Heikkinen kwam in de periode 1989-1994 in totaal 51 keer uit voor de nationale ploeg van Finland, en maakte daarin één doelpunt. Hij maakte zijn debuut onder leiding van bondscoach Jukka Vakkila op 11 januari1989 in de vriendschappelijke uitwedstrijd tegen Egypte (2-2) in El-Mahalla. Zijn eerste en enige interlandtreffer maakte hij op 13 april1993 in de vriendschappelijke uitwedstrijd tegen Polen, toen hij in de 84ste minuut de eindstand bepaalde op 2-1.