Membranski protein 3 vezan za sekretorni nosač jest protein koji je kod ljudi kodiran genom SCAMP3 sa hromosoma 1.[5][6][7]

SCAMP3
Identifikatori
AliasiSCAMP3
Vanjski ID-jeviOMIM: 606913 MGI: 1346346 HomoloGene: 4164 GeneCards: SCAMP3
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 1 (čovjek)
Hrom.Hromosom 1 (čovjek)[1]
Hromosom 1 (čovjek)
Genomska lokacija za SCAMP3
Genomska lokacija za SCAMP3
Bend1q22Početak155,255,979 bp[1]
Kraj155,262,430 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 3 (miš)
Hrom.Hromosom 3 (miš)[2]
Hromosom 3 (miš)
Genomska lokacija za SCAMP3
Genomska lokacija za SCAMP3
Bend3|3 F1Početak89,084,780 bp[2]
Kraj89,090,072 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije
Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija ubiquitin protein ligase binding
Ćelijska komponenta integral component of membrane
Egzosom
intracellular membrane-bounded organelle
membrana
Golđijeva membrana
Golđijev aparat
trans-Golgi network membrane
recycling endosome membrane
Biološki proces protein transport
post-Golgi vesicle-mediated transport
GO:0015915 transport
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_005698
NM_052837

NM_011886
NM_001309909
NM_001309910

RefSeq (bjelančevina)

NP_005689
NP_443069

NP_001296838
NP_001296839
NP_036016

Lokacija (UCSC)Chr 1: 155.26 – 155.26 MbChr 3: 89.08 – 89.09 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Aminokiselinska sekvenca

uredi

Dužina polipeptidnog lanca je 347 aminokiselina, a molekulska težina 38.287 Da.[8]

1020304050
MAQSRDGGNPFAEPSELDNPFQDPAVIQHRPSRQYATLDVYNPFETREPP
PAYEPPAPAPLPPPSAPSLQPSRKLSPTEPKNYGSYSTQASAAAATAELL
KKQEELNRKAEELDRRERELQHAALGGTATRQNNWPPLPSFCPVQPCFFQ
DISMEIPQEFQKTVSTMYYLWMCSTLALLLNFLACLASFCVETNNGAGFG
LSILWVLLFTPCSFVCWYRPMYKAFRSDSSFNFFVFFFIFFVQDVLFVLQ
AIGIPGWGFSGWISALVVPKGNTAVSVLMLLVALLFTGIAVLGIVMLKRI
HSLYRRTGASFQKAQQEFAAGVFSNPAVRTAAANAAAGAAENAFRAP

Funkcija

uredi

Ovaj genski proizvod pripada SCAMP porodici proteina koji su membranski proteini sekretornih nosača. Funkcioniraju kao nosači na površini ćelije u putevima reciklaže poslije obrade u Golgijevom aparatu. Različiti članovi porodice su visoko srodni proizvodima različitih gena i obično se eksprimiraju zajedno. Ovi nalazi sugeriraju da SCAMP-ovi mogu funkcionirati na istom mjestu tokom transporta vezikula, a ne u različitim putevima. Za ovaj gen su pronađene dvije varijante transkripta koje kodiraju različite izoforme.[7]

Interakcije

uredi

Pokazalo se da SCAMP3 u interakciji sa NEDD4.[9]

Reference

uredi
  1. ^ a b c ENSG00000116521 GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000263290, ENSG00000116521 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000028049 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Winfield SL, Tayebi N, Martin BM, Ginns EI, Sidransky E (oktobar 1997). "Identification of three additional genes contiguous to the glucocerebrosidase locus on chromosome 1q21: implications for Gaucher disease". Genome Research. 7 (10): 1020–6. doi:10.1101/gr.7.10.1020. PMC 310674. PMID 9331372.
  6. ^ Wu TT, Castle JD (juli 1998). "Tyrosine phosphorylation of selected secretory carrier membrane proteins, SCAMP1 and SCAMP3, and association with the EGF receptor". Molecular Biology of the Cell. 9 (7): 1661–74. doi:10.1091/mbc.9.7.1661. PMC 25404. PMID 9658162.
  7. ^ a b "Entrez Gene: SCAMP3 secretory carrier membrane protein 3".
  8. ^ "UniProt, O14828" (jezik: engleski). Pristupljeno 18. 12. 2021.
  9. ^ Aoh QL, Castle AM, Hubbard CH, Katsumata O, Castle JD (mart 2009). "SCAMP3 negatively regulates epidermal growth factor receptor degradation and promotes receptor recycling". Molecular Biology of the Cell. 20 (6): 1816–32. doi:10.1091/mbc.E08-09-0894. PMC 2655259. PMID 19158374.

Dopunska literatura

uredi

Vanjski linkovi

uredi

SCAMP3 detalji ljudskog genoma u UCSC Genome Browser.