPPTGIF		IINPISGQLS		VTKPLDREQI		ARFHLRAHAV		DINGNQVENP
IDIVINVIDM		NDNRPEFLHQ		VWNGTVPEGS		KPGTYVMTVT		AIDADDPNAL
NGMLRYRIVS		QAPSTPSPNM		FTINNETGDI		ITVAAGLDRE		KVQQYTLIIQ
ATDMEGNPTY		GLSNTATAVI		TVTDVNDNPP		EFTAMTFYGE		VPENRVDIIV
ANLTVTDKDQ		PHTPAWNAVY		RISGGDPTGR		FAIQTDPNSN		DGLVTVVKPI
DFETNRMFVL		TVAAENQVPL		AKGIQHPPQS		TATVSVTVID		VNENPYFAPN
PKIIRQEEGL		HAGTMLTTFT		AQDPDRYMQQ		NIRYTKLSDP		ANWLKIDPVN
GQITTIAVLD		RESPNVKNNI		YNATFLASDN		GIPPMSGTGT		LQIYLLDIND
NAPQVLPQEA		ETCETPDPNS		INITALDYDI		DPNAGPFAFD		LPLSPVTIKR
NWTITRLNGD		FAQLNLKIKF		LEAGIYEVPI		IITDSGNPPK		SNISILRVKV
CQCDSNGDCT		DVDRIVGAGL		GTGAIIAILL		CIIILLILVL		MFVVWMKRRD
KERQAKQLLI		DPEDDVRDNI		LKYDEEGGGE		EDQDYDLSQL		QQPDTVEPDA
IKPVGIRRMD		ERPIHAEPQY		PVRSAAPHPG		DIGDFINEGL		KAADNDPTAP
PYDSLLVFDY		EGSGSTAGSL		SSLNSSSSGG		EQDYDYLNDW		GPRFKKLADM
YGGGDD

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах.

Література

• Reid R.A., Hemperly J.J. (1990). Human N-cadherin: nucleotide and deduced amino acid sequence. Nucleic Acids Res. 18: 5896—5896. PMID 2216790 DOI:10.1093/nar/18.19.5896
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Wallis J.A., Fox M., Walsh F.S. (1994). Structure of the human N-cadherin gene: YAC analysis and fine chromosomal mapping to 18q11.2. Genomics. 22: 172—179. PMID 7959764 DOI:10.1006/geno.1994.1358
• Bhatt A.S., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Craik C.S., Moasser M.M. (2005). Adhesion signaling by a novel mitotic substrate of src kinases. Oncogene. 24: 5333—5343. PMID 16007225 DOI:10.1038/sj.onc.1208582
• Salomon D., Ayalon O., Patel-King R., Hynes R.O., Geiger B. (1992). Extrajunctional distribution of N-cadherin in cultured human endothelial cells. J. Cell Sci. 102: 7—17. PMID 1500442

Див. також

• Хромосома 18