Koaktozinoliki protein (COTL1 ili CLP) je protein koji je kod ljudi kodiran genom COTL1.[5][6][7][8]

COTL1
Dostupne strukture
PDBPretraga ortologa: PDBe RCSB
Spisak PDB ID kodova

1T2L, 1T3X, 1T3Y, 1TMW, 1VFQ, 1WNJ

Identifikatori
AliasiCOTL1
Vanjski ID-jeviOMIM: 606748 MGI: 1919292 HomoloGene: 10898 GeneCards: COTL1
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 16 (čovjek)
Hrom.Hromosom 16 (čovjek)[1]
Hromosom 16 (čovjek)
Genomska lokacija za COTL1
Genomska lokacija za COTL1
Bend16q24.1Početak84,565,596 bp[1]
Kraj84,618,078 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 8 (miš)
Hrom.Hromosom 8 (miš)[2]
Hromosom 8 (miš)
Genomska lokacija za COTL1
Genomska lokacija za COTL1
Bend8|8 E1Početak120,535,961 bp[2]
Kraj120,567,283 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije


Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija vezivanje enzima
GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
actin binding
Ćelijska komponenta citoplazma
Egzosom
citoskelet
intracellular anatomical structure
jedro
extracellular region
secretory granule lumen
ficolin-1-rich granule lumen
Biološki proces defense response to fungus
neutrophil degranulation
GO:0022610 biološki proces
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_021149

NM_028071

RefSeq (bjelančevina)

NP_066972

NP_082347

Lokacija (UCSC)Chr 16: 84.57 – 84.62 MbChr 8: 120.54 – 120.57 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Aktinski citoskelet regulišu brojni proteini koji vežu aktine, uključujući koaktozin, protein koji je prvi put identificiran u kalupu sluzi. CLP stupa u interakciju s 5-lipoksigenazom (5LO, ili ALOX5), proteinom od 78 kD koji se eksprimira u različitim tipovima leukocita, uključujući dendritske ćelije, jer je prvi enzim u biosintezi leukotriena (Provost et al., 1999).

Aminokiselinska sekvenca

uredi

Dužina polipeptidnog lanca je 142 aminokiseline, a molekulska težina 15.945 Da.[9]

1020304050
MATKIDKEACRAAYNLVRDDGSAVIWVTFKYDGSTIVPGEQGAEYQHFIQ
QCTDDVRLFAFVRFTTGDAMSKRSKFALITWIGENVSGLQRAKTGTDKTL
VKEVVQNFAKEFVISDRKELEEDFIKSELKKAGGANYDAQTE
Simboli

Funkcija

uredi

Ovaj gen kodira jedan od brojnih proteina koji vežu aktine za reguliranje aktinskog citoskeleta. Nastali protein veže F-aktin, a također djeluje i u stabiliziranju 5-lipoksigenaza (ALOX5). Iako je zabilježeno da se ovaj gen mapira na hromosomu 17 u regiji Smith-Magenisovog sindroma, najbolje poravnanje mu je na hromosomu 16. U regiji Smith-Magenisovog sindroma nalaze se dva srodna pseudogena.[8]

Dvohibridnom analizom kvasca, Provost et al. (2001) pokazali su da CLP stupa u interakciju s F-aktinom, a samo privremeno u interakciju s monomernim G-aktinom. Imunofluorescentna mikroskopija pokazala je kolokalizaciju CLP-a sa stresnim vlaknima F-aktina, neovisno o kalciju. Analiza mutacije utvrdila je da je lys75, ali ne lys130 i lys131, presudan za CLP interakciju s aktinom. Pokazali su da je Lys131 odgovoran za vezanje CLP-a na 5LO.[10]

Doucet et al. (2002) našli su da mišji Clp veže 5LO pri visokim koncentracijama soli i F-aktin pri niskim koncentracijama soli na pH osjetljivom i neovisnom o kalciju. 1. Koristeći HPLC analizu, Rakonjac et al. (2006) dokazali su da CLP može poslužiti kao skela za aktivnost 5LO izazvanu Ca (2 +), slično membranama. U prisustvu fosfatidilholina (membrane), CLP je indukovao povećano stvaranje LTA4 za 5LO. CLP je takođe povećao odnos 5-HETE i 5-HPETE. Analiza mutacije pokazala je da su za ove efekte potrebni trp13, trp75 i trp102 u petljama vezanja liganda u beta 5LO sendviču. Western blot analiza pokazala je da je stimulacija polimorfojedarnih ćelija sa Ca (2+) ionoforom izazvala translokaciju CLP i 5LO iz citosola u ćelijsko jedro. Zaključili su da je CLP relevantan za stvaranje 5LO proizvoda, kao što je 5-HETE, u citosolu različitih tipova ćelija i djelujući u kompleksu zajedno s 5LO i membranama povećava kapacitet 5LO za biosintezu leukotriena.[11]

Kloniranje i ekspresija

uredi

Analizom kozmida iz regije uz bok sekvence za Smith–Magenisov sindrom (SMS), delecije na hromosomu 17, praćena ispitivanjem biblioteke cDNK posteljica, Chen et al. (1997) dobili su cDNK koja kodira CLP. Izvedeni protein sa 142 aminokiseline je 75% sličan koaktozinu. Northern blot analizom otkriven je transkript od 2,0 kb u placenti, jetri, plućima i bubrezima. Koristeći 2-hibridni zaslon kvasca plućne cDNK biblioteke s 5LO kao sondom, Provost et al. (1999) izolirali su cDNK koje kodiraju CLP. Analiza imunoblota pokazala je ekspresiju proteina od 16 kD, u skladu sa predviđenom veličinom.[12] Doucet et al. (2002) klonirani mišji Clp, koji je 95% identičan ljudskom CLP.

Analizom Northern blot-a, Provost et al. (2001) pokazali su da se transkript CLP od 2,0 kb pretežno eksprimira u placenti, plućima i bubrezima, a sa nižim nivoima u mozgu, jetri i gušterači. U srcu otkrili su dodatni opseg od 1,4 kb. U imunskim tkivima, najveća ekspresija CLP bila je u leukocitima periferne krvi, sa nižim nivoima u slezeni i limfnim čvorovima. Western blot analizom otkrivena je ekspresija CLP u nejedarnoj frakciji neutrofila.[13]

Mapiranje

uredi

Chen et al. (1997) lokalizirali su CLP gen na svakom kraju regije za deleciju SMS-a na hromosomu 17p11.2, hibridnim zračenjem i Southern blot analizama. Primijetili su homologne sekvence na hromosomima 15, 16 i Y.[14]

Međutim, Gross (2011) mapirao je gen COTL1 ns hromosomu 16, regija 16q24.1, na temelu poravnavanja sekvence COTL1 (GenBank BC010039) sa genomskom sekvencom (GRCh37).

Interakcije

uredi

Pokazano je da COTL1 komunicira sa ALOX5.[15] ALOX5 je prvi enzim u metabolizmu arahidonske kiseline do niza biološki važnih ćelijskih sisnalizacijskih sredstava:

ALOX5 takođe doprinosi metabolizmu arahidonske kiseline i drugih polinezasićenih masnih kiselina u agense koji blokiraju upale i alergijske reakcije, specijalizirani posrednici za razrješavanje lipoksina i resovinske potklase. Na osnovu studija in vitro, COTL1 služi za stabilizaciju ALOX5, djelujući kao šaperon ili skela, kako bi spriječio inaktivaciju enzima i time promovirao njegovu metaboličku aktivnost.[16]

Reference

uredi
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000103187 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000031827 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Provost P, Samuelsson B, Rådmark O (Apr 1999). "Interaction of 5-lipoxygenase with cellular proteins". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 96 (5): 1881–5. doi:10.1073/pnas.96.5.1881. PMC 26705. PMID 10051563.
  6. ^ Chen KS, Manian P, Koeuth T, Potocki L, Zhao Q, Chinault AC, Lee CC, Lupski JR (Nov 1997). "Homologous recombination of a flanking repeat gene cluster is a mechanism for a common contiguous gene deletion syndrome". Nat. Genet. 17 (2): 154–63. doi:10.1038/ng1097-154. PMID 9326934. S2CID 27742511.
  7. ^ Rakonjac M, Fischer L, Provost P, Werz O, Steinhilber D, Samuelsson B, Rådmark O (Sep 2006). "Coactosin-like protein supports 5-lipoxygenase enzyme activity and up-regulates leukotriene A4 production". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 103 (35): 13150–5. doi:10.1073/pnas.0605150103. PMC 1559768. PMID 16924104.
  8. ^ a b "Entrez Gene: COTL1 coactosin-like 1 (Dictyostelium)".
  9. ^ "UniProt, Q14019". Pristupljeno 4. 7. 2021.
  10. ^ Provost, P., Doucet, J., Hammarberg, T., Gerisch, G., Samuelsson, B., Radmark, O. 5-lipoxygenase interacts with coactosin-like protein. J. Biol. Chem. 276: 16520-16527, 2001. [PubMed]: 11297527
  11. ^ Rakonjac, M., Fischer, L., Provost, P., Werz, O., Steinhilber, D., Samuelsson, B., Radmark, O. Coactosin-like protein supports 5-lipoxygenase enzyme activity and up-regulates leukotriene A(4) production. Proc. Nat. Acad. Sci. 103: 13150-13155, 2006. [PubMed]: 16924104.
  12. ^ Provost, P., Doucet, J., Stock, A., Gerisch, G., Samuelsson, B., Radmark, O. Coactosin-like protein, a human F-actin-binding protein: critical role of lysine-75. Biochem. J. 359: 255-263, 2001. PubMed: 11583571
  13. ^ Doucet, J., Provost, P., Samuelsson, B., Radmark, O. Molecular cloning and functional characterization of mouse coactosin-like protein. Biochem. Biophys. Res. Commun. 290: 783-789, 2002. [PubMed]: 11785969
  14. ^ Chen, K.-S., Manian, P., Koeuth, T., Potocki, L., Zhao, Q., Chinault, A. C., Lee, C. C., Lupski, J. R. Homologous recombination of a flanking repeat gene cluster is a mechanism for a common contiguous gene deletion syndrome. Nature Genet. 17: 154-163, 1997. PubMed: 9326934
  15. ^ Provost P, Doucet J, Hammarberg T, Gerisch G, Samuelsson B, Radmark O (maj 2001). "5-Lipoxygenase interacts with coactosin-like protein". J. Biol. Chem. 276 (19): 16520–7. doi:10.1074/jbc.M011205200. PMID 11297527.
  16. ^ Anwar Y, Sabir JS, Qureshi MI, Saini KS (2014). "5-lipoxygenase: a promising drug target against inflammatory diseases-biochemical and pharmacological regulation". Current Drug Targets. 15 (4): 410–22. doi:10.2174/1389450114666131209110745. PMID 24313690.

Dopunska literatura

uredi

Vanjski linkovi

uredi