Плектин

Плектин
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1MB8, 2ODU, 2ODV, 3F7P, 3PDY, 3PE0, 4GDO, 4Q58, 4Q59, 2N03, 5J1H, 5J1G, 5J1I
Ідентифікатори
Символи	PLEC, EBS1, EBSMD, EBSND, EBSO, EBSOG, EBSPA, HD1, LGMD2Q, PCN, PLEC1, PLEC1b, PLTN, plectin, LGMDR17, EBS5D, EBS5C, EBS5B, EBS5A
Зовнішні ІД	OMIM: 601282 MGI: 1277961 HomoloGene: 384 GeneCards: PLEC
Пов'язані генетичні захворювання
epidermolysis bullosa simplex with muscular dystrophy, epidermolysis bullosa simplex of Ogna, autosomal recessive limb-girdle muscular dystrophy type 2Q, epidermolysis bullosa simplex with pyloric atresia
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • ankyrin binding • actin binding • structural constituent of muscle • RNA binding • cytoskeletal protein binding • cadherin binding • structural molecule activity • structural constituent of cytoskeleton Клітинна компонента • focal adhesion • клітинна мембрана • hemidesmosome • міжклітинні контакти • brush border • Саркоплазма • contractile fiber • Сарколема • costamere • intermediate filament cytoskeleton • екзосома • цитоскелет • GO:0005578 Позаклітинна матриця • цитоплазма • гіалоплазма • Проміжні філаменти • мембрана • perinuclear region of cytoplasm Біологічний процес • hemidesmosome assembly • cytoskeleton organization • Загоєння ран • intermediate filament cytoskeleton organization Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	5339	18810
Ensembl	ENSG00000178209	ENSMUSG00000022565
UniProt	Q15149	Q9QXS1
RefSeq (мРНК)	NM_000445 NM_201378 NM_201379 NM_201380 NM_201381 NM_201382 NM_201383 NM_201384	NM_001163540 NM_001163542 NM_001163549 NM_001164203 NM_011117 NM_201385 NM_201386 NM_201387 NM_201388 NM_201389 NM_201390 NM_201391 NM_201392 NM_201393 NM_201394
RefSeq (білок)	NP_000436 NP_958780 NP_958781 NP_958782 NP_958783 NP_958784 NP_958785 NP_958786	NP_001157012 NP_001157014 NP_001157021 NP_001157675 NP_035247 NP_958787 NP_958788 NP_958789 NP_958790 NP_958791 NP_958792 NP_958793 NP_958794 NP_958795 NP_958796
Локус (UCSC)	Хр. 8: 143.92 – 143.98 Mb	Хр. 15: 76.06 – 76.12 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

Плектин (англ. Plectin) – білок, який кодується геном PLEC, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 4 684 амінокислот, а молекулярна маса — 531 791.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MVAGMLMPRD		QLRAIYEVLF		REGVMVAKKD		RRPRSLHPHV		PGVTNLQVMR
AMASLRARGL		VRETFAWCHF		YWYLTNEGIA		HLRQYLHLPP		EIVPASLQRV
RRPVAMVMPA		RRTPHVQAVQ		GPLGSPPKRG		PLPTEEQRVY		RRKELEEVSP
ETPVVPATTQ		RTLARPGPEP		APATDERDRV		QKKTFTKWVN		KHLIKAQRHI
SDLYEDLRDG		HNLISLLEVL		SGDSLPREKG		RMRFHKLQNV		QIALDYLRHR
QVKLVNIRND		DIADGNPKLT		LGLIWTIILH		FQISDIQVSG		QSEDMTAKEK
LLLWSQRMVE		GYQGLRCDNF		TSSWRDGRLF		NAIIHRHKPL		LIDMNKVYRQ
TNLENLDQAF		SVAERDLGVT		RLLDPEDVDV		PQPDEKSIIT		YVSSLYDAMP
RVPDVQDGVR		ANELQLRWQE		YRELVLLLLQ		WMRHHTAAFE		ERRFPSSFEE
IEILWSQFLK		FKEMELPAKE		ADKNRSKGIY		QSLEGAVQAG		QLKVPPGYHP
LDVEKEWGKL		HVAILEREKQ		LRSEFERLEC		LQRIVTKLQM		EAGLCEEQLN
QADALLQSDV		RLLAAGKVPQ		RAGEVERDLD		KADSMIRLLF		NDVQTLKDGR
HPQGEQMYRR		VYRLHERLVA		IRTEYNLRLK		AGVAAPATQV		AQVTLQSVQR
RPELEDSTLR		YLQDLLAWVE		ENQHRVDGAE		WGVDLPSVEA		QLGSHRGLHQ
SIEEFRAKIE		RARSDEGQLS		PATRGAYRDC		LGRLDLQYAK		LLNSSKARLR
SLESLHSFVA		AATKELMWLN		EKEEEEVGFD		WSDRNTNMTA		KKESYSALMR
ELELKEKKIK		ELQNAGDRLL		REDHPARPTV		ESFQAALQTQ		WSWMLQLCCC
IEAHLKENAA		YFQFFSDVRE		AEGQLQKLQE		ALRRKYSCDR		SATVTRLEDL
LQDAQDEKEQ		LNEYKGHLSG		LAKRAKAVVQ		LKPRHPAHPM		RGRLPLLAVC
DYKQVEVTVH		KGDECQLVGP		AQPSHWKVLS		SSGSEAAVPS		VCFLVPPPNQ
EAQEAVTRLE		AQHQALVTLW		HQLHVDMKSL		LAWQSLRRDV		QLIRSWSLAT
FRTLKPEEQR		QALHSLELHY		QAFLRDSQDA		GGFGPEDRLM		AEREYGSCSH
HYQQLLQSLE		QGAQEESRCQ		RCISELKDIR		LQLEACETRT		VHRLRLPLDK
EPARECAQRI		AEQQKAQAEV		EGLGKGVARL		SAEAEKVLAL		PEPSPAAPTL
RSELELTLGK		LEQVRSLSAI		YLEKLKTISL		VIRGTQGAEE		VLRAHEEQLK
EAQAVPATLP		ELEATKASLK		KLRAQAEAQQ		PTFDALRDEL		RGAQEVGERL
QQRHGERDVE		VERWRERVAQ		LLERWQAVLA		QTDVRQRELE		QLGRQLRYYR
ESADPLGAWL		QDARRRQEQI		QAMPLADSQA		VREQLRQEQA		LLEEIERHGE
KVEECQRFAK		QYINAIKDYE		LQLVTYKAQL		EPVASPAKKP		KVQSGSESVI
QEYVDLRTHY		SELTTLTSQY		IKFISETLRR		MEEEERLAEQ		QRAEERERLA
EVEAALEKQR		QLAEAHAQAK		AQAEREAKEL		QQRMQEEVVR		REEAAVDAQQ
QKRSIQEELQ		QLRQSSEAEI		QAKARQAEAA		ERSRLRIEEE		IRVVRLQLEA
TERQRGGAEG		ELQALRARAE		EAEAQKRQAQ		EEAERLRRQV		QDESQRKRQA
EVELASRVKA		EAEAAREKQR		ALQALEELRL		QAEEAERRLR		QAEVERARQV
QVALETAQRS		AEAELQSKRA		SFAEKTAQLE		RSLQEEHVAV		AQLREEAERR
AQQQAEAERA		REEAERELER		WQLKANEALR		LRLQAEEVAQ		QKSLAQAEAE
KQKEEAEREA		RRRGKAEEQA		VRQRELAEQE		LEKQRQLAEG		TAQQRLAAEQ
ELIRLRAETE		QGEQQRQLLE		EELARLQREA		AAATQKRQEL		EAELAKVRAE
MEVLLASKAR		AEEESRSTSE		KSKQRLEAEA		GRFRELAEEA		ARLRALAEEA
KRQRQLAEED		AARQRAEAER		VLAEKLAAIG		EATRLKTEAE		IALKEKEAEN
ERLRRLAEDE		AFQRRRLEEQ		AAQHKADIEE		RLAQLRKASD		SELERQKGLV
EDTLRQRRQV		EEEILALKAS		FEKAAAGKAE		LELELGRIRS		NAEDTLRSKE
QAELEAARQR		QLAAEEERRR		REAEERVQKS		LAAEEEAARQ		RKAALEEVER
LKAKVEEARR		LRERAEQESA		RQLQLAQEAA		QKRLQAEEKA		HAFAVQQKEQ
ELQQTLQQEQ		SVLDQLRGEA		EAARRAAEEA		EEARVQAERE		AAQSRRQVEE
AERLKQSAEE		QAQARAQAQA		AAEKLRKEAE		QEAARRAQAE		QAALRQKQAA
DAEMEKHKKF		AEQTLRQKAQ		VEQELTTLRL		QLEETDHQKN		LLDEELQRLK
AEATEAARQR		SQVEEELFSV		RVQMEELSKL		KARIEAENRA		LILRDKDNTQ
RFLQEEAEKM		KQVAEEAARL		SVAAQEAARL		RQLAEEDLAQ		QRALAEKMLK
EKMQAVQEAT		RLKAEAELLQ		QQKELAQEQA		RRLQEDKEQM		AQQLAEETQG
FQRTLEAERQ		RQLEMSAEAE		RLKLRVAEMS		RAQARAEEDA		QRFRKQAEEI
GEKLHRTELA		TQEKVTLVQT		LEIQRQQSDH		DAERLREAIA		ELEREKEKLQ
QEAKLLQLKS		EEMQTVQQEQ		LLQETQALQQ		SFLSEKDSLL		QRERFIEQEK
AKLEQLFQDE		VAKAQQLREE		QQRQQQQMEQ		ERQRLVASME		EARRRQHEAE
EGVRRKQEEL		QQLEQQRRQQ		EELLAEENQR		LREQLQLLEE		QHRAALAHSE
EVTASQVAAT		KTLPNGRDAL		DGPAAEAEPE		HSFDGLRRKV		SAQRLQEAGI
LSAEELQRLA		QGHTTVDELA		RREDVRHYLQ		GRSSIAGLLL		KATNEKLSVY
AALQRQLLSP		GTALILLEAQ		AASGFLLDPV		RNRRLTVNEA		VKEGVVGPEL
HHKLLSAERA		VTGYKDPYTG		QQISLFQAMQ		KGLIVREHGI		RLLEAQIATG
GVIDPVHSHR		VPVDVAYRRG		YFDEEMNRVL		ADPSDDTKGF		FDPNTHENLT
YLQLLERCVE		DPETGLCLLP		LTDKAAKGGE		LVYTDSEARD		VFEKATVSAP
FGKFQGKTVT		IWEIINSEYF		TAEQRRDLLR		QFRTGRITVE		KIIKIIITVV
EEQEQKGRLC		FEGLRSLVPA		AELLESRVID		RELYQQLQRG		ERSVRDVAEV
DTVRRALRGA		NVIAGVWLEE		AGQKLSIYNA		LKKDLLPSDM		AVALLEAQAG
TGHIIDPATS		ARLTVDEAVR		AGLVGPEFHE		KLLSAEKAVT		GYRDPYTGQS
VSLFQALKKG		LIPREQGLRL		LDAQLSTGGI		VDPSKSHRVP		LDVACARGCL
DEETSRALSA		PRADAKAYSD		PSTGEPATYG		ELQQRCRPDQ		LTGLSLLPLS
EKAARARQEE		LYSELQARET		FEKTPVEVPV		GGFKGRTVTV		WELISSEYFT
AEQRQELLRQ		FRTGKVTVEK		VIKILITIVE		EVETLRQERL		SFSGLRAPVP
ASELLASGVL		SRAQFEQLKD		GKTTVKDLSE		LGSVRTLLQG		SGCLAGIYLE
DTKEKVSIYE		AMRRGLLRAT		TAALLLEAQA		ATGFLVDPVR		NQRLYVHEAV
KAGVVGPELH		EQLLSAEKAV		TGYRDPYSGS		TISLFQAMQK		GLVLRQHGIR
LLEAQIATGG		IIDPVHSHRV		PVDVAYQRGY		FSEEMNRVLA		DPSDDTKGFF
DPNTHENLTY		RQLLERCVED		PETGLRLLPL		KGAEKAEVVE		TTQVYTEEET
RRAFEETQID		IPGGGSHGGS		TMSLWEVMQS		DLIPEEQRAQ		LMADFQAGRV
TKERMIIIII		EIIEKTEIIR		QQGLASYDYV		RRRLTAEDLF		EARIISLETY
NLLREGTRSL		REALEAESAW		CYLYGTGSVA		GVYLPGSRQT		LSIYQALKKG
LLSAEVARLL		LEAQAATGFL		LDPVKGERLT		VDEAVRKGLV		GPELHDRLLS
AERAVTGYRD		PYTEQTISLF		QAMKKELIPT		EEALRLLDAQ		LATGGIVDPR
LGFHLPLEVA		YQRGYLNKDT		HDQLSEPSEV		RSYVDPSTDE		RLSYTQLLRR
CRRDDGTGQL		LLPLSDARKL		TFRGLRKQIT		MEELVRSQVM		DEATALQLRE
GLTSIEEVTK		NLQKFLEGTS		CIAGVFVDAT		KERLSVYQAM		KKGIIRPGTA
FELLEAQAAT		GYVIDPIKGL		KLTVEEAVRM		GIVGPEFKDK		LLSAERAVTG
YKDPYSGKLI		SLFQAMKKGL		ILKDHGIRLL		EAQIATGGII		DPEESHRLPV
EVAYKRGLFD		EEMNEILTDP		SDDTKGFFDP		NTEENLTYLQ		LMERCITDPQ
TGLCLLPLKE		KKRERKTSSK		SSVRKRRVVI		VDPETGKEMS		VYEAYRKGLI
DHQTYLELSE		QECEWEEITI		SSSDGVVKSM		IIDRRSGRQY		DIDDAIAKNL
IDRSALDQYR		AGTLSITEFA		DMLSGNAGGF		RSRSSSVGSS		SSYPISPAVS
RTQLASWSDP		TEETGPVAGI		LDTETLEKVS		ITEAMHRNLV		DNITGQRLLE
AQACTGGIID		PSTGERFPVT		DAVNKGLVDK		IMVDRINLAQ		KAFCGFEDPR
TKTKMSAAQA		LKKGWLYYEA		GQRFLEVQYL		TGGLIEPDTP		GRVPLDEALQ
RGTVDARTAQ		KLRDVGAYSK		YLTCPKTKLK		ISYKDALDRS		MVEEGTGLRL
LEAAAQSTKG		YYSPYSVSGS		GSTAGSRTGS		RTGSRAGSRR		GSFDATGSGF
SMTFSSSSYS		SSGYGRRYAS		GSSASLGGPE		SAVA

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Білок має сайт для зв'язування з молекулою актину. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, клітинних контактах.

Література

• Liu C.-G., Maercker C., Castanon M.J., Hauptmann R., Wiche G. (1996). Human plectin: organization of the gene, sequence analysis, and chromosome localization (8q24). Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 93: 4278—4283. PMID 8633055 DOI:10.1073/pnas.93.9.4278
• Zhang T., Haws P., Wu Q. (2004). Multiple variable first exons: a mechanism for cell- and tissue-specific gene regulation. Genome Res. 14: 79—89. PMID 14672974 DOI:10.1101/gr.1225204
• Koster J., Geerts D., Favre B., Borradori L., Sonnenberg A. (2003). Analysis of the interactions between BP180, BP230, plectin and the integrin alpha6beta4 important for hemidesmosome assembly. J. Cell Sci. 116: 387—399. PMID 12482924 DOI:10.1242/jcs.00241
• Carrascal M., Ovelleiro D., Casas V., Gay M., Abian J. (2008). Phosphorylation analysis of primary human T lymphocytes using sequential IMAC and titanium oxide enrichment. J. Proteome Res. 7: 5167—5176. PMID 19367720 DOI:10.1021/pr800500r
• Maiweilidan Y., Klauza I., Kordeli E. (2011). Novel interactions of ankyrins-G at the costameres: the muscle-specific Obscurin/Titin-Binding-related Domain (OTBD) binds plectin and filamin C. Exp. Cell Res. 317: 724—736. PMID 21223964 DOI:10.1016/j.yexcr.2011.01.002
• Sonnenberg A., Rojas A.M., de Pereda J.M. (2007). The structure of a tandem pair of spectrin repeats of plectin reveals a modular organization of the plakin domain. J. Mol. Biol. 368: 1379—1391. PMID 17397861 DOI:10.1016/j.jmb.2007.02.090

Див. також

• Хромосома 8