Transkripcijski aktivatorski protein Pur-beta je protein koji je kod ljudi kodiran genom PURB.[5][6]

PURB
Identifikatori
AliasiPURB
Vanjski ID-jeviOMIM: 608887 MGI: 1338779 HomoloGene: 69087 GeneCards: PURB
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 7 (čovjek)
Hrom.Hromosom 7 (čovjek)[1]
Hromosom 7 (čovjek)
Genomska lokacija za PURB
Genomska lokacija za PURB
Bend7p13Početak44,876,299 bp[1]
Kraj44,885,530 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 11 (miš)
Hrom.Hromosom 11 (miš)[2]
Hromosom 11 (miš)
Genomska lokacija za PURB
Genomska lokacija za PURB
Bend11 A1|11 4.16 cMPočetak6,417,599 bp[2]
Kraj6,425,917 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije
Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding
GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific
vezivanje sa DNK
double-stranded DNA binding
SMAD binding
single-stranded DNA binding
transcription factor binding
mRNA binding
vezivanje sa RNK
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
purine-rich negative regulatory element binding
sequence-specific DNA binding
Ćelijska komponenta Replikacijski protein A
jedro
Biološki proces regulation of myeloid cell differentiation
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II
Ćelijska proliferacija
Ćelijska diferencijacija
transcription, DNA-templated
GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_033224

NM_011221

RefSeq (bjelančevina)

NP_150093

NP_035351

Lokacija (UCSC)Chr 7: 44.88 – 44.89 MbChr 11: 6.42 – 6.43 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Aminokiselinska sekvenca

uredi

Dužina polipeptidnog lanca je 312 aminokiselina, а molekulska težina 33.241 Da.[7]

1020304050
MADGDSGSERGGGGGPCGFQPASRGGGEQETQELASKRLDIQNKRFYLDV
KQNAKGRFLKIAEVGAGGSKSRLTLSMAVAAEFRDSLGDFIEHYAQLGPS
SPEQLAAGAEEGGGPRRALKSEFLVRENRKYYLDLKENQRGRFLRIRQTV
NRGGGGFGAGPGPGGLQSGQTIALPAQGLIEFRDALAKLIDDYGGEDDEL
AGGPGGGAGGPGGGLYGELPEGTSITVDSKRFFFDVGCNKYGVFLRVSEV
KPSYRNAITVPFKAWGKFGGAFCRYADEMKEIQERQRDKLYERRGGGSGG
GEESEGEEVDED

Funkcija

uredi

Ovaj genski proizvod je sekvencnospecifični protein koji se vezuje za jednolančanu sekvencu DNK. Preferirano se veže za jedan lanac purin-bogatog elementa zvanog PUR, koji je prisutan na početku replikacije i u regijama koje okružuju gene u raznim eukariotima, od kvasaca do ljudi.

Stoga je uključen u kontrolu i replikacije i transkripcije DNK. Delecija ovog gena povezana je s mijelodisplazijskim sindromom i akutnom mijelogenom leukemijom.[6]

Reference

uredi
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000146676 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000094483 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Bergemann AD, Ma ZW, Johnson EM (Dec 1992). "Sequence of cDNA comprising the human pur gene and sequence-specific single-stranded-DNA-binding properties of the encoded protein". Mol Cell Biol. 12 (12): 5673–82. doi:10.1128/mcb.12.12.5673. PMC 360507. PMID 1448097.
  6. ^ a b "Entrez Gene: PURB purine-rich element binding protein B".
  7. ^ "UniProt, Q96QR8" (jezik: engleski). Pristupljeno 28. 9. 2021.

Dopunska literatura

uredi