Bio7

Software zur ökologischen Modellierung

Bio7 ist in der Informatik eine integrierte Entwicklungsumgebung auf Basis von Eclipse RCP zur ökologischen Modellierung. Es bindet die Statistiksprache R sowie ImageJ ein, die dann in Kombination zur Bildanalyse verwendet werden können. Zudem kann die Programmierung von Modellen in den Java-Skriptsprachen wie Groovy, BeanShell erfolgen. Daten können auch aus Tabellenkalkulationen importiert werden. Für die Darstellung von Geodaten ist World Wind eingebunden. Modelle können auch dreidimensional mittels OpenGL visualisiert werden. Fließbilder sind mit dem Graphical Editing Framework realisiert.[2] Für die Integration von ImageJ in die Rich-Client-Umgebung wurde der Weg einer Abspaltung gewählt. Dies erschwere den Austausch mit anderen Projekten und mache auch die Wartung selbst schwieriger.[3]

Bio7
Basisdaten

Entwickler Marcel Austenfeld
Erscheinungsjahr 2007
Aktuelle Version 3.5[1]
(6. Mai 2023)
Betriebssystem Windows, Linux, Mac
Programmier­sprache Java
Kategorie Statistik, Bildverarbeitung, Modellierung
Lizenz Eclipse Public License
deutschsprachig nein
bio7.org
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Bio7 auf GitHub

Einzelnachweise

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  1. Bio7 3.5 Released. 6. Mai 2023 (abgerufen am 12. Oktober 2023).
  2. Marcel Austenfeld, Wolfram Beyschlag: A Graphical User Interface for R in a Rich Client Platform for Ecological Modeling. In: Journal of Statistical Software. Band 49, Nr. 4, 2012, ISSN 1548-7660, doi:10.18637/jss.v049.i04.
  3. Johannes Schindelin, Curtis T. Rueden, Mark C. Hiner, Kevin W. Eliceiri: The ImageJ ecosystem: An open platform for biomedical image analysis: The ImageJ Ecosystem. In: Molecular Reproduction and Development. Band 82, Nr. 7-8, 2015, S. 518–529, doi:10.1002/mrd.22489, PMID 26153368.