RIPK3

RIPK3
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 4M66, 4M69
Ідентифікатори
Символи	RIPK3, RIP3, receptor interacting serine/threonine kinase 3
Зовнішні ІД	OMIM: 605817 MGI: 2154952 HomoloGene: 31410 GeneCards: RIPK3
Онтологія гена Молекулярна функція • transferase activity • protein kinase activity • nucleotide binding • GO:0001105 transcription coactivator activity • kinase activity • protein serine/threonine kinase activity • NF-kappaB-inducing kinase activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • ATP binding • GO:0032403 protein-containing complex binding Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • мембрана • клітинна мембрана • внутрішньоклітинний • мітохондрія Біологічний процес • regulation of CD8-positive, alpha-beta cytotoxic T cell extravasation • amyloid fibril formation • T cell differentiation in thymus • protein heterooligomerization • фосфорилювання • thymus development • regulation of interferon-gamma production • GO:1900490 positive regulation of oxidoreductase activity • regulation of adaptive immune response • spleen development • GO:1904489 regulation of reactive oxygen species metabolic process • regulation of activation-induced cell death of T cells • T cell homeostasis • positive regulation of phosphatase activity • positive regulation of necroptotic process • protein phosphorylation • regulation of activated T cell proliferation • positive regulation of reactive oxygen species metabolic process • NIK/NF-kappaB signaling • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity • apoptotic signaling pathway • protein autophosphorylation • positive regulation of ligase activity • GO:0060554, GO:0060555 Некроптоз • regulation of T cell mediated cytotoxicity • I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • lymph node development • protein homooligomerization • activation of protein kinase activity • positive regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway • GO:0072468 сигнальна трансдукція • GO:0010703, GO:0010702 запрограмована клітинна смерть • positive regulation of necrotic cell death • positive regulation of nucleic acid-templated transcription • cellular response to hydrogen peroxide • programmed necrotic cell death Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	11035	56532
Ensembl	ENSG00000129465 ENSG00000285379	ENSMUSG00000022221
UniProt	Q9Y572	Q9QZL0
RefSeq (мРНК)	NM_006871	NM_001164107 NM_001164108 NM_019955
RefSeq (білок)	NP_006862	NP_001157579 NP_001157580 NP_064339
Локус (UCSC)	Хр. 14: 24.34 – 24.34 Mb	Хр. 14: 56.02 – 56.03 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RIPK3 (англ. Receptor interacting serine/threonine kinase 3) — білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 518 амінокислот, а молекулярна маса — 56 887.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSCVKLWPSG		APAPLVSIEE		LENQELVGKG		GFGTVFRAQH		RKWGYDVAVK
IVNSKAISRE		VKAMASLDNE		FVLRLEGVIE		KVNWDQDPKP		ALVTKFMENG
SLSGLLQSQC		PRPWPLLCRL		LKEVVLGMFY		LHDQNPVLLH		RDLKPSNVLL
DPELHVKLAD		FGLSTFQGGS		QSGTGSGEPG		GTLGYLAPEL		FVNVNRKAST
ASDVYSFGIL		MWAVLAGREV		ELPTEPSLVY		EAVCNRQNRP		SLAELPQAGP
ETPGLEGLKE		LMQLCWSSEP		KDRPSFQECL		PKTDEVFQMV		ENNMNAAVST
VKDFLSQLRS		SNRRFSIPES		GQGGTEMDGF		RRTIENQHSR		NDVMVSEWLN
KLNLEEPPSS		VPKKCPSLTK		RSRAQEEQVP		QAWTAGTSSD		SMAQPPQTPE
TSTFRNQMPS		PTSTGTPSPG		PRGNQGAERQ		GMNWSCRTPE		PNPVTGRPLV
NIYNCSGVQV		GDNNYLTMQQ		TTALPTWGLA		PSGKGRGLQH		PPPVGSQEGP
KDPEAWSRPQ		GWYNHSGK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, серин/треонінових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, мембрані, мітохондрії.

Див. також

• Хромосома 14

Література

• Yang Y., Hu W., Feng S., Ma J., Wu M. (2005). RIP3 beta and RIP3 gamma, two novel splice variants of receptor-interacting protein 3 (RIP3), downregulate RIP3-induced apoptosis. Biochem. Biophys. Res. Commun. 332: 181—187. PMID 15896315 DOI:10.1016/j.bbrc.2005.04.114
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Sun X., Yin J., Starovasnik M.A., Fairbrother W.J., Dixit V.M. (2002). Identification of a novel homotypic interaction motif required for the phosphorylation of receptor-interacting protein (RIP) by RIP3. J. Biol. Chem. 277: 9505—9511. PMID 11734559 DOI:10.1074/jbc.M109488200
• Vandenabeele P., Declercq W., Van Herreweghe F., Vanden Berghe T. (2010). The role of the kinases RIP1 and RIP3 in TNF-induced necrosis. Sci. Signal. 3: RE4—RE4. PMID 20354226 DOI:10.1126/scisignal.3115re4
• Wang Z., Jiang H., Chen S., Du F., Wang X. (2012). The mitochondrial phosphatase PGAM5 functions at the convergence point of multiple necrotic death pathways. Cell. 148: 228—243. PMID 22265414 DOI:10.1016/j.cell.2011.11.030