Razdvojni proteinski homolog (Asun), znan i kao homologni regulator Mat89Bb ćelijskog ciklusa je protein koji je kod ljudi kodiran genom Asun.[5][6]

Asun
Identifikatori
AliasiINTS13
Vanjski ID-jeviOMIM: 615079 MGI: 1918427 HomoloGene: 10043 GeneCards: INTS13
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 12 (čovjek)
Hrom.Hromosom 12 (čovjek)[1]
Hromosom 12 (čovjek)
Genomska lokacija za Asun
Genomska lokacija za Asun
Bend12p11.23Početak26,905,181 bp[1]
Kraj26,938,326 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 6 (miš)
Hrom.Hromosom 6 (miš)[2]
Hromosom 6 (miš)
Genomska lokacija za Asun
Genomska lokacija za Asun
Bend6|6 G3Početak146,549,632 bp[2]
Kraj146,577,835 bp[2]
Obrazac RNK ekspresije
Više referentnih podataka o ekspresiji
Ontologija gena
Molekularna funkcija GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
Ćelijska komponenta citoplazma
nukleoplazma
jedro
Biološki proces centrosome localization
regulation of fertilization
flagellated sperm motility
GO:0043148 mitotic spindle organization
ćelijski ciklus
protein localization to nuclear envelope
regulation of mitotic cell cycle
Ćelijska dioba
snRNA transcription by RNA polymerase II
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_018164

NM_138757

RefSeq (bjelančevina)

NP_060634

NP_620096
NP_001349035
NP_001349036
NP_001349037

Lokacija (UCSC)Chr 12: 26.91 – 26.94 MbChr 6: 146.55 – 146.58 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Analizom genomskih sekvenci, Bourdon et al. (2002) mapirali su gen ASUN na hromosomu 12, sekvenca p12-p11. Utvrdili su da ASUN gen sadrži 17 egzona i da ima oko 32,8 kb.[7] Koristeći kombinovanu uporednu genomsku hibridizaciju i ekspresijsku analizu sekvence EST, za identifikaciju gena u regiji hromosoma 12 pojačanog u seminomima i u ćelijskoj liniji karcinoma jajnika u poređenju sa normalnim tkivom, Bourdon et al. (2002) identificirali su ASUN, koji su označili kao GCT1. RT-PCR analiza otkrila je ekspresiju ASUN-a u svih 16 pregledanih normalnih ljudskih tkiva. Ekspresija ASUN-a bila je povišena u većini seminoma u usporedbi s normalnim sjemenicima. Pretražujući baze podataka, Anderson et al. (2009) identificirali su ASUN-ske ortologe u Drosophila i C. elegans. Kod vinskih mušica, činilo se da je ekspresija Asuna specifična za zametnu liniju.[8]

Aminokiselinska sekvenca

uredi

Dužina polipeptidnog lanca je 706 aminokiselina, a molekulska težina 80.225 Da.[9].

1020304050
MKIFSESHKTVFVVDHCPYMAESCRQHVEFDMLVKNRTQGIIPLAPISKS
LWTCSVESSMEYCRIMYDIFPFKKLVNFIVSDSGAHVLNSWTQEDQNLQE
LMAALAAVGPPNPRADPECCSILHGLVAAVETLCKITEYQHEARTLLMEN
AERVGNRGRIICITNAKSDSHVRMLEDCVQETIHEHNKLAANSDHLMQIQ
KCELVLIHTYPVGEDSLVSDRSKKELSPVLTSEVHSVRAGRHLATKLNIL
VQQHFDLASTTITNIPMKEEQHANTSANYDVELLHHKDAHVDFLKSGDSH
LGGGSREGSFKETITLKWCTPRTNNIELHYCTGAYRISPVDVNSRPSSCL
TNFLLNGRSVLLEQPRKSGSKVISHMLSSHGGEIFLHVLSSSRSILEDPP
SISEGCGGRVTDYRITDFGEFMRENRLTPFLDPRYKIDGSLEVPLERAKD
QLEKHTRYWPMIISQTTIFNMQAVVPLASVIVKESLTEEDVLNCQKTIYN
LVDMERKNDPLPISTVGTRGKGPKRDEQYRIMWNELETLVRAHINNSEKH
QRVLECLMACRSKPPEEEERKKRGRKREDKEDKSEKAVKDYEQEKSWQDS
ERLKGILERGKEELAEAEIIKDSPDSPEPPNKKPLVEMDETPQVEKSKGP
VSLLSLWSNRINTANSRKHQEFAGRLNSVNNRAELYQHLKEENGMETTEN
GKASRQ

Funkcija gena

uredi

Lee et al. (2005) otkrili su da je degradacija Mat89bb poremetila brzo odvijanje prelaza S faza–M faza karakteristično za rane embrione Drosophila i Xenopus. U HeLa ćelijama, poremetila je kasniju fazu mitoze i rezultiralo višejedrnim ćelijama.[10]

Jodoin et al. (2012) otkrili su da je razgradnja ASUN-a u ćelijskim linijama ljudi smanjila perijedarnu lokalizaciju dineina, što je bitno za pravilno vezivanje centrosoma na jedarnu ovojnicu pri G2/M. Posljedično, dovela je do mitotskih defekata, uključujući odvajanje jedro-centrosom, abnormalna vretena i višejedrne ćelije. Također rezultirala je pogrešnom lokalizacijom dineinskog adaptera LIS1 (PAFAH1B1). Analiza koimunoprecipitacije pokazala je da je ASUN direktno stupio u interakciju s LIS1, ali ne i s dineinom, te posredovao perijedarno obogaćivanje LIS1 na G2/M.[11]

Životinjski model

uredi

Anderson et al. (2009) otkrili su da je nokautiranje Asuna u Drosophila uzrokovalo defekt u spermatogenezi, sa zaustavljanjem spermatocita tokom profaze mejoze I i defektima u sprezi jedro-centrosom. Spermatociti koji su prebrodili zadržavanje pokazali su nedostatke u sastavu mejotskog vretena, segregaciji hromosoma i citokinezi. U Asun mutantnim spermatocitima i spermatidama, kompleksi dinein-dinaktin, koji posreduju u interakcijama jedro-centrosom/bazno tijelo, nisu se uspjeli lokalizirati na površini jedra.

Jodoin et al. (2012) otkrili su da je ekspresija Asun-a zametne linije miša spasila neplodnost i pogrešnu lokalizaciju dineina u mutantnim Asun drozofilama.

Reference

uredi
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000064102 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000040250 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Bourdon V, Naef F, Rao PH, Reuter V, Mok SC, Bosl GJ, Koul S, Murty VV, Kucherlapati RS, Chaganti RS (Nov 2002). "Genomic and expression analysis of the 12p11-p12 amplicon using EST arrays identifies two novel amplified and overexpressed genes". Cancer Res. 62 (21): 6218–23. PMID 12414650.
  6. ^ "Entrez Gene: C12orf11 chromosome 12 open reading frame 11".
  7. ^ Bourdon, V., Naef, F., Rao, P. H., Reuter, V., Mok, S. C., Bosl, G. J., Koul, S., Murty, V. V. V. S., Kucherlapati, R. S., Chaganti, R. S. K. Genomic and expression analysis of the 12p11-p12 amplicon using EST arrays identifies two novel amplified and overexpressed genes. Cancer Res. 62: 6218-6223, 2002. PubMed: 12414650
  8. ^ Anderson, M. A., Jodoin, J. N., Lee, E., Hales, K. G., Hays, T. S., Lee, L. A. Asunder is a critical regulator of dynein-dynactin localization during Drosophila spermatogenesis. Molec. Biol. Cell 20: 2709-2721, 2009. PubMed: 19357193
  9. ^ "UniProt, Q9NVM9". Pristupljeno 7. 8. 2021.
  10. ^ Lee, L. A., Lee, E., Anderson, M. A., Vardy, L., Tahinci, E., Ali, S. M., Kashevsky, H., Benasutti, M., Kirschner, M. W., Orr-Weaver, T. L. Drosophila genome-scale screen for PAN GU kinase substrates identifies Mat89Bb as a cell cycle regulator. Dev. Cell 8: 435-442, 2005. PubMed: 15737938
  11. ^ Jodoin, J. N., Shboul, M., Sitaram, P., Zein-Sabatto, H. Human Asunder promotes dynein recruitment and centrosomal tethering to the nucleus at mitotic entry. Molec. Biol. Cell 23: 4713-4724, 2012. PubMed: 23097494

Dopunska literatura

uredi