Vjerovatni protein RLP24 ribosomske biogeneze je protein koji je kod ljudi kodiran genom RSL24D1.[5][6][7] Patricia Hartz (2010) mapirala je gen RSL24D1 na hromosomu 15, sekvenca q21.3, na osnovu poravnanja sekvence (AF201949) sa genomskom sekvencom (GRCh37).[8] Ovaj gen kodira protein koji ima nizak nivo sličnosti sekvence s ljudskim ribosomskim proteinom L24. Iako se ovaj gen u bazama podataka o sekvencama naziva RPL24, L30 i 60S ribosomski protein L30, razlikuje se od ljudskih gena koji su službeno nazvani RPL24 (koji je i sam naveden kao ribosomski protein L30) i RPL30. Funkcija ovog gena još nije poznata. Ovaj gen koristi alternativne poliadenilacijske signale.[7]

C15orf15
Identifikatori
AliasiRSL24D1
Vanjski ID-jeviOMIM: 613262 MGI: 2681840 HomoloGene: 9462 GeneCards: RSL24D1
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 15 (čovjek)
Hrom.Hromosom 15 (čovjek)[1]
Hromosom 15 (čovjek)
Genomska lokacija za C15orf15
Genomska lokacija za C15orf15
Bend15q21.3Početak55,180,806 bp[1]
Kraj55,197,049 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 9 (miš)
Hrom.Hromosom 9 (miš)[2]
Hromosom 9 (miš)
Genomska lokacija za C15orf15
Genomska lokacija za C15orf15
Bend9|9 DPočetak73,020,708 bp[2]
Kraj73,030,615 bp[2]
Ontologija gena
Molekularna funkcija structural constituent of ribosome
GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
vezivanje sa RNK
Ćelijska komponenta cytosolic large ribosomal subunit
ribozom
Jedarce
intracellular anatomical structure
jedro
Biološki proces assembly of large subunit precursor of preribosome
Biosinteza bjelančevina
ribosomal large subunit assembly
ribosome biogenesis
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_016304

NM_198609

RefSeq (bjelančevina)

NP_057388

NP_941011

Lokacija (UCSC)Chr 15: 55.18 – 55.2 MbChr 9: 73.02 – 73.03 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Kloniranje i ekspresija

uredi

Traženjem ortologa kvasca Rlp24, Saveanu et al. (2003) identificirali su čovjeka RSL24D1, kojeg su nazvali RLP24.

Funkcija gena

uredi

Saveanu et al. (2003) otkrili su da je kvašćev Rlp24 bio uključen u biogenezu ranih ribonukleopartikula prije 60S. Rlp24 se pridružio čestici pre-60S u jedarcetu i održavao ovu povezanost nakon eksporta pre-60S u citoplazmu. Iscrpljivanje Rlp24 rezultiralo je nestabilnim kompleksom.[9]

Aminokiselinska sekvenca

uredi

Dužina polipeptidnog lanca je 163 aminokiselina, a molekulska težina 19.621 Da [10]

1020304050 MRIEKCYFCSGPIYPGHGMMFVRNDCKVFRFCKSKCHKNFKKKRNPRKVR WTKAFRKAAGKELTVDNSFEFEKRRNEPIKYQRELWNKTIDAMKRVEEIK QKRQAKFIMNRLKKNKELQKVQDIKEVKQNIHLIRAPLAGKGKQLEEKMV QQLQEDVDMEDAP

Simboli

Reference

uredi
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000137876 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000032215 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Saveanu C, Namane A, Gleizes PE, Lebreton A, Rousselle JC, Noaillac-Depeyre J, Gas N, Jacquier A, Fromont-Racine M (Jun 2003). "Sequential protein association with nascent 60S ribosomal particles". Mol Cell Biol. 23 (13): 4449–60. doi:10.1128/MCB.23.13.4449-4460.2003. PMC 164837. PMID 12808088.
  6. ^ Saveanu C, Bienvenu D, Namane A, Gleizes PE, Gas N, Jacquier A, Fromont-Racine M (Nov 2001). "Nog2p, a putative GTPase associated with pre-60S subunits and required for late 60S maturation steps". EMBO J. 20 (22): 6475–84. doi:10.1093/emboj/20.22.6475. PMC 125736. PMID 11707418.
  7. ^ a b "Entrez Gene: C15orf15 chromosome 15 open reading frame 15".
  8. ^ Hartz, P. A. Personal Communication. Baltimore, Md. 2/19/2010.
  9. ^ Saveanu, C., Namane, A., Gleizes, P.-E., Lebreton, A., Rousselle, J.-C., Noaillac-Depeyre, J., Gas, N., Jacquier, A., Fromont-Racine, M. Sequential protein association with nascent 60S ribosomal particles. Molec. Cell. Biol. 23: 4449-4460, 2003. PubMed: 12808088
  10. ^ "UniProt, Q9UHA3". Pristupljeno 12. 7. 2021.

Dopunska literatura

uredi

Vanjski linkovi

uredi


Šablon:Ribosomskee podjedinice