SETDB1

SETDB1
ساختارهای موجود PDB جستجوی هم‌ساخت‌شناسی: PDBe RCSB فهرست شناسه‌های PDB 3DLM, 4X3S, 5KE2
معین‌کننده‌ها
نام‌های دیگر	SETDB1, ESET, H3-K9-HMTase4, KG1T, KMT1E, TDRD21, SET domain bifurcated 1, SET domain bifurcated histone lysine methyltransferase 1
شناسه‌های بیرونی	OMIM: 604396 MGI: 1934229 HomoloGene: 32157 GeneCards: SETDB1
موقعیت ژن (موش) کروموزوم کروموزوم ۳ (موش) نوار 3|3 F2.1 شروع 95,230,836 bp پایان 95,264,513 bp
الگوی گسترش RNA More reference expression data
هستی‌شناسی ژن عملکرد ملکولی • GO:0102674، GO:0102675 methyltransferase activity • transferase activity • DNA binding • promoter-specific chromatin binding • zinc ion binding • histone-lysine N-methyltransferase activity • metal ion binding • GO:0001948، GO:0016582 پیوند پروتئینی • chromatin binding • histone methyltransferase activity (H3-K9 specific) ترکیبات سلولی • intracellular membrane-bounded organelle • پوسته یاخته • نوکلئوپلاسم • کروموزوم • هسته یاخته • سیتوزول • سیتوپلاسم فرایند زیستی • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of DNA methylation-dependent heterochromatin assembly • response to vitamin • transcription, DNA-templated • متیل‌دار کردن • histone lysine methylation • Ras protein signal transduction • response to ethanol • GO:0031497، GO:0006336، GO:0034724، GO:0001301، GO:0007580، GO:0034652، GO:0010847 chromatin organization • negative regulation of single stranded viral RNA replication via double stranded DNA intermediate • histone H3-K9 methylation منابع: آمیگو / کوئیک‌گو
هم‌ساخت‌شناسی
گونه‌ها	انسان	موش
Entrez	9869	84505
آنسامبل	ENSG00000143379	ENSMUSG00000015697
یونی‌پروت	Q15047	O88974
RefSeq (mRNA)	NM_001243491، NM_012432، XM_017002955، NM_001366417، NM_001366418 NM_001145415، NM_001243491، NM_012432، XM_017002955، NM_001366417، NM_001366418	NM_001163642، NM_018877، XM_036163425 NM_001163641، NM_001163642، NM_018877، XM_036163425
RefSeq (پروتئین)	NP_001230420، NP_036564، XP_016858444، NP_001353346، NP_001353347 NP_001138887، NP_001230420، NP_036564، XP_016858444، NP_001353346، NP_001353347	ن/م
موقعیت (UCSC)	ن/م	Chr : 95.23 – 95.26 Mb
جستجوی PubMed
ویکی‌داده
مشاهده/ویرایش انسان مشاهده/ویرایش موش

هیستون-لیزین اِن-متیل‌ترانسفراز SETDB1 (انگلیسی: Histone-lysine N-methyltransferase SETDB1) یک آنزیم است که در انسان توسط ژن «SETDB1» کُدگذاری می‌شود.

دومین SET یک دومین به‌شدت محافظت‌شده‌است که یک موتیف ۱۵۰ آمینواسیدی دارد و در تنظیم ساختار کروماتین نقش بازی می‌کند.

منابع

• مشارکت‌کنندگان ویکی‌پدیا. «SETDB1». در دانشنامهٔ ویکی‌پدیای انگلیسی، بازبینی‌شده در ۳ اکتبر ۲۰۱۹.

برای مطالعهٔ بیشتر

• Nomura N, Nagase T, Miyajima N, Sazuka T, Tanaka A, Sato S, Seki N, Kawarabayasi Y, Ishikawa K, Tabata S (1994). "Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. II. The coding sequences of 40 new genes (KIAA0041-KIAA0080) deduced by analysis of cDNA clones from human cell line KG-1". DNA Res. 1 (5): 223–9. doi:10.1093/dnares/1.5.223. PMID 7584044.
• Yang L, Xia L, Wu DY, Wang H, Chansky HA, Schubach WH, Hickstein DD, Zhang Y (2002). "Molecular cloning of ESET, a novel histone H3-specific methyltransferase that interacts with ERG transcription factor". Oncogene. 21 (1): 148–52. doi:10.1038/sj.onc.1204998. PMID 11791185.
• Schultz DC, Ayyanathan K, Negorev D, Maul GG, Rauscher FJ (2002). "SETDB1: a novel KAP-1-associated histone H3, lysine 9-specific methyltransferase that contributes to HP1-mediated silencing of euchromatic genes by KRAB zinc-finger proteins". Genes Dev. 16 (8): 919–32. doi:10.1101/gad.973302. PMC 152359. PMID 11959841.
• Yang L, Mei Q, Zielinska-Kwiatkowska A, Matsui Y, Blackburn ML, Benedetti D, Krumm AA, Taborsky GJ, Chansky HA (2003). "An ERG (ets-related gene)-associated histone methyltransferase interacts with histone deacetylases 1/2 and transcription co-repressors mSin3A/B". Biochem. J. 369 (Pt 3): 651–7. doi:10.1042/BJ20020854. PMC 1223118. PMID 12398767.
• Nakayama M, Kikuno R, Ohara O (2002). "Protein-protein interactions between large proteins: two-hybrid screening using a functionally classified library composed of long cDNAs". Genome Res. 12 (11): 1773–84. doi:10.1101/gr.406902. PMC 187542. PMID 12421765.
• Ayyanathan K, Lechner MS, Bell P, Maul GG, Schultz DC, Yamada Y, Tanaka K, Torigoe K, Rauscher FJ (2003). "Regulated recruitment of HP1 to a euchromatic gene induces mitotically heritable, epigenetic gene silencing: a mammalian cell culture model of gene variegation". Genes Dev. 17 (15): 1855–69. doi:10.1101/gad.1102803. PMC 196232. PMID 12869583.
• Wang H, An W, Cao R, Xia L, Erdjument-Bromage H, Chatton B, Tempst P, Roeder RG, Zhang Y (2003). "mAM facilitates conversion by ESET of dimethyl to trimethyl lysine 9 of histone H3 to cause transcriptional repression". Mol. Cell. 12 (2): 475–87. doi:10.1016/j.molcel.2003.08.007. PMID 14536086.
• Paces-Fessy M, Boucher D, Petit E, Paute-Briand S, Blanchet-Tournier MF (2004). "The negative regulator of Gli, Suppressor of fused (Sufu), interacts with SAP18, Galectin3 and other nuclear proteins". Biochem. J. 378 (Pt 2): 353–62. doi:10.1042/BJ20030786. PMC 1223961. PMID 14611647.
• Colland F, Jacq X, Trouplin V, Mougin C, Groizeleau C, Hamburger A, Meil A, Wojcik J, Legrain P, Gauthier JM (2004). "Functional proteomics mapping of a human signaling pathway". Genome Res. 14 (7): 1324–32. doi:10.1101/gr.2334104. PMC 442148. PMID 15231748.
• Sarraf SA, Stancheva I (2004). "Methyl-CpG binding protein MBD1 couples histone H3 methylation at lysine 9 by SETDB1 to DNA replication and chromatin assembly". Mol. Cell. 15 (4): 595–605. doi:10.1016/j.molcel.2004.06.043. PMID 15327775.
• Goehler H, Lalowski M, Stelzl U, Waelter S, Stroedicke M, Worm U, Droege A, Lindenberg KS, Knoblich M, Haenig C, Herbst M, Suopanki J, Scherzinger E, Abraham C, Bauer B, Hasenbank R, Fritzsche A, Ludewig AH, Büssow K, Buessow K, Coleman SH, Gutekunst CA, Landwehrmeyer BG, Lehrach H, Wanker EE (2004). "A protein interaction network links GIT1, an enhancer of huntingtin aggregation, to Huntington's disease". Mol. Cell. 15 (6): 853–65. doi:10.1016/j.molcel.2004.09.016. PMID 15383276.
• Ichimura T, Watanabe S, Sakamoto Y, Aoto T, Fujita N, Nakao M (2005). "Transcriptional repression and heterochromatin formation by MBD1 and MCAF/AM family proteins". J. Biol. Chem. 280 (14): 13928–35. doi:10.1074/jbc.M413654200. PMID 15691849.
• Verschure PJ, van der Kraan I, de Leeuw W, van der Vlag J, Carpenter AE, Belmont AS, van Driel R (2005). "In vivo HP1 targeting causes large-scale chromatin condensation and enhanced histone lysine methylation". Mol. Cell. Biol. 25 (11): 4552–64. doi:10.1128/MCB.25.11.4552-4564.2005. PMC 1140641. PMID 15899859.
• Gevaert K, Staes A, Van Damme J, De Groot S, Hugelier K, Demol H, Martens L, Goethals M, Vandekerckhove J (2005). "Global phosphoproteome analysis on human HepG2 hepatocytes using reversed-phase diagonal LC". Proteomics. 5 (14): 3589–99. doi:10.1002/pmic.200401217. PMID 16097034.
• Stelzl U, Worm U, Lalowski M, Haenig C, Brembeck FH, Goehler H, Stroedicke M, Zenkner M, Schoenherr A, Koeppen S, Timm J, Mintzlaff S, Abraham C, Bock N, Kietzmann S, Goedde A, Toksöz E, Droege A, Krobitsch S, Korn B, Birchmeier W, Lehrach H, Wanker EE (2005). "A human protein-protein interaction network: a resource for annotating the proteome". Cell. 122 (6): 957–68. doi:10.1016/j.cell.2005.08.029. PMID 16169070.
• Rual JF, Venkatesan K, Hao T, Hirozane-Kishikawa T, Dricot A, Li N, Berriz GF, Gibbons FD, Dreze M, Ayivi-Guedehoussou N, Klitgord N, Simon C, Boxem M, Milstein S, Rosenberg J, Goldberg DS, Zhang LV, Wong SL, Franklin G, Li S, Albala JS, Lim J, Fraughton C, Llamosas E, Cevik S, Bex C, Lamesch P, Sikorski RS, Vandenhaute J, Zoghbi HY, Smolyar A, Bosak S, Sequerra R, Doucette-Stamm L, Cusick ME, Hill DE, Roth FP, Vidal M (2005). "Towards a proteome-scale map of the human protein-protein interaction network". Nature. 437 (7062): 1173–8. doi:10.1038/nature04209. PMID 16189514.
• Orouji E, Federico A, Larribere L, Novak D, Lipka DB, Assenov Y, Sachindra S, Hueser L, Granados K, Gebhardt C, Plass C, Umansky V, Utikal J (2019). "Histone methyltransferase SETDB1 contributes to melanoma tumorigenesis and serves as a new potential therapeutic target". Int J Cancer. 0 (0): 00–00. doi:10.1002/ijc.32432. PMID 31131878.