Ajdin Hrustic speelde in de jeugd voor verschillende clubs in Melbourne. In 2010 vertrok hij naar Austria Wien, en via FC Schalke 04 kwam hij in de jeugd van FC Groningen terecht. In het seizoen 2016/2017 speelde hij met Jong FC Groningen in de Derde divisie zaterdag. Hij maakte zijn debuut voor FC Groningen op 1 april 2017, in de met 0-0 gelijkgespeelde uitwedstrijd in de Eredivisie tegen AZ. Hij kwam in de 70e minuut in het veld voor Alexander Sørloth. Hrustic scoorde zijn eerste doelpunt voor FC Groningen op 16 april 2017, in de met 5-1 gewonnen thuiswedstrijd tegen PEC Zwolle.