Idi na sadržaj

TBRG4

S Wikipedije, slobodne enciklopedije
TBRG4
Identifikatori
AliasiTBRG4
Vanjski ID-jeviOMIM: 611325 MGI: 1100868 HomoloGene: 31259 GeneCards: TBRG4
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 7 (čovjek)
Hrom.Hromosom 7 (čovjek)[1]
Hromosom 7 (čovjek)
Genomska lokacija za TBRG4
Genomska lokacija za TBRG4
Bend7p13Početak45,100,100 bp[1]
Kraj45,112,047 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 11 (miš)
Hrom.Hromosom 11 (miš)[2]
Hromosom 11 (miš)
Genomska lokacija za TBRG4
Genomska lokacija za TBRG4
Bend11|11 A1Početak6,565,598 bp[2]
Kraj6,576,067 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije


Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija protein kinase activity
GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
vezivanje sa RNK
Ćelijska komponenta mitohondrija
mitochondrial matrix
Biološki proces Ćelijsko disanje
protein phosphorylation
positive regulation of cell population proliferation
mRNA metabolic process
regulation of mitochondrial mRNA stability
mitochondrial mRNA processing
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_199122
NM_001261834
NM_004749
NM_030900

NM_001130457
NM_134011
NM_001362713
NM_001362714
NM_001362715

NM_001362716

RefSeq (bjelančevina)

NP_001248763
NP_004740
NP_112162
NP_954573

NP_001123929
NP_598772
NP_001349642
NP_001349643
NP_001349644

NP_001349645

Lokacija (UCSC)Chr 7: 45.1 – 45.11 MbChr 11: 6.57 – 6.58 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Beta regulator 4 transformirajućeg faktora rasta (TBRG4), poznat i kao protein za obnavljanje progresije ćelijskog ciklusa 2 (CPR2) i protein 4 koji sadrži domen FAST-kinaze (FASTKD4), je protein koji je kod ljudi kodiran genom TBRG4 na hromosomu 7.[5][6][7] Ovaj protein je dio porodice FASTKD, koja je poznata po regulaciji energetske ravnoteže mitohondrija pod stresom i progresije ćelijskog ciklusa.[8][9] TBRG4 je uključen u proliferaciju ćelija u hematopoezi i multipli mijelom.[10][11]

Aminokiselinska sekvenca

[uredi | uredi izvor]

Dužina polipeptidnog lanca je 631 aminokiselina, а molekulska težina 70.738 Da.[12]

1020304050
MAAHLVKRCTCLLREAARQAPAMAPVGRLRLAWVAHKTLTSSATSPISHL
PGSLMEPVEKERASTPYIEKQVDHLIKKATRPEELLELLGGSHDLDSNQA
AMVLIRLSHLLSEKPEDKGLLIQDAHFHQLLCLLNSQIASVWHGTLSKLL
GSLYALGIPKASKELQSVEQEVRWRMRKLKYKHLAFLAESCATLSQEQHS
QELLAELLTHLERRWTEIEDSHTLVTVMMKVGHLSEPLMNRLEDKCLELV
EHFGPNELRKVLVMLAAQSRRSVPLLRAISYHLVQKPFSLTKDVLLDVAY
AYGKLSFHQTQVSQRLATDLLSLMPSLTSGEVAHCAKSFALLKWLSLPLF
EAFAQHVLNRAQDITLPHLCSVLLAFARLNFHPDQEDQFFSLVHEKLGSE
LPGLEPALQVDLVWALCVLQQAREAELQAVLHPEFHIQFLGGKSQKDQNT
FQKLLHINATALLEYPEYSGPLLPASAVAPGPSALDRKVTPLQKELQETL
KGLLGSADKGSLEVATQYGWVLDAEVLLDSDGEFLPVRDFVAPHLAQPTG
SQSPPPGSKRLAFLRWEFPNFNSRSKDLLGRFVLARRHIVAAGFLIVDVP
FYEWLELKSEWQKGAYLKDKMRKAVAEELAK

Struktura

[uredi | uredi izvor]

TBRG4 ima strukturne karakteristike porodice FASTKD, uključujući N-terminal mitohondrijski ciljani domen i tri C-terminalna domena: dva domena slična FAST-kinazi (FAST_1 i FAST_2) i RNK-vezujući domen (RAP).[8][9] Mitohondrijsko ciljno područje usmjerava TBRG4 na import u mitohondrije. Iako su funkcije C-terminalnih domena nepoznate, RAP vjerovatno veže RNK tokom trans-spajanja.[8] TBRG4 također sadrži više navodnih domena leucinskog zatvarača.[6]

Funkcija

[uredi | uredi izvor]

Kao član porodice FASTKD, TBRG4 nalazi se u mitohondrijama, kako bi modulirao njihovu energetsku ravnotežu, posebno u uslovima stresa. Iako je sveprisutno ieksprimiran u svim tkivima, TBRG4 se obilnije pojavljuje u skeletnim mišićima, srčanom mišiću i drugim tkivima obogaćenim mitohondrijama.[8] TBRG4 se također lokalizira u koštanoj srži (BM), gdje funkcionira u hematopoezi, inducirajući lučenje IL-6 i VEGF, koji zatim stimuliraju proliferaciju ćelija i angiogenezu. Međutim, inhibira izlučivanje imunoglobulina normalnim B-ćelijama.[10]

Klinički značaj

[uredi | uredi izvor]

Učešće TBRG4 u hematopoezi povezuje ga s multiplim mijelomom (MM), što proizlazi iz maligne proliferacije plazmatskih ćelija u koštanoj srži.[10] Visoka ekspresija TBRG4 povezana je sa poboljšanom proliferacijom ćelija i lošijim ishodom; stoga snižena regulacija njegove ekspresije može doprinijeti smanjenju rasta tumora, zaustavljanjem progresije ćelijskog ciklusa.[11]

Reference

[uredi | uredi izvor]
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000136270 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000000384 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ UniProt: Q969Z0
  6. ^ a b Edwards MC, Liegeois N, Horecka J, DePinho RA, Sprague GF, Tyers M, Elledge SJ (Nov 1997). "Human CPR (cell cycle progression restoration) genes impart a Far- phenotype on yeast cells". Genetics. 147 (3): 1063–76. PMC 1208234. PMID 9383053.
  7. ^ "Entrez Gene: TBRG4 transforming growth factor beta regulator 4".
  8. ^ a b c d Simarro M, Gimenez-Cassina A, Kedersha N, Lazaro JB, Adelmant GO, Marto JA, Rhee K, Tisdale S, Danial N, Benarafa C, Orduña A, Anderson P (Oct 2010). "Fast kinase domain-containing protein 3 is a mitochondrial protein essential for cellular respiration". Biochemical and Biophysical Research Communications. 401 (3): 440–6. doi:10.1016/j.bbrc.2010.09.075. PMC 2963690. PMID 20869947.
  9. ^ a b Yeung KT, Das S, Zhang J, Lomniczi A, Ojeda SR, Xu CF, Neubert TA, Samuels HH (Jun 2011). "A novel transcription complex that selectively modulates apoptosis of breast cancer cells through regulation of FASTKD2". Molecular and Cellular Biology. 31 (11): 2287–98. doi:10.1128/MCB.01381-10. PMC 3133243. PMID 21444724.
  10. ^ a b c Sevcikova S, Paszekova H, Besse L, Sedlarikova L, Kubaczkova V, Almasi M, Pour L, Hajek R (Apr 2015). "Extramedullary relapse of multiple myeloma defined as the highest risk group based on deregulated gene expression data" (PDF). Biomedical Papers of the Medical Faculty of the University Palacký, Olomouc, Czechoslovakia. 159 (2): 288–93. doi:10.5507/bp.2015.014. PMID 25877407.
  11. ^ a b Sarasquete ME, Martínez-López J, Chillón MC, Alcoceba M, Corchete LA, Paiva B, Puig N, Sebastián E, Jiménez C, Mateos MV, Oriol A, Rosiñol L, Palomera L, Teruel AI, González Y, Lahuerta JJ, Bladé J, Gutiérrez NC, Fernández-Redondo E, González M, San Miguel JF, García-Sanz R (Oct 2013). "Evaluating gene expression profiling by quantitative polymerase chain reaction to develop a clinically feasible test for outcome prediction in multiple myeloma". British Journal of Haematology. 163 (2): 223–34. doi:10.1111/bjh.12519. PMID 23952215. S2CID 207081358.
  12. ^ "UniProt, Q969Z0" (jezik: engleski). Pristupljeno 29. 9. 2021.

Dopunska literatura

[uredi | uredi izvor]