Questa voce raccoglie le informazioni riguardanti la Pro Patria et Libertate Unione degli Sports Bustesi nelle competizioni ufficiali della stagione 1939-1940.
Nella stagione 1939-1940 la Pro Patria disputa il girone C del campionato di Serie C, con 38 punti arriva terza, a sole due lunghezze dal Varese che vince il torneo con 40 punti e ad un punto dal Seregno. Nel girone B di finale il Varese non riuscirà a conquistare la Serie B, superato dal Vicenza e dalla Maceratese.
In casa bustocca il presidente Giovanni Calcaterra riporta in cabina di regia l'allenatore Imre János Bekey. Rientra dalla SIAI Marchetti di Sesto Calende all'ovile Aldo Borsani portando con sé gli attaccanti Giovanni Guidi e Ermelindo Magugliani, si mette in mostra Alfonso Borra espressione del settore giovanile, mentre diventa sempre più concreto in attacco Arnaldo Fasoli che con 17 reti sarà l'uomo della provvidenza nel campionato dei biancoblù. Fino a metà campionato la Pro Patria veleggia in testa alla classifica, poi nella parte centrale del girone di ritorno viene raggiunta e superata dal Varese e dal Seregno, risulterà comunque decisiva per definire la classifica la sconfitta (5-3) di Domodossola nell'ultima di campionato.[1]