Uroplakin-1a je protein koji je kod ljudi kodiran genom UPK1A.[5][6][7]

UPK1A
Identifikatori
AliasiUPK1A
Vanjski ID-jeviOMIM: 611557 MGI: 98911 HomoloGene: 21383 GeneCards: UPK1A
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 19 (čovjek)
Hrom.Hromosom 19 (čovjek)[1]
Hromosom 19 (čovjek)
Genomska lokacija za UPK1A
Genomska lokacija za UPK1A
Bend19q13.12Početak35,666,517 bp[1]
Kraj35,678,481 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 7 (miš)
Hrom.Hromosom 7 (miš)[2]
Hromosom 7 (miš)
Genomska lokacija za UPK1A
Genomska lokacija za UPK1A
Bend7 B1|7 18.78 cMPočetak30,302,517 bp[2]
Kraj30,312,272 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije
Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija protein homodimerization activity
GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
Ćelijska komponenta integral component of membrane
ćelijska membrana
integral component of plasma membrane
Egzosom
apical plasma membrane
Endoplazmatski retikulum
membrana
cell surface
apical plasma membrane urothelial plaque
Biološki proces cell surface receptor signaling pathway
epithelial cell differentiation
protein complex oligomerization
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_007000
NM_001281443

NM_026815

RefSeq (bjelančevina)

NP_001268372
NP_008931

NP_081091

Lokacija (UCSC)Chr 19: 35.67 – 35.68 MbChr 7: 30.3 – 30.31 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Protein koji je kodiran ovim genom član je transmembranske superporodice 4 , poznate i kao porodica tetraspanina. Većina ovih članova su proteini na ćelijskoj površini, koje karakterizira prisustvo četiri hidrofobna domene.

Proteini posreduju u signalnim događajima transdukcije, gdje imaju ulogu u regulaciji razvoja, aktivacije, rasta i pokretljivosti ćelija. Ovaj kodirani protein nalazi se u asimetričnoj jedinici membrane (AUM), gdje se može kompleksirati s ostalim transmembranskim proteinima superporodice 4.

Može imati ulogu u normalnoj fiziologiji mjehurskog epitela, moguće u reguliranju propusnosti membrane površinskih kišobranastih ćelija ili u stabilizaciji apikalne membrane preko AUM / citoskelet ne interakcije.[7]

Aminokiselinska sekvenca

uredi
Simboli
1020304050
MASAAAAEAEKGSPVVVGLLVVGNIIILLSGLSLFAETIWVTADQYRVYP
LMGVSGKDDVFAGAWIAIFCGFSFFMVASFGVGAALCRRRSMVLTYLVLM
LIVYIFECASCITSYTHRDYMVSNPSLITKQMLTFYSADTDQGQELTRLW
DRVMIEQECCGTSGPMDWVNFTSAFRAATPEVVFPWPPLCCRRTGNFIPL
NEEGCRLGHMDYLFTKGCFEHIGHAIDSYTWGISWFGFAILMWTLPVMLI
AMYFYTML

Reference

uredi
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000105668 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000006313 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Lobban ED, Smith BA, Hall GD, Harnden P, Roberts P, Selby PJ, Trejdosiewicz LK, Southgate J (Dec 1998). "Uroplakin gene expression by normal and neoplastic human urothelium". Am J Pathol. 153 (6): 1957–67. doi:10.1016/S0002-9440(10)65709-4. PMC 1866332. PMID 9846985.
  6. ^ Yuasa T, Yoshiki T, Isono T, Tanaka T, Hayashida H, Okada Y (Sep 1999). "Expression of transitional cell-specific genes, uroplakin Ia and II, in bladder cancer: detection of circulating cancer cells in the peripheral blood of metastatic patients". Int J Urol. 6 (6): 286–92. doi:10.1046/j.1442-2042.1999.00064.x. PMID 10404304. S2CID 43597402.
  7. ^ a b "Entrez Gene: UPK1A uroplakin 1A".

Dopunska literatura

uredi