TCF4

Материал из Википедии — свободной энциклопедии
Перейти к навигации Перейти к поиску
TCF4
Доступные структуры
PDBПоиск ортологов: PDBe RCSB
Список идентификаторов PDB

2KWF

Идентификаторы
ПсевдонимыTCF4, E2-2, ITF-2, ITF2, PTHS, SEF-2, SEF2, SEF2-1, SEF2-1A, SEF2-1B, SEF2-1D, TCF-4, bHLHb19, FECD3, transcription factor 4, CDG2T
Внешние IDOMIM: 602272 MGI: 98506 HomoloGene: 2407 GeneCards: TCF4
Расположение гена (человек)
18-я хромосома человека
Хр.18-я хромосома человека[1]
18-я хромосома человека
Расположение в геноме TCF4
Расположение в геноме TCF4
Локус18q21.2Начало55,222,185 bp[1]
Конец55,664,787 bp[1]
Расположение гена (Мышь)
18-я хромосома мыши
Хр.18-я хромосома мыши[2]
18-я хромосома мыши
Расположение в геноме TCF4
Расположение в геноме TCF4
Локус18|18 E2Начало69,343,356 bp[2]
Конец69,689,079 bp[2]
Паттерн экспрессии РНК
Bgee
ЧеловекМышь (ортолог)
Наибольшая экспрессия в
Наибольшая экспрессия в
Дополнительные справочные данные
BioGPS
н/д
Генная онтология
Молекулярная функция
Компонент клетки
Биологический процесс
Источники: Amigo, QuickGO
Ортологи
ВидЧеловекМышь
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
NM_001083962
NM_001243226
NM_001243227
NM_001243228
NM_001243230

NM_001243231
NM_001243232
NM_001243233
NM_001243234
NM_001243235
NM_001243236
NM_001306207
NM_001306208
NM_003199
NM_001330604
NM_001330605
NM_001348211
NM_001348212
NM_001348213
NM_001348214
NM_001348215
NM_001348216
NM_001348217
NM_001348218
NM_001348219
NM_001348220
NM_001369572
NM_001369573
NM_001369574
NM_001369575
NM_001369576
NM_001369577
NM_001369578
NM_001369579
NM_001369580
NM_001369581
NM_001369582
NM_001369583
NM_001369584
NM_001369585
NM_001369586
NM_001369567
NM_001369568
NM_001369569
NM_001369570
NM_001369571

NM_001083967
NM_013685
NM_001361126
NM_001361127
NM_001361128

NM_001361129

RefSeq (белок)
NP_001077431
NP_001230155
NP_001230156
NP_001230157
NP_001230159

NP_001230160
NP_001230161
NP_001230162
NP_001230163
NP_001230164
NP_001230165
NP_001293136
NP_001293137
NP_001317533
NP_001317534
NP_003190
NP_001335140
NP_001335141
NP_001335142
NP_001335143
NP_001335144
NP_001335145
NP_001335146
NP_001335147
NP_001335148
NP_001335149
NP_001356501
NP_001356502
NP_001356503
NP_001356504
NP_001356505
NP_001356506
NP_001356507
NP_001356508
NP_001356509
NP_001356510
NP_001356511
NP_001356512
NP_001356513
NP_001356514
NP_001356515
NP_001356496
NP_001356497
NP_001356498
NP_001356499
NP_001356500

NP_001077436
NP_038713
NP_001348055
NP_001348056
NP_001348057

NP_001348058

Локус (UCSC)Chr 18: 55.22 – 55.66 MbChr 18: 69.34 – 69.69 Mb
Поиск по PubMedИскать[3]Искать[4]
Логотип Викиданных Информация в Викиданных
Смотреть (человек)Смотреть (мышь)

TCF-4 (от англ. Transcription factor 4) или Фактор транскрипции 4, также известный как фактор транскрипции иммуноглобулина 2 (ITF-2), представляет собой белок, который у человека кодируется геном TCF4, расположенным на хромосоме 18q21.2[5].

Белок TCF4 действует как фактор транскрипции, который связывается с мотивом усилителя иммуноглобулина mu-E5/kappa-E2. TCF4 активирует транскрипцию путём связывания с E-боксом (5’-CANNTG-3 ’), обычно обнаруживаемым на SSTR2[англ.]-INR или инициаторном элементе рецептора 2 соматостатина. TCF4 в первую очередь участвует в неврологическом развитии плода во время беременности, инициируя нейральную дифференцировку путем связывания с ДНК. Он обнаруживается в центральной нервной системе, сомитах и предшественнике гонад на ранних этапах развития. На более поздних этапах развития его находят в щитовидной железе, тимусе и почках, тогда как во взрослом возрасте TCF4 может быть обнаружен в лимфоцитах, мышцах, зрелых нейронах и желудочно-кишечной системе[6][7][8].

Клиническое значение

[править | править код]

Мутации в TCF4 вызывают синдром Питта — Хопкинса (PTHS). Эти мутации приводят к тому, что белки TCF4 не связываются должным образом с ДНК и не контролируют дифференцировку нервной системы. В большинстве изученных случаев мутации были de novo, то есть это была новая мутация, не обнаруженная у других членов семьи пациента. Общие симптомы синдрома Питта-Хопкинса включают широкий рот, желудочно-кишечные проблемы, задержку развития мелкой моторики, проблемы с речью и дыханием, эпилепсию и другие дефекты головного мозга[9][10].

Примечания

[править | править код]
  1. 1 2 3 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000196628 - Ensembl, May 2017
  2. 1 2 3 GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000053477 - Ensembl, May 2017
  3. Ссылка на публикацию человека на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  4. Ссылка на публикацию мыши на PubMed: Национальный центр биотехнологической информации, Национальная медицинская библиотека США.
  5. Henthorn P, McCarrick-Walmsley R, Kadesch T (Feb 1990). "Sequence of the cDNA encoding ITF-2, a positive-acting transcription factor". Nucleic Acids Research. 18 (3): 678. doi:10.1093/nar/18.3.678. PMC 333500. PMID 2308860.
  6. de Pontual L, Mathieu Y, Golzio C, Rio M, Malan V, Boddaert N, et al. (Apr 2009). "Mutational, functional, and expression studies of the TCF4 gene in Pitt-Hopkins syndrome". Human Mutation. 30 (4): 669—76. doi:10.1002/humu.20935. PMID 19235238.
  7. Pscherer A, Dörflinger U, Kirfel J, Gawlas K, Rüschoff J, Buettner R, Schüle R (Dec 1996). "The helix-loop-helix transcription factor SEF-2 regulates the activity of a novel initiator element in the promoter of the human somatostatin receptor II gene". The EMBO Journal. 15 (23): 6680—90. doi:10.1002/j.1460-2075.1996.tb01058.x. PMC 452492. PMID 8978694.
  8. D'Rozario, Mitchell; Zhang, Ting; Waddell, Edward A.; Zhang, Yonggang; Sahin, Cem; Sharoni, Michal; Hu, Tina; Nayal, Mohammad; Kutty, Kaveesh; Liebl, Faith; Hu, Wenhui (2016-04-12). "Type I bHLH Proteins Daughterless and Tcf4 Restrict Neurite Branching and Synapse Formation by Repressing Neurexin in Postmitotic Neurons". Cell Reports. 15 (2): 386—397. doi:10.1016/j.celrep.2016.03.034. ISSN 2211-1247. PMC 4946342. PMID 27050508.
  9. Amiel J, Rio M, de Pontual L, Redon R, Malan V, Boddaert N, et al. (May 2007). "Mutations in TCF4, encoding a class I basic helix-loop-helix transcription factor, are responsible for Pitt-Hopkins syndrome, a severe epileptic encephalopathy associated with autonomic dysfunction". American Journal of Human Genetics. 80 (5): 988—93. doi:10.1086/515582. PMC 1852736. PMID 17436254.
  10. Zweier C, Peippo MM, Hoyer J, Sousa S, Bottani A, Clayton-Smith J, et al. (May 2007). "Haploinsufficiency of TCF4 causes syndromal mental retardation with intermittent hyperventilation (Pitt-Hopkins syndrome)". American Journal of Human Genetics. 80 (5): 994—1001. doi:10.1086/515583. PMC 1852727. PMID 17436255.