Hemokinoliki protein TAFA-5 jest protein koji je kod ljudi kodiran genom TAFA5 sa hromosoma 22.[5][6]

TAFA5
Identifikatori
AliasiTAFA5
Vanjski ID-jeviOMIM: 617499 MGI: 2146182 HomoloGene: 22888 GeneCards: TAFA5
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 22 (čovjek)
Hrom.Hromosom 22 (čovjek)[1]
Hromosom 22 (čovjek)
Genomska lokacija za TAFA5
Genomska lokacija za TAFA5
Bend22q13.32Početak48,489,553 bp[1]
Kraj48,850,912 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 15 (miš)
Hrom.Hromosom 15 (miš)[2]
Hromosom 15 (miš)
Genomska lokacija za TAFA5
Genomska lokacija za TAFA5
Bend15|15 E3Početak87,428,500 bp[2]
Kraj87,643,565 bp[2]
Ontologija gena
Molekularna funkcija cytokine activity
Ćelijska komponenta membrana
integral component of membrane
extracellular region
Vanćelijsko
Biološki proces regulation of signaling receptor activity
GO:0072468 Transdukcija signala
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_015381
NM_001082967

NM_001252310
NM_134096

RefSeq (bjelančevina)

NP_001076436
NP_056196

NP_001239239
NP_598857

Lokacija (UCSC)Chr 22: 48.49 – 48.85 MbChr 15: 87.43 – 87.64 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Aminokiselinska sekvenca

uredi

Dužina polipeptidnog lanca je 132 aminokiseline, a molekulska težina 14.301 Da.[6]

1020304050
MAPSPRTGSRQDATALPSMSSTFWAFMILASLLIAYCSQLAAGTCEIVTL
DRDSSQPRRTIARQTARCACRKGQIAGTTRARPACVDARIIKTKQWCDML
PCLEGEGCDLLINRSGWTCTQPGGRIKTTTVS

Funkcija

uredi

Ovaj gen je član porodice TAFA koja se sastoji od pet visoko homolognih gena koji kodiraju male sekretne proteine. Ovi proteini sadrže konzervirane cisteinske ostatke na fiksnim pozicijama i udaljeni su sa CCL3, članom porodice CC-hemokina. TAFA proteini su pretežno eksprimirani u specifičnim regijama mozga i pretpostavlja se da funkcionišu kao hemokini ili neurokini, specifični za mozak, koji djeluju kao regulatori imunskih i nervnih ćelija.[6]

Reference

uredi
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000219438 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000054863 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Tom Tang Y, Emtage P, Funk WD, Hu T, Arterburn M, Park EE, Rupp F (Mar 2004). "TAFA: a novel secreted family with conserved cysteine residues and restricted expression in the brain". Genomics. 83 (4): 727–34. doi:10.1016/j.ygeno.2003.10.006. PMID 15028294.
  6. ^ a b c "TAFA5 TAFA chemokine like family member 5 [ Homo sapiens (human) ]". National Center for Biotechnology Information. Pristupljeno 11 August 2019.

Dopunska literatura

uredi