SNUPN: відмінності між версіями

SNUPN
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1XK5, 2P8Q, 2Q5D, 2QNA, 3GB8, 3GJX, 3LWW, 3NBY, 3NBZ, 3NC0
Ідентифікатори
Символи	SNUPN, KPNBL, RNUT1, Snurportin1, snurportin 1
Зовнішні ІД	OMIM: 607902 MGI: 1913319 HomoloGene: 4166 GeneCards: SNUPN
Онтологія гена
Молекулярна функція	• RNA cap binding; • RNA binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • nuclear import signal receptor activity;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • ядерна пора; • клітинне ядро; • внутрішньоклітинний;
Біологічний процес	• snRNA import into nucleus; • protein import into nucleus; • spliceosomal snRNP assembly; • import into nucleus;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	10073
	66069
	ENSG00000169371
	ENSMUSG00000055334
	O95149
	Q80W37
	NM_005701; NM_001042581; NM_001042588
	NM_178374
	NP_001036046; NP_001036053; NP_005692
	NP_848461
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

Інтерактивний перегляд історії

[перевірена версія]

← Попереднє редагування Наступне редагування →

Вилучено вміст Додано вміст

ВізуальнийВікірозмітка

Лінійно

Версія за 03:33, 13 травня 2022

SNUPN (англ. Snurportin 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 360 амінокислот, а молекулярна маса — 41 143^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEELSQALAS	SFSVSQDLNS	TAAPHPRLSQ	YKSKYSSLEQ	SERRRRLLEL
QKSKRLDYVN	HARRLAEDDW	TGMESEEENK	KDDEEMDIDT	VKKLPKHYAN
QLMLSEWLID	VPSDLGQEWI	VVVCPVGKRA	LIVASRGSTS	AYTKSGYCVN
RFSSLLPGGN	RRNSTAKDYT	ILDCIYNEVN	QTYYVLDVMC	WRGHPFYDCQ
TDFRFYWMHS	KLPEEEGLGE	KTKLNPFKFV	GLKNFPCTPE	SLCDVLSMDF
PFEVDGLLFY	HKQTHYSPGS	TPLVGWLRPY	MVSDVLGVAV	PAGPLTTKPD
YAGHQLQQIM	EHKKSQKEGM	KEKLTHKASE	NGHYELEHLS	TPKLKGSSHS
PDHPGCLMEN

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
Narayanan U., Ospina J.K., Frey M.R., Hebert M.D., Matera A.G. (2002). SMN, the spinal muscular atrophy protein, forms a pre-import snRNP complex with snurportin1 and importin beta. Hum. Mol. Genet. 11: 1785—1795. PMID 12095920 DOI:10.1093/hmg/11.15.1785
Strasser A., Dickmanns A., Luehrmann R., Ficner R. (2005). Structural basis for m3G-cap-mediated nuclear import of spliceosomal UsnRNPs by snurportin1. EMBO J. 24: 2235—2243. PMID 15920472 DOI:10.1038/sj.emboj.7600701
Mitrousis G., Olia A.S., Walker-Kopp N., Cingolani G. (2008). Molecular basis for the recognition of snurportin 1 by importin beta. J. Biol. Chem. 283: 7877—7884. PMID 18187419 DOI:10.1074/jbc.M709093200
Bhardwaj A., Cingolani G. (2010). Conformational selection in the recognition of the snurportin importin beta binding domain by importin beta. Biochemistry. 49: 5042—5047. PMID 20476751 DOI:10.1021/bi100292y

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14245 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
↑ UniProt, O95149 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 15

Це незавершена стаття про білки.
Ви можете допомогти проєкту, виправивши або дописавши її.

Портал «Біологія» Портал «Хімія»

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14245 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.

[UniProt-4] UniProt, O95149 (англ.) . Архів оригіналу за 8 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

@@ Рядок 1: / Рядок 1: @@
 {{Картка гена}}
-'''SNUPN''' ({{lang-en|Snurportin 1}}) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.<ref name="HGNC">{{cite web|url=http://www.genenames.org/cgi-bin/gene_symbol_report?hgnc_id=HGNC:14245 |title=HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14245 |language=англ. |accessdate=11 вересня 2017}}</ref> Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 360 [[Амінокислоти|амінокислот]], а [[молекулярна маса]] — 41 143<ref name="UniProt">{{cite web|url=http://www.uniprot.org/uniprot/O95149#sequences |title=UniProt, O95149 |language=англ. |accessdate=11 вересня 2017}}</ref>.
+'''SNUPN''' ({{lang-en|Snurportin 1}}) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми.<ref name="HGNC">{{cite web|url=http://www.genenames.org/cgi-bin/gene_symbol_report?hgnc_id=HGNC:14245 |title=HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14245 |language=англ. |accessdate=11 вересня 2017}}</ref> Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 360 [[Амінокислоти|амінокислот]], а [[молекулярна маса]] — 41 143<ref name="UniProt">{{cite web |url=http://www.uniprot.org/uniprot/O95149#sequences |title=UniProt, O95149 |language=англ. |accessdate=11 вересня 2017 |archive-date=8 серпня 2017 |archive-url=https://web.archive.org/web/20170808214030/http://www.uniprot.org/uniprot/O95149#sequences }}</ref>.
 {{hidden

SNUPN: відмінності між версіями

Версія за 03:33, 13 травня 2022

Література

Примітки

Див. також

Навігаційне меню

Пошук