Jedarni receptor-interaktivni protein 2 je protein koji je kod ljudi kodiran genom NRIP2.

NRIP2
Identifikatori
AliasiNRIP2
Vanjski ID-jeviMGI: 1891884 HomoloGene: 11023 GeneCards: NRIP2
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 12 (čovjek)
Hrom.Hromosom 12 (čovjek)[1]
Hromosom 12 (čovjek)
Genomska lokacija za NRIP2
Genomska lokacija za NRIP2
Bend12p13.33Početak2,825,348 bp[1]
Kraj2,835,544 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 6 (miš)
Hrom.Hromosom 6 (miš)[2]
Hromosom 6 (miš)
Genomska lokacija za NRIP2
Genomska lokacija za NRIP2
Bend6|6 F3Početak128,376,259 bp[2]
Kraj128,393,390 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije
Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
aspartic-type endopeptidase activity
Ćelijska komponenta citoplazma
jedro
Biološki proces GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
transcription, DNA-templated
Proteoliza
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_031474

NM_001162858
NM_021717

RefSeq (bjelančevina)

NP_113662

NP_001156330
NP_068363

Lokacija (UCSC)Chr 12: 2.83 – 2.84 MbChr 6: 128.38 – 128.39 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

U nedavnoj studiji, navodi se da se otkrivanjem kompletne ljudske genomske sekvence fokus prebacuje na identifikaciju gena i na funkcionalnu analizu genskih proizvoda. Generiranje niza cDNK, i sekvenci i fizičkih klonova, koji sadrži potpune i neprekinute regije za kodiranje proteina svih ljudskih gena, pružit će neophodne alate za sistemsku i sveobuhvatnu analizu proteinske funkcije, kako bi se na kraju razumjela molekulska osnova čovjeka. Sekvenciranjem i analizom 500 novih ljudskih cDNK koje sadrže potpuni okvir za kodiranje proteina, dodjeljena je funkcionalna kategorizacija bilo je moguće sekvence za 52% (259) kodiranih proteina, a preostala frakcija nema sličnosti s poznatim proteinima. Poravnavanjem sekvenci cDNK sa sekvencama identificirani su brojni geni koji su ili potpuno promašeni u analizi genomskih sekvenci ili su pogrešno predviđeni. Čini se da su tri od ovih gena prisutna u nekoliko kopija. Može se zaključiti da je sekvenciranje cDNK pune dužine i dalje ključno za tačnu identifikaciju gena. Skup od 500 novih cDNK i još 1.000 potpuno kodiranih cDNK poznatih transkripata koji su identificirani, dodaje se reprezentacija cDNK koja pokrivaju 2% -5% svih ljudskih gena. Time se značajno doprinosi generiranju kataloga gena, koji se sastoji od potpuno kodiranih sekvenci cDNK i klonova, koji bi trebali biti dostupni i postat će neprocjenjiv alat za detaljna funkcionalna proučavanja.[5][6]

Aminokiselinska sekvenca

uredi

Dužina polipeptidnog lanca je 281 aminokiselina, a molekulska težina 31.331 Da.[7]

1020304050
MLFIFPLSLPWRPSCWKESCSTGQRQAGRSREDSVTPPPSSPWPTPPAGA
MSTKQEARRDEGEARTRGQEAQLRDRAHLSQQRRLKQATQFLHKDSADLL
PLDSLKRLGTSKDLQPRSVIQRRLVEGNPNWLQGEPPRMQDLIHGQESRR
KTSRTEIPALLVNCKCQDQLLRVAVDTGTQYNRISAGCLSRLGLEKRVLK
ASAGDLAPGPPTQVEQLELQLGQETVVCSAQVVDAESPEFCLGLQTLLSL
KCCIDLEHGVLRLKAPFSELPFLPLYQEPGQ
Simboli

Reference

uredi
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000053702 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000001520 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R, Gassenhuber J, Glassl S, Ansorge W, Bocher M, Blocker H, Bauersachs S, Blum H, Lauber J, Dusterhoft A, Beyer A, Kohrer K, Strack N, Mewes HW, Ottenwalder B, Obermaier B, Tampe J, Heubner D, Wambutt R, Korn B, Klein M, Poustka A (Mar 2001). "Toward a Catalog of Human Genes and Proteins: Sequencing and Analysis of 500 Novel Complete Protein Coding Human cDNAs". Genome Res. 11 (3): 422–35. doi:10.1101/gr.GR1547R. PMC 311072. PMID 11230166.
  6. ^ "Entrez Gene: NRIP2 nuclear receptor interacting protein 2".
  7. ^ "UniProt, Q9BQI9". Pristupljeno 12. 8. 2021.

Dopunska literatura

uredi