Idi na sadržaj

COL11A2

S Wikipedije, slobodne enciklopedije
COL11A2
Identifikatori
AliasiCOL11A2
Vanjski ID-jeviOMIM: 120290 MGI: 88447 HomoloGene: 22547 GeneCards: COL11A2
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 6 (čovjek)
Hrom.Hromosom 6 (čovjek)[1]
Hromosom 6 (čovjek)
Genomska lokacija za COL11A2
Genomska lokacija za COL11A2
Bend6p21.32Početak33,162,681 bp[1]
Kraj33,192,499 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 17 (miš)
Hrom.Hromosom 17 (miš)[2]
Hromosom 17 (miš)
Genomska lokacija za COL11A2
Genomska lokacija za COL11A2
Bend17 B1|17 17.98 cMPočetak34,258,411 bp[2]
Kraj34,285,659 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije


Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija protein-macromolecule adaptor activity
extracellular matrix structural constituent
GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
extracellular matrix structural constituent conferring tensile strength
vezivanje iona metala
Ćelijska komponenta extracellular region
collagen
endoplasmic reticulum lumen
collagen type XI trimer
Vanćelijsko
GO:0005578 Vanćelijski matriks
collagen-containing extracellular matrix
Biološki proces soft palate development
skeletal system development
roof of mouth development
cartilage development
sluh
collagen fibril organization
extracellular matrix organization
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
ENSG00000204248
ENSG00000232541
ENSG00000227801
ENSG00000230930
ENSG00000206290
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_001163771
NM_080679
NM_080680
NM_080681

NM_009926
NM_001317722
NM_001401301

RefSeq (bjelančevina)

NP_001157243
NP_542410
NP_542411
NP_542412

NP_001304651
NP_034056

Lokacija (UCSC)Chr 6: 33.16 – 33.19 MbChr 17: 34.26 – 34.29 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Kolagenski lanac alfa-2(XI) jest protein koji je kod ljudi kodiran genom COL11A2.[5][6][7]

Aminokiselinska sekvenca

[uredi | uredi izvor]

Dužina polipeptidnog lanca je 1.736 aminokiselina, а molekulska težina 171.791 Da.[8]

1020304050
MERCSRCHRLLLLLPLVLGLSAAPGWAGAPPVDVLRALRFPSLPDGVRRA
KGICPADVAYRVARPAQLSAPTRQLFPGGFPKDFSLLTVVRTRPGLQAPL
LTLYSAQGVRQLGLELGRPVRFLYEDQTGRPQPPSQPVFRGLSLADGKWH
RVAVAVKGQSVTLIVDCKKRVTRPLPRSARPVLDTHGVIIFGARILDEEV
FEGDVQELAIVPGVQAAYESCEQKELECEGGQRERPQNQQPHRAQRSPQQ
QPSRLHRPQNQEPQSQPTESLYYDYEPPYYDVMTTGTTPDYQDPTPGEEE
EILESSLLPPLEEEQTDLQVPPTADRFQAEEYGEGGTDPPEGPYDYTYGY
GDDYREETELGPALSAETAHSGAAAHGPRGLKGEKGEPAVLEPGMLVEGP
PGPEGPAGLIGPPGIQGNPGPVGDPGERGPPGRAGLPGSDGAPGPPGTSL
MLPFRFGSGGGDKGPVVAAQEAQAQAILQQARLALRGPPGPMGYTGRPGP
LGQPGSPGLKGESGDLGPQGPRGPQGLTGPPGKAGRRGRAGADGARGMPG
DPGVKGDRGFDGLPGLPGEKGHRGDTGAQGLPGPPGEDGERGDDGEIGPR
GLPGESGPRGLLGPKGPPGIPGPPGVRGMDGPQGPKGSLGPQGEPGPPGQ
QGTPGTQGLPGPQGAIGPHGEKGPQGKPGLPGMPGSDGPPGHPGKEGPPG
TKGNQGPSGPQGPLGYPGPRGVKGVDGIRGLKGHKGEKGEDGFPGFKGDI
GVKGDRGEVGVPGSRGEDGPEGPKGRTGPTGDPGPPGLMGEKGKLGVPGL
PGYPGRQGPKGSLGFPGFPGASGEKGARGLSGKSGPRGERGPTGPRGQRG
PRGATGKSGAKGTSGGDGPHGPPGERGLPGPQGPNGFPGPKGPLGPPGKD
GLPGHPGQRGEVGFQGKTGPPGPPGVVGPQGAAGETGPMGERGHPGPPGP
PGEQGLPGTAGKEGTKGDPGPPGAPGKDGPAGLRGFPGERGLPGTAGGPG
LKGNEGPSGPPGPAGSPGERGAAGSGGPIGPPGRPGPQGPPGAAGEKGVP
GEKGPIGPTGRDGVQGPVGLPGPAGPPGVAGEDGDKGEVGDPGQKGTKGN
KGEHGPPGPPGPIGPVGQPGAAGADGEPGARGPQGHFGAKGDEGTRGFNG
PPGPIGLQGLPGPSGEKGETGDVGPMGPPGPPGPRGPAGPNGADGPQGPP
GGVGNLGPPGEKGEPGESGSPGIQGEPGVKGPRGERGEKGESGQPGEPGP
PGPKGPTGDDGPKGNPGPVGFPGDPGPPGEGGPRGQDGAKGDRGEDGEPG
QPGSPGPTGENGPPGPLGKRGPAGSPGSEGRQGGKGAKGDPGAIGAPGKT
GPVGPAGPAGKPGPDGLRGLPGSVGQQGRPGATGQAGPPGPVGPPGLPGL
RGDAGAKGEKGHPGLIGLIGPPGEQGEKGDRGLPGPQGSPGQKGEMGIPG
ASGPIGPGGPPGLPGPAGPKGAKGATGPGGPKGEKGVQGPPGHPGPPGEV
IQPLPIQMPKKTRRSVDGSRLMQEDEAIPTGGAPGSPGGLEEIFGSLDSL
REEIEQMRRPTGTQDSPARTCQDLKLCHPELPDGEYWVDPNQGCARDAFR
VFCNFTAGGETCVTPRDDVTQFSYVDSEGSPVGVVQLTFLRLLSVSAHQD
VSYPCSGAARDGPLRLRGANEDELSPETSPYVKEFRDGCQTQQGRTVLEV
RTPVLEQLPVLDASFSDLGAPPRRGGVLLGPVCFMG

Pregled

[uredi | uredi izvor]

Gen COL11A2 proizvodi jednu komponentu ovog tipa kolagena, zvanog lanac pro-alfa2 (XI). Kolagen tipa XI dodaje strukturu i snagu tkivima koja podržavaju tjelesne mišiće, zglobove, organa i kožađe ( vezivno tkivo). Kolagen tipa XI obično se nalazi u hrskavicama kao i u tekućini koja ispunjava očnu jabučicu, unutrašnjem uhu i središnjem dijelu diskova između pršljenova u kičmi (nucleus pulposus). Kolagen tipa XI također pomaže u održavanju razmaka i promjera kolagenih vlakana tipa II. Kolagen tipa II važna je komponenta oka i zrelog hrskavičavog tkiva. Veličina i raspored kolagenih fibrila tipa II ključni su za normalnu strukturu ovih tkiva.

Lanac pro-alfa2 (XI) kombinira se sa lancima pro-alfa1 (XI) i pro-alfa1 (II) kolagena, kako bi formirao molekulu prokolagena. Ove trolančane molekule, slične užetu moraju biti obrađene enzimima u ćeliji. Nakon obrade, te molekule prokolagena napuštaju ćeliju i raspoređuju se u dugačke, tanke vlakna koja se međusobno umrežavaju u prostorima oko ćelija. Ukrštene veze rezultiraju stvaranjem vrlo snažnih zrelih vlakana kolagena tipa XI.

Gen COL11A2 nalazi se na kratkom (p) kraku hromosoma 6, na poziciji 21.3, od bp 33,238.446 do baznog para 33,268.222.

Funkcija

[uredi | uredi izvor]

Ovaj gen kodira jedan od dva alfa lanca kolagena tipa XI, manji vlaknasti kolagen. Nalazi se vrlo blizu, ali odvojeno od gena za retinoidni X receptor beta. Kolagen tipa XI je heterotrimer, ali je treći alfa lanac posttranslacijski modificirani lanac alfa 1 tip II. Proteolitska obrada lanca ovog tipa XI proizvodi PARP, protein bogat prolinom/argininom koji je amino terminalni domen. Mutacije u ovom genu povezane su s tipom III Sticklerovog sindroma, otospondilomegaepifiznom displazijom (OSMED sindrom), Weissenbacher-Zweymullerovim sindromom i autosomno dominantnom nesindromskom senzorinervnom gluhoćom 13. Za ovaj gen su identificirane tri varijante transkripta koje kodiraju različite izoforme.[7]

Klinički značaj

[uredi | uredi izvor]

Pokazalo se da mutacije gena COL11A2 uzrokuju gubitak sluha bez drugih znakova ili simptoma nesindromne gluhoće, autosomno dominantnim poremećajem u dvije velike porodice. Jedna porodica nosi mutaciju koja zamjenjuje aminokiselinu cistein (građevni blok proteina) za aminokiselinu arginin na poziciji 549 (napisana kao Arg549Cys) u alfa lancu 2 kolagena tipa XI. Druga porodica ima mutaciju koja zamjenjuje aminokiselinu glutaminsku kiselinu za aminokiselinu glicin na poziciji 323 (napisana kao Gly323Glu) u ovom proteinu. Ove mutacije sprječavaju normalno sastavljanje kolagena tipa XI. Kolagen tipa XI ima važnu ulogu u strukturi i funkciji unutrašnjeg uha. Kada mutacije gena COL11A2 utiču na strukturu kolagenskih vlakana, može doći do gubitka sluha.

Otospondilomegaepifizna displazija

[uredi | uredi izvor]

Otprilike 10 mutacija identificiranih u genu COL11A2 odgovorno je za otospondilomegaepifiznu displaziju (OSMED). Većina ovih mutacija rezultira potpunim nedostatkom pro-alfa2 (XI) lanaca, što dovodi do gubitka funkcije kolagena tipa XI. Neke mutacije utiču na proizvodnju lanca pro-alfa2 (XI) i remete normalno sklapanje kolagena. Budući da je ovaj tip kolagena važna komponenta hrskavice i drugog vezivnog tkiva, ove mutacije rezultiraju karakterističnim znakovima i simptomima OSMED-a.

Sticklerov sindrom

[uredi | uredi izvor]

Sticklerov sindrom (COL11A2) je poremećaj koji uzrokuje probleme s razvojem skeleta, vidom i sluhom. Mutacije u genu COL11A2 uzrokuju oblik sindroma u kojem vid nije oštećen. COL11A2 mutacije uzrokuju abnormalnu proizvodnju lanca pro-alpha2 (XI), dijela kolagena tipa XI. Kao rezultat toga, kolagen tipa XI je oslabljen i ne može pravilno funkcionirati, uzrokujući probleme sa skeletom i sluhom karakteristične za Sticklerov sindrom. Lanac pro-alpha2 (XI), međutim, nije prisutan u očima. Umjesto toga, drugi tip kolagenog lanca zamjenjuje pro-alfa2 (XI), kako bi formirao kolagen tipa XI u staklastom tijelu oka. Stoga mutacije COL11A2 ne utiču na vid.

Weissenbacher-Zweymüllerov sindrom

[uredi | uredi izvor]

Najmanje jedna identifikovana mutacija u genu COL11A2 odgovorna je za Weissenbacher-Zweymüllerov sindrom. Ova mutacija dovodi do zamjene aminokiseline glicin sa aminokiselinom glutaminska kiselina na položaju 955 u alfa 2 lancu kolagena tipa XI (Gly955Glu). Ova mutacija sprečava pravilno sastavljanje molekula kolagena, što narušava strukturu kolagena tipa XI. Ove promjene rezultiraju karakterističnim znakovima i simptomima Weissenbacher-Zweymüllerovog sindroma.

Vaskulitis

[uredi | uredi izvor]

Pokazana je veza između ANCA-vezanog vaskulitisa i jednonukleotidnih polimorfizama (SNP-ova) u genu COL11A2, u Genomewide studiji pridruživanja. Predlaže se da ova povezanost može biti posljedica neravnoteže povezivanja između SNP-a u lokusu HLA-DP i SNP-a u COL11A2. Teoretizira se tako jer je utvrđeno da je SNP u molekuli HLA jako snažno povezan s ovim bolestima s dokazima o jednoj genetičkoj povezanosti.

Reference

[uredi | uredi izvor]
  1. ^ a b c ENSG00000232541, ENSG00000227801, ENSG00000230930, ENSG00000206290, ENSG00000235708, ENSG00000223699 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000204248, ENSG00000232541, ENSG00000227801, ENSG00000230930, ENSG00000206290, ENSG00000235708, ENSG00000223699 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000024330 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Vuristo MM, Pihlajamaa T, Vandenberg P, Prockop DJ, Ala-Kokko L (septembar 1995). "The human COL11A2 gene structure indicates that the gene has not evolved with the genes for the major fibrillar collagens". The Journal of Biological Chemistry. 270 (39): 22873–81. doi:10.1074/jbc.270.39.22873. PMID 7559422.
  6. ^ McGuirt WT, Prasad SD, Griffith AJ, Kunst HP, Green GE, Shpargel KB, Runge C, Huybrechts C, Mueller RF, Lynch E, King MC, Brunner HG, Cremers CW, Takanosu M, Li SW, Arita M, Mayne R, Prockop DJ, Van Camp G, Smith RJ (decembar 1999). "Mutations in COL11A2 cause non-syndromic hearing loss (DFNA13)". Nature Genetics. 23 (4): 413–9. doi:10.1038/70516. PMID 10581026. S2CID 24289573.
  7. ^ a b "Entrez Gene: COL11A2 collagen, type XI, alpha 2".
  8. ^ "UniProt, P13942" (jezik: engleski). Pristupljeno 1. 10. 2021.

Dopunska literatura

[uredi | uredi izvor]

Vanjski linkovi

[uredi | uredi izvor]