Tip B antigena Sjögrenovog sindroma (SS-B) znan i kao lupusni La protein jest protein koji je kod ljudi kodiran genom SSB sa hromosoma 2.[5]

SSB
Dostupne strukture
PDBPretraga ortologa: PDBe RCSB
Spisak PDB ID kodova

1OWX, 1S79, 1S7A, 1YTY, 1ZH5, 2VOD, 2VON, 2VOO, 2VOP

Identifikatori
AliasiSSB
Vanjski ID-jeviOMIM: 109090 MGI: 98423 HomoloGene: 2366 GeneCards: SSB
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 2 (čovjek)
Hrom.Hromosom 2 (čovjek)[1]
Hromosom 2 (čovjek)
Genomska lokacija za SSB
Genomska lokacija za SSB
Bend2q31.1Početak169,791,933 bp[1]
Kraj169,812,064 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 2 (miš)
Hrom.Hromosom 2 (miš)[2]
Hromosom 2 (miš)
Genomska lokacija za SSB
Genomska lokacija za SSB
Bend2 C2|2 40.95 cMPočetak69,691,906 bp[2]
Kraj69,702,190 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije


Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
mRNA binding
nucleic acid binding
tRNA binding
vezivanje sa RNK
poly(U) RNA binding
protein homodimerization activity
sequence-specific mRNA binding
Ćelijska komponenta jedro
citoplazma
ribonukleoprotein
Biološki proces GO:0033168, GO:0036404, GO:1902360 RNA processing
histone mRNA metabolic process
protein localization to cytoplasmic stress granule
tRNA modification
IRES-dependent viral translational initiation
tRNA 5'-leader removal
tRNA export from nucleus
tRNA processing
tRNA 3'-end processing
nuclear histone mRNA catabolic process
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_003142
NM_001294145

NM_001110145
NM_009278
NM_001355265

RefSeq (bjelančevina)

NP_001281074
NP_003133

NP_001103615
NP_033304
NP_001342194

Lokacija (UCSC)Chr 2: 169.79 – 169.81 MbChr 2: 69.69 – 69.7 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Amiokiselininska sekvenca

uredi

Dužina polipeptidnog lanca je 408 aminokiselina, a molekulska težina 46.837 Da.[6]

1020304050
MAENGDNEKMAALEAKICHQIEYYFGDFNLPRDKFLKEQIKLDEGWVPLE
IMIKFNRLNRLTTDFNVIVEALSKSKAELMEISEDKTKIRRSPSKPLPEV
TDEYKNDVKNRSVYIKGFPTDATLDDIKEWLEDKGQVLNIQMRRTLHKAF
KGSIFVVFDSIESAKKFVETPGQKYKETDLLILFKDDYFAKKNEERKQNK
VEAKLRAKQEQEAKQKLEEDAEMKSLEEKIGCLLKFSGDLDDQTCREDLH
ILFSNHGEIKWIDFVRGAKEGIILFKEKAKEALGKAKDANNGNLQLRNKE
VTWEVLEGEVEKEALKKIIEDQQESLNKWKSKGRRFKGKGKGNKAAQPGS
GKGKVQFQGKKTKFASDDEHDEHDENGATGPVKRAREETDKEEPASKQQK
TENGAGDQ

Funkcija

uredi

La je uključen u različite aspekte metabolizma RNK, uključujući vezivanje i zaštitu 3-prim UUU (OH) elemenata nove RNK-polimeraze III-transkribirane RNK, prerađivanje 5' i 3' krajeva prekursora pre-tRNK, djeluje kao RNK šaperon i vezuje virusne RNK, povezane s virusom hepatitisa C. La protein je prvobitno definiran njegovom reaktivnošću sa autoantitelima pacijenata sa Sjögrenovim sindromom i sistemskim eritemskim lupusom.[5][7]

Interakcije

uredi

Pokazalo se da antigen B Sjogrenovog sindroma ima reakcije sa nukleolinom.[8]

Također pogledajte

uredi

Reference

uredi
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000138385 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000068882 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ a b "Entrez Gene: SSB Sjögren's syndrome antigen B (autoantigen La)".
  6. ^ "UniProt, P05455" (jezik: engleski). Pristupljeno 19. 11. 2021.
  7. ^ Teplova M, Yuan YR, Phan AT, Malinina L, Ilin S, Teplov A, Patel DJ (januar 2006). "Structural basis for recognition and sequestration of UUU(OH) 3' temini of nascent RNA polymerase III transcripts by La, a rheumatic disease autoantigen". Molecular Cell. 21 (1): 75–85. doi:10.1016/j.molcel.2005.10.027. PMC 4689297. PMID 16387655.
  8. ^ Fouraux MA, Bouvet P, Verkaart S, van Venrooij WJ, Pruijn GJ (juli 2002). "Nucleolin associates with a subset of the human Ro ribonucleoprotein complexes". Journal of Molecular Biology. 320 (3): 475–88. doi:10.1016/S0022-2836(02)00518-1. PMID 12096904.

Dopunska literatura

uredi

Vanjski linkovi

uredi