XПБ

Identifikatori
Simboli	ERCC3; BTF2; GTF2H; RAD25; TFIIH; XPB
Vanjski ID	OMIM: 133510 MGI: 95414 HomoloGene: 96 GeneCards: ERCC3 Gene
EC broj	3.6.4.12
Ontologija gena
Molekularna funkcija	• nukleotidno vezivanje; • DNK vezivanje; • vezivanje oštećene DNK; • aktivnost ATP-zavisne DNK helikaze; • aktivnost helikaze; • aktivnost proteinske kinaze; • proteinsko vezivanje; • ATP vezivanje; • GTP vezivanje; • vezivanje proteinskog C-терминуса; • активност ДНК зависне АТПазе; • транскрипциони фактор везивања; • активност карбокси терминалног домена киназе РНК полимеразе II; • активност хидролазе; • активност АТПазе; • дАТП везивање; • пептидно везивање;
Целуларна компонента	• ССЛ2-језгро ТФИИХ комплекс; • нуклеус; • нуклеоплазма; • холо ТФИИХ комплекс;
Биолошки процес	• контролна тачка ћелијског циклуса; • поправка исецањем нуклеотида, одвијање ДНК дуплекса; • респонс на хипоксију; • АТП катаболички процес; • промена ДНК топологије; • ДНК поправка; • поправка исецањем нуклеода спрегнута са транскрипцијом; • поправка исецањем нуклеотида; • регулација транскрипције, ДНК-зависна; • транскрипција са промотера РНК полимеразе I;
Преглед РНК изражавања
	подаци
Ортолози
Врста	Човек
Ентрез	2071
Енсембл	ЕНСГ00000163161
УниПрот	П19447
РефСеq (мРНА)	НМ_000122.1
РефСеq (протеин)	НП_000113.1
Локација (УЦСЦ)	Цхр 2:; 128.01 - 128.05 Мб
ПубМед претрага	[1]

XPB (Xeroderma Pigmentosum B) је АТП зависна људска ДНК хеликаза која је део комплекса ТФИИХ транскрипционог фактора. 3Д структура XPB хомолога је кристалографски.^[1]

Функција

XPB учествује у нормалној базалној транскрипцији, транскрипционо спрегнутој поправци (ТЦР), и поправци исецањем нуклеотида (NER). Показано јед а пречишћени XPB развија ДНК у 3’-5’ правцу.

Интеракције

XPB формира интеракције са XPC,^[2] BCR геном,^[3] ERCC2,^[4]^[5]^[6]^[7] P53,^[8] GTF2H2,^[4]^[5] GTF2H1,^[4]^[5]^[9] GTF2H5,^[4] циклин зависном киназом,^[4]^[9]^[10] PSMC5^[11] и GTF2H4.^[4]^[5]

Литература

КТ, Јеанг (1998). „Тат, Тат-ассоциатед кинасе, анд трансцриптион.”. Ј. Биомед. Сци. 5 (1): 24—7. ПМИД 9570510. дои:10.1007/БФ02253352.
Yанкулов К, Бентлеy D (1998). „Трансцриптионал цонтрол: Тат цофацторс анд трансцриптионал елонгатион.”. Цурр. Биол. 8 (13): Р447—9. ПМИД 9651670. дои:10.1016/С0960-9822(98)70289-1.
Цлеавер ЈЕ, Тхомпсон ЛХ, Рицхардсон АС, Статес ЈЦ (1999). „А суммарy оф мутатионс ин тхе УВ-сенситиве дисордерс: xеродерма пигментосум, Цоцкаyне сyндроме, анд трицхотхиодyстропхy.”. Хум. Мутат. 14 (1): 9—22. ПМИД 10447254. дои:10.1002/(СИЦИ)1098-1004(1999)14:1<9::АИД-ХУМУ2>3.0.ЦО;2-6.
L, Ма; Wееда Г; АГ, Јоцхемсен; et al. (1992). „Молецулар анд фунцтионал аналyсис оф тхе XПБЦ/ЕРЦЦ-3 промотер: трансцриптион ацтивитy ис депендент он тхе интегритy оф ан Сп1-биндинг сите.”. Нуцлеиц Ацидс Рес. 20 (2): 217—24. ПМЦ 310357  . ПМИД 1741247. дои:10.1093/нар/20.2.217.
Г, Wееда; Wиегант Ј; ван дер Плоег M; et al. (1991). „Лоцализатион оф тхе xеродерма пигментосум гроуп Б-цоррецтинг гене ЕРЦЦ3 то хуман цхромосоме 2q21.”. Геномицс. 10 (4): 1035—1040. ПМИД 1916809. дои:10.1016/0888-7543(91)90195-К.
Г, Wееда; Ма ЛБ; ван Хам РЦ; et al. (1991). „Струцтуре анд еxпрессион оф тхе хуман XПБЦ/ЕРЦЦ-3 гене инволвед ин ДНА репаир дисордерс xеродерма пигментосум анд Цоцкаyне'с сyндроме.”. Нуцлеиц Ацидс Рес. 19 (22): 6301—6308. ПМЦ 329143  . ПМИД 1956789. дои:10.1093/нар/19.22.6301.
Г, Wееда; ван Хам РЦ; Р, Масурел; et al. (1990). „Молецулар цлонинг анд биологицал цхарацтеризатион оф тхе хуман еxцисион репаир гене ЕРЦЦ-3.”. Мол. Целл. Биол. 10 (6): 2570—2581. ПМЦ 360615  . ПМИД 2111438.
Г, Wееда; ван Хам РЦ; W, Вермеулен; et al. (1990). „А пресумед ДНА хелицасе енцодед бy ЕРЦЦ-3 ис инволвед ин тхе хуман репаир дисордерс xеродерма пигментосум анд Цоцкаyне'с сyндроме.”. Целл. 62 (4): 777—91. ПМИД 2167179. дои:10.1016/0092-8674(90)90122-У.
XW, Wанг; Yех Х; L, Сцхаеффер; et al. (1995). „п53 модулатион оф ТФИИХ-ассоциатед нуцлеотиде еxцисион репаир ацтивитy.”. Нат. Генет. 10 (2): 188—95. ПМИД 7663514. дои:10.1038/нг0695-188.
Маxон МЕ, Гоодрицх ЈА, Тјиан Р (1994). „Трансцриптион фацтор ИИЕ биндс преферентиаллy то РНА полyмерасе ИИа анд рецруитс ТФИИХ: а модел фор промотер цлеаранце.”. Генес Дев. 8 (5): 515—24. ПМИД 7926747. дои:10.1101/гад.8.5.515.
Маруyама К, Сугано С (1994). „Олиго-цаппинг: а симпле метход то реплаце тхе цап струцтуре оф еукарyотиц мРНАс wитх олигорибонуцлеотидес.”. Гене. 138 (1–2): 171—4. ПМИД 8125298. дои:10.1016/0378-1119(94)90802-8.
Р, Драпкин; Реардон ЈТ; А, Ансари; et al. (1994). „Дуал роле оф ТФИИХ ин ДНА еxцисион репаир анд ин трансцриптион бy РНА полyмерасе ИИ”. Натуре. 368 (6473): 769—72. ПМИД 8152490. дои:10.1038/368769а0.
ван Вуурен АЈ; W, Вермеулен; Ма L; et al. (1994). „Цоррецтион оф xеродерма пигментосум репаир дефецт бy басал трансцриптион фацтор БТФ2 (ТФИИХ)”. ЕМБО Ј. 13 (7): 1645—1653. ПМЦ 394995  . ПМИД 8157004.
L, Сцхаеффер; Монцоллин V; Р, Роy; et al. (1994). „Тхе ЕРЦЦ2/ДНА репаир протеин ис ассоциатед wитх тхе цласс II БТФ2/ТФИИХ трансцриптион фацтор”. ЕМБО Ј. 13 (10): 2388—2392. ПМЦ 395103  . ПМИД 8194528.
СН, Гуздер; Сунг П; V, Баиллy; et al. (1994). „РАД25 ис а ДНА хелицасе реqуиред фор ДНА репаир анд РНА полyмерасе II трансцриптион”. Натуре. 369 (6481): 578—81. ПМИД 8202161. дои:10.1038/369578а0.
W, Вермеулен; Сцотт РЈ; С, Родгерс; et al. (1994). „Цлиницал хетерогенеитy wитхин xеродерма пигментосум ассоциатед wитх мутатионс ин тхе ДНА репаир анд трансцриптион гене ЕРЦЦ3”. Ам. Ј. Хум. Генет. 54 (2): 191—200. ПМЦ 1918172  . ПМИД 8304337.
РЈ, Сцотт; Итин П; WЈ, Клеијер; et al. (1993). „Xеродерма пигментосум-Цоцкаyне сyндроме цомплеx ин тwо патиентс: абсенце оф скин туморс деспите севере дефициенцy оф ДНА еxцисион репаир”. Ј. Ам. Ацад. Дерматол. 29 (5 Пт 2): 883—9. ПМИД 8408834. дои:10.1016/0190-9622(93)70263-С.
Ј, Блау; Xиао Х; С, МцЦрацкен; et al. (1996). „Тхрее фунцтионал цлассес оф трансцриптионал ацтиватион домаин”. Мол. Целл. Биол. 16 (5): 2044—2055. ПМЦ 231191  . ПМИД 8628270.
Н, Иyер; Реаган МС; КЈ, Wу; et al. (1996). „Интерацтионс инволвинг тхе хуман РНА полyмерасе II трансцриптион/нуцлеотиде еxцисион репаир цомплеx ТФИИХ, тхе нуцлеотиде еxцисион репаир протеин XПГ, анд Цоцкаyне сyндроме гроуп Б (ЦСБ) протеин”. Биоцхемистрy. 35 (7): 2157—2167. ПМИД 8652557. дои:10.1021/би9524124.
ЈР, Хwанг; Монцоллин V; W, Вермеулен; et al. (1996). „А 3' --> 5' XПБ хелицасе дефецт ин репаир/трансцриптион фацтор ТФИИХ оф xеродерма пигментосум гроуп Б аффецтс ботх ДНА репаир анд трансцриптион”. Ј. Биол. Цхем. 271 (27): 15898—904. ПМИД 8663148. дои:10.1074/јбц.271.27.15898.

Референце

^ Фан L, Арваи А, Цоопер П, Иwаи С, Ханаока Ф, Таинер Ј (2006). „Цонсервед XПБ цоре струцтуре анд мотифс фор ДНА унwиндинг: имплицатионс фор патхwаy селецтион оф трансцриптион ор еxцисион репаир”. Мол Целл. 22 (1): 27—37. ПМИД 16600867. дои:10.1016/ј.молцел.2006.02.017.
^ Yокои, M; et al. (2000). „Тхе xеродерма пигментосум гроуп C протеин цомплеx XПЦ-ХР23Б плаyс ан импортант роле ин тхе рецруитмент оф трансцриптион фацтор ИИХ то дамагед ДНА”. Ј. Биол. Цхем. УНИТЕД СТАТЕС. 275 (13): 9870—5. ИССН 0021-9258. ПМИД 10734143. дои:10.1074/јбц.275.13.9870.
^ Такеда, Н; et al. (1999). „Тхе БЦР-АБЛ онцопротеин потентиаллy интерацтс wитх тхе xеродерма пигментосум гроуп Б протеин”. Проц. Натл. Ацад. Сци. У.С.А. УНИТЕД СТАТЕС. 96 (1): 203—7. ИССН 0027-8424. ПМЦ 15117  . ПМИД 9874796. дои:10.1073/пнас.96.1.203.
^ ^а ^б ^в ^г ^д ^ђ Гиглиа-Мари, Гиусеппина; et al. (2004). „А неw, тентх субунит оф ТФИИХ ис респонсибле фор тхе ДНА репаир сyндроме трицхотхиодyстропхy гроуп А”. Нат. Генет. Унитед Статес. 36 (7). ИССН 1061-4036. ПМИД 15220921. дои:10.1038/нг1387.
^ ^а ^б ^в ^г Маринони, Ј C; et al. (1997). „Цлонинг анд цхарацтеризатион оф п52, тхе фифтх субунит оф тхе цоре оф тхе трансцриптион/ДНА репаир фацтор ТФИИХ”. ЕМБО Ј. ЕНГЛАНД. 16 (5): 714—9. ИССН 0261-4189. ПМЦ 1169708  . ПМИД 9118947. дои:10.1093/ембој/16.5.1093.
^ Драпкин, Р; et al. (1994). „Дуал роле оф ТФИИХ ин ДНА еxцисион репаир анд ин трансцриптион бy РНА полyмерасе ИИ”. Натуре. ЕНГЛАНД. 368 (6473): 769—72. ИССН 0028-0836. ПМИД 8152490. дои:10.1038/368769а0.
^ Иyер, Н; et al. (1996). „Интерацтионс инволвинг тхе хуман РНА полyмерасе II трансцриптион/нуцлеотиде еxцисион репаир цомплеx ТФИИХ, тхе нуцлеотиде еxцисион репаир протеин XПГ, анд Цоцкаyне сyндроме гроуп Б (ЦСБ) протеин”. Биоцхемистрy. УНИТЕД СТАТЕС. 35 (7): 2157—67. ИССН 0006-2960. ПМИД 8652557. дои:10.1021/би9524124.
^ Wанг, X W; et al. (1995). „п53 модулатион оф ТФИИХ-ассоциатед нуцлеотиде еxцисион репаир ацтивитy”. Нат. Генет. УНИТЕД СТАТЕС. 10 (2): 188—95. ИССН 1061-4036. ПМИД 7663514. дои:10.1038/нг0695-188.
^ ^а ^б Россигнол, M; et al. (1997). „Субстрате специфицитy оф тхе цдк-ацтиватинг кинасе (ЦАК) ис алтеред упон ассоциатион wитх ТФИИХ”. ЕМБО Ј. ЕНГЛАНД. 16 (7): 1628—37. ИССН 0261-4189. ПМЦ 1169767  . ПМИД 9130708. дои:10.1093/ембој/16.7.1628.
^ Yее, А; et al. (1995). „Молецулар цлонинг оф ЦДК7-ассоциатед хуман МАТ1, а цyцлин-депендент кинасе-ацтиватинг кинасе (ЦАК) ассемблy фацтор”. Цанцер Рес. УНИТЕД СТАТЕС. 55 (24): 6058—62. ИССН 0008-5472. ПМИД 8521393.
^ Wееда, Г; et al. (1997). „Тхе XПБ субунит оф репаир/трансцриптион фацтор ТФИИХ дирецтлy интерацтс wитх СУГ1, а субунит оф тхе 26С протеасоме анд путативе трансцриптион фацтор”. Нуцлеиц Ацидс Рес. ЕНГЛАНД. 25 (12): 2274—83. ИССН 0305-1048. ПМЦ 146752  . ПМИД 9173976. дои:10.1093/нар/25.12.2274.

Види још

Ксеродерма пигментозум

Спољашње везе

Xeroderma Pigmentosum
XПБЦ-ЕРЦЦ-3+протеин на US National Library of Medicine Medical Subject Headings (MeSH)

[1] Фан L, Арваи А, Цоопер П, Иwаи С, Ханаока Ф, Таинер Ј (2006). „Цонсервед XПБ цоре струцтуре анд мотифс фор ДНА унwиндинг: имплицатионс фор патхwаy селецтион оф трансцриптион ор еxцисион репаир”. Мол Целл. 22 (1): 27—37. ПМИД 16600867. дои:10.1016/ј.молцел.2006.02.017.

[pmid10734143-2] Yокои, M; et al. (2000). „Тхе xеродерма пигментосум гроуп C протеин цомплеx XПЦ-ХР23Б плаyс ан импортант роле ин тхе рецруитмент оф трансцриптион фацтор ИИХ то дамагед ДНА”. Ј. Биол. Цхем. УНИТЕД СТАТЕС. 275 (13): 9870—5. ИССН 0021-9258. ПМИД 10734143. дои:10.1074/јбц.275.13.9870.

[pmid9874796-3] Такеда, Н; et al. (1999). „Тхе БЦР-АБЛ онцопротеин потентиаллy интерацтс wитх тхе xеродерма пигментосум гроуп Б протеин”. Проц. Натл. Ацад. Сци. У.С.А. УНИТЕД СТАТЕС. 96 (1): 203—7. ИССН 0027-8424. ПМЦ 15117  . ПМИД 9874796. дои:10.1073/пнас.96.1.203.

[pmid15220921-4] а ^б ^в ^г ^д ^ђ Гиглиа-Мари, Гиусеппина; et al. (2004). „А неw, тентх субунит оф ТФИИХ ис респонсибле фор тхе ДНА репаир сyндроме трицхотхиодyстропхy гроуп А”. Нат. Генет. Унитед Статес. 36 (7). ИССН 1061-4036. ПМИД 15220921. дои:10.1038/нг1387.

[pmid9118947-5] а ^б ^в ^г Маринони, Ј C; et al. (1997). „Цлонинг анд цхарацтеризатион оф п52, тхе фифтх субунит оф тхе цоре оф тхе трансцриптион/ДНА репаир фацтор ТФИИХ”. ЕМБО Ј. ЕНГЛАНД. 16 (5): 714—9. ИССН 0261-4189. ПМЦ 1169708  . ПМИД 9118947. дои:10.1093/ембој/16.5.1093.

[pmid8152490-6] Драпкин, Р; et al. (1994). „Дуал роле оф ТФИИХ ин ДНА еxцисион репаир анд ин трансцриптион бy РНА полyмерасе ИИ”. Натуре. ЕНГЛАНД. 368 (6473): 769—72. ИССН 0028-0836. ПМИД 8152490. дои:10.1038/368769а0.

[pmid8652557-7] Иyер, Н; et al. (1996). „Интерацтионс инволвинг тхе хуман РНА полyмерасе II трансцриптион/нуцлеотиде еxцисион репаир цомплеx ТФИИХ, тхе нуцлеотиде еxцисион репаир протеин XПГ, анд Цоцкаyне сyндроме гроуп Б (ЦСБ) протеин”. Биоцхемистрy. УНИТЕД СТАТЕС. 35 (7): 2157—67. ИССН 0006-2960. ПМИД 8652557. дои:10.1021/би9524124.

[pmid7663514-8] Wанг, X W; et al. (1995). „п53 модулатион оф ТФИИХ-ассоциатед нуцлеотиде еxцисион репаир ацтивитy”. Нат. Генет. УНИТЕД СТАТЕС. 10 (2): 188—95. ИССН 1061-4036. ПМИД 7663514. дои:10.1038/нг0695-188.

[pmid9130708-9] а ^б Россигнол, M; et al. (1997). „Субстрате специфицитy оф тхе цдк-ацтиватинг кинасе (ЦАК) ис алтеред упон ассоциатион wитх ТФИИХ”. ЕМБО Ј. ЕНГЛАНД. 16 (7): 1628—37. ИССН 0261-4189. ПМЦ 1169767  . ПМИД 9130708. дои:10.1093/ембој/16.7.1628.

[pmid8521393-10] Yее, А; et al. (1995). „Молецулар цлонинг оф ЦДК7-ассоциатед хуман МАТ1, а цyцлин-депендент кинасе-ацтиватинг кинасе (ЦАК) ассемблy фацтор”. Цанцер Рес. УНИТЕД СТАТЕС. 55 (24): 6058—62. ИССН 0008-5472. ПМИД 8521393.

[pmid9173976-11] Wееда, Г; et al. (1997). „Тхе XПБ субунит оф репаир/трансцриптион фацтор ТФИИХ дирецтлy интерацтс wитх СУГ1, а субунит оф тхе 26С протеасоме анд путативе трансцриптион фацтор”. Нуцлеиц Ацидс Рес. ЕНГЛАНД. 25 (12): 2274—83. ИССН 0305-1048. ПМЦ 146752  . ПМИД 9173976. дои:10.1093/нар/25.12.2274.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

[9]

[10]

[11]