ATG4C

ATG4C
Ідентифікатори
Символи	ATG4C, APG4-C, APG4C, AUTL1, AUTL3, autophagy related 4C cysteine peptidase, HsAPG4C
Зовнішні ІД	OMIM: 611339 MGI: 2651854 HomoloGene: 56296 GeneCards: ATG4C
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0070122 peptidase activity • cysteine-type endopeptidase activity • cysteine-type peptidase activity • hydrolase activity Клітинна компонента • цитоплазма • extracellular region • гіалоплазма Біологічний процес • автофагія • protein transport • autophagy of nucleus • C-terminal protein lipidation • protein delipidation • autophagy of mitochondrion • autophagosome assembly • протеоліз • protein targeting to membrane Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	84938	242557
Ensembl	ENSG00000125703	ENSMUSG00000028550
UniProt	Q96DT6	Q811C2
RefSeq (мРНК)	NM_032852 NM_178221	NM_001145967 NM_175029
RefSeq (білок)	NP_116241 NP_835739	NP_001139439 NP_778194
Локус (UCSC)	Хр. 1: 62.78 – 62.87 Mb	Хр. 4: 99.08 – 99.15 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

ATG4C (англ. Autophagy related 4C cysteine peptidase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на 1-й хромосомі. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 458 амінокислот, а молекулярна маса — 52 497.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEATGTDEVD		KLKTKFISAW		NNMKYSWVLK		TKTYFSRNSP		VLLLGKCYHF
KYEDEDKTLP		AESGCTIEDH		VIAGNVEEFR		KDFISRIWLT		YREEFPQIEG
SALTTDCGWG		CTLRTGQMLL		AQGLILHFLG		RAWTWPDALN		IENSDSESWT
SHTVKKFTAS		FEASLSGERE		FKTPTISLKE		TIGKYSDDHE		MRNEVYHRKI
ISWFGDSPLA		LFGLHQLIEY		GKKSGKKAGD		WYGPAVVAHI		LRKAVEEARH
PDLQGITIYV		AQDCTVYNSD		VIDKQSASMT		SDNADDKAVI		ILVPVRLGGE
RTNTDYLEFV		KGILSLEYCV		GIIGGKPKQS		YYFAGFQDDS		LIYMDPHYCQ
SFVDVSIKDF		PLETFHCPSP		KKMSFRKMDP		SCTIGFYCRN		VQDFKRASEE
ITKMLKFSSK		EKYPLFTFVN		GHSRDYDFTS		TTTNEEDLFS		EDEKKQLKRF
STEEFVLL

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, тіолових протеаз, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, убіквітинування білків, автофагія, ацетилювання. Локалізований у цитоплазмі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 1