TPSAB1

Материал из Википедии — свободной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
TPSAB1
Доступные структуры
PDBПоиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB

1A0L, 2BM2, 2FPZ, 2FS8, 2FS9, 2FWW, 2FXR, 2GDD, 2ZA5, 3V7T,%%s1LTO, 2F9N, 2F9O, 2F9P, 2ZEB, 2ZEC, 4A6L, 4MPU, 4MPV, 4MPW, 4MPX, 4MQA, 5F03

Идентификаторы
ПсевдонимыTPSAB1, TPS1, TPS2, TPSB1, tryptase alpha/beta 1, TPSB2, Tryptase-2
Внешние IDOMIM: 191080 MGI: 96942 HomoloGene: 55729 GeneCards: TPSAB1
Расположение гена (человек)
16-я хромосома человека
Хр.16-я хромосома человека[1]
16-я хромосома человека
Расположение в геноме TPSAB1
Расположение в геноме TPSAB1
Локус16p13.3Начало1,240,379 bp[1]
Конец1,242,554 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
17-я хромосома мыши
Хр.17-я хромосома мыши[2]
17-я хромосома мыши
Расположение в геноме TPSAB1
Расположение в геноме TPSAB1
Локус17 A3.3|17 12.53 cMНачало25,585,279 bp[2]
Конец25,588,072 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
Наибольшая экспрессия в
Дополнительные справочные данные
BioGPS




Дополнительные справочные данные
Генная онтология
Молекулярная функция
Компонент клетки
Биологический процесс
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)

NM_003294

NM_010781

RefSeq (белок)

NP_077078
NP_003285

NP_034911

Локус (UCSC)Chr 16: 1.24 – 1.24 MbChr 17: 25.59 – 25.59 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Логотип Викиданных Информация в Викиданных
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

TPSAB1 (англ. Tryptase alpha/beta-1; Шифр КФ 3.4.21.59) — фермент триптаза, продукт гена TPSAB1[5][6]. Триптаза бета-1 является изоферментом, экспрессированным на тучных клетках, тогда как изофермент триптаза альфа-1 преимущественно находится на базофилах[7].

Структура и функции

[править | править код]

Триптазы входят в семейство S1 трипсино-подобных сериновых протеаз. Они каталитически активны в тетрамерной форме, стабилизируемой гепарином, и устойчивы к известным эндогенным ингибиторам протеаз. Несколько генов триптаз сгруппированы на хромосоме 16p13.3 и обладают некоторыми общими свойствами. Все эти гены имеют высококонсервативные участки 3' UTR и содержат тандемные повторы на 5'-конце, а их 3' UTR участок играет роль в регуляции стабильности их мРНК. Гены содержат интрон непосредственно после инициирующего Met-кодона, отделяющего Met-кодон от кодирующей белок последовательности. Такая особенность структуры гена характерна в основном только для триптаз. Ген TPSAB1 отличается множественностью аллелей, две основные из которых альфа-1 и бета-1 ранее считались различными белками[7].

Триптаза бета-1 — основная нейтральная протеаза, присутствующая в тучных клетках. Она секретируется из клетки в ходе процесса активации-дегрануляции. Может играть роль во врождённом иммунитете. Изоформа 2 расщепляет крупные субстраты, такие как фибронектин, с большей эффективностью, чем изоформа 1 и, наоборот, менее эффективна в расщеплении небольших белковых субстратов[8].

Примечания

[править | править код]
  1. 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000172236 - Ensembl, May 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000033825 - Ensembl, May 2017
  3. Ссылка на публикацию человека на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. Ссылка на публикацию мыши на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. Miller J. S., Moxley G., Schwartz L. B. Cloning and characterization of a second complementary DNA for human tryptase (англ.) // J Clin Invest : journal. — 1990. — October (vol. 86, no. 3). — P. 864—870. — doi:10.1172/JCI114786. — PMID 2203827. — PMC 296804.
  6. Pallaoro M., Fejzo M. S., Shayesteh L., Blount J. L., Caughey G. H. Characterization of genes encoding known and novel human mast cell tryptases on chromosome 16p13.3 (англ.) // J Biol Chem : journal. — 1999. — February (vol. 274, no. 6). — P. 3355—3362. — doi:10.1074/jbc.274.6.3355. — PMID 9920877.
  7. 1 2 Entrez Gene: TPSAB1 tryptase alpha/beta 1.
  8. Jackson N. E., Wang H. W., Bryant K. J., McNeil H. P., Husain A., Liu K. et al. Alternate mRNA splicing in multiple human tryptase genes is predicted to regulate tetramer formation (англ.) // J Biol Chem : journal. — 2008. — Vol. 283, no. 49. — P. 34178—34187. — doi:10.1074/jbc.M807553200. — PMID 18854315. — PMC 2662235.

Литература

[править | править код]