TRAIL
edit |
Faktor nekroze tumora (ligand) superfamilija, član 10 | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
PDB prikaz baziran na 1d0g. | |||||||||||
Dostupne strukture | |||||||||||
1d0g, 1d2q, 1d4v, 1dg6, 1du3 | |||||||||||
Identifikatori | |||||||||||
Simboli | TNFSF10; APO2L; Apo-2L; CD253; TL2; TRAIL | ||||||||||
Vanjski ID | OMIM: 603598 MGI: 107414 HomoloGene: 2824 GeneCards: TNFSF10 Gene | ||||||||||
| |||||||||||
Pregled RNK izražavanja | |||||||||||
podaci | |||||||||||
Ortolozi | |||||||||||
Vrsta | Čovek | Miš | |||||||||
Entrez | 8743 | 22035 | |||||||||
Ensembl | ENSG00000121858 | ENSMUSG00000039304 | |||||||||
UniProt | P50591 | Q3TZR6 | |||||||||
RefSeq (mRNA) | NM_003810 | NM_009425 | |||||||||
RefSeq (protein) | NP_003801 | NP_033451 | |||||||||
Lokacija (UCSC) | Chr 3: 173.71 - 173.72 Mb | Chr 3: 27.51 - 27.53 Mb | |||||||||
PubMed pretraga | [1] | [2] |
TRAIL, TNF-srodni apoptoza-indukujući ligand, je protein koji funkcioniše kao ligand koji indukuje proces ćelijske smrti (apoptozu). TRAIL je takođe naziva CD253 (klaster diferencijacije 253).[1][2][3]
Kod ljudi, gen koji kodira TRAIL je lociran na hromozomu 3q26. On nije u blizini drugih članova TNF familije. Genomska struktura TRAIL gena se sastoji od aproksimativno 20 kb i formirana je od pet eksonskih segmenata 222, 138, 42, 106, i 1245 nukleotida i četiri introna sa aproksimativno 8.2, 3.2, 2.3 i 2.3 kb. TRAIL genu nedostaju TATA i CAAT kutije, i promotorski region sadrži putativne response elemente za GATA, AP-1, C/EBP, SP-1, OCT-1, AP3, PEA3, CF-1, i ISRE.
TRAIL pokazuje homologiju sa drugim članovima faktor nekroze tumora superfamilije. On se sastoji od 281 aminokiseline i ima karakteristike tipa II transmembranskog proteina (i.e. nema vodeću sekvencu i unutrašnji transmembranski domen). N-terminalni citoplazmatični domen nije konzerviran među članovima familije. U kontrastu s njim, C-terminalni ekstracelularni domen je konzerviran i može biti proteolitički odsečen sa ćelijske površine. TRAIL formira homotrimer koji vezuje tri molekula receptora.
TRAIL se vezuje za receptore smrti DR4 (TRAIL-RI) i DR5 (TRAIL-RII). Proces apoptoze je zavistan od kaspaze-8. Kaspaza-8 aktivira nizvodne efektorske kaspaze uključujući prokaspaze-3, -6, i -7, što dovodi do aktivacije specifičnih kinaza.[4] TRAIL se takođe vezuje za receptore DcR1 i DcR2, koji ne sadrže citoplazmatični domen (DcR1), ili koji imaju skraćeni domen smrti (DcR2). DcR1 funkcioniše kao TRAIL-neutrališući mamac-receptor. Citoplazmatični DcR2 domen je funkcionalan i aktivira NFkapaB. U ćelijama koje izražavaju DcR2, TRAIL vezivanje aktivira NFkapaB, što dovodi do transkripcije gena za koje se zna da antagoniziraju signalni put smrti i/ili da promovišu inflamaciju.
Za TRAIL je bilo pokazano da interaguje sa TNFRSF10B.[5][6][7]
- ↑ Wiley SR, Schooley K, Smolak PJ, Din WS, Huang CP, Nicholl JK, Sutherland GR, Smith TD, Rauch C, Smith CA (December 1995). „Identification and characterization of a new member of the TNF family that induces apoptosis”. Immunity 3 (6): 673–82. DOI:10.1016/1074-7613(95)90057-8. PMID 8777713.
- ↑ Pitti RM, Marsters SA, Ruppert S, Donahue CJ, Moore A, Ashkenazi A (May 1996). „Induction of apoptosis by Apo-2 ligand, a new member of the tumor necrosis factor cytokine family”. J. Biol. Chem. 271 (22): 12687–90. DOI:10.1074/jbc.271.22.12687. PMID 8663110. Arhivirano iz originala na datum 2005-01-19. Pristupljeno 2014-05-20.
- ↑ Mire-Sluis, Anthony R.; Thorpe, Robin, ur. (1998). Cytokines (Handbook of Immunopharmacology). Boston: Academic Press. ISBN 0-12-498340-5.
- ↑ Song JJ, Lee YJ (May 2008). „Differential cleavage of Mst1 by caspase-7/-3 is responsible for TRAIL-induced activation of the MAPK superfamily”. Cell. Signal. 20 (5): 892–906. DOI:10.1016/j.cellsig.2008.01.001. PMC 2483832. PMID 18276109.
- ↑ Kaptein, A; Jansen M, Dilaver G, Kitson J, Dash L, Wang E, Owen M J, Bodmer J L, Tschopp J, Farrow S N (November 2000). „Studies on the interaction between TWEAK and the death receptor WSL-1/TRAMP (DR3)”. FEBS Lett. (NETHERLANDS) 485 (2-3): 135–41. DOI:10.1016/S0014-5793(00)02219-5. ISSN 0014-5793. PMID 11094155.
- ↑ Walczak, H; Degli-Esposti M A, Johnson R S, Smolak P J, Waugh J Y, Boiani N, Timour M S, Gerhart M J, Schooley K A, Smith C A, Goodwin R G, Rauch C T (September 1997). „TRAIL-R2: a novel apoptosis-mediating receptor for TRAIL”. EMBO J. (ENGLAND) 16 (17): 5386–97. DOI:10.1093/emboj/16.17.5386. ISSN 0261-4189. PMC 1170170. PMID 9311998.
- ↑ Hymowitz, S G; Christinger H W, Fuh G, Ultsch M, O'Connell M, Kelley R F, Ashkenazi A, de Vos A M (October 1999). „Triggering cell death: the crystal structure of Apo2L/TRAIL in a complex with death receptor 5”. Mol. Cell (UNITED STATES) 4 (4): 563–71. DOI:10.1016/S1097-2765(00)80207-5. ISSN 1097-2765. PMID 10549288.
- Wiley S, Schooley K, Smolak P, Din W, Huang C, Nicholl J, Sutherland G, Smith T, Rauch C, Smith C (1995). „Identification and characterization of a new member of the TNF family that induces apoptosis”. Immunity 3 (6): 673–82. DOI:10.1016/1074-7613(95)90057-8. PMID 8777713.
- Almasan A, Ashkenazi A (2004). „Apo2L/TRAIL: apoptosis signaling, biology, and potential for cancer therapy.”. Cytokine Growth Factor Rev. 14 (3-4): 337–48. DOI:10.1016/S1359-6101(03)00029-7. PMID 12787570.
- Cha SS, Song YL, Oh BH (2004). „Specificity of molecular recognition learned from the crystal structures of TRAIL and the TRAIL:sDR5 complex.”. Vitam. Horm. 67: 1–17. DOI:10.1016/S0083-6729(04)67001-4. PMID 15110168.
- Song C, Jin B (2005). „TRAIL (CD253), a new member of the TNF superfamily.”. J. Biol. Regul. Homeost. Agents 19 (1-2): 73–7. PMID 16178278.
- Bucur O, Ray S, Bucur MC, Almasan A (2006). „APO2 ligand/tumor necrosis factor-related apoptosis-inducing ligand in prostate cancer therapy.”. Front. Biosci. 11: 1549–68. DOI:10.2741/1903. PMID 16368536.
- Apoptoza, Trail & Kaspaze 8 - Mapa proteolize-animacija
- PDB 1D2Q
- MeSH TRAIL+Protein