Ljudski gen API5 kodira protein apoptozni inhibitor 5.[5][6]

API5
Dostupne strukture
PDBPretraga ortologa: PDBe RCSB
Spisak PDB ID kodova

3U0R, 3V6A

Identifikatori
AliasiAPI5
Vanjski ID-jeviOMIM: 609774 MGI: 1888993 HomoloGene: 4809 GeneCards: API5
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 11 (čovjek)
Hrom.Hromosom 11 (čovjek)[1]
Hromosom 11 (čovjek)
Genomska lokacija za API5
Genomska lokacija za API5
Bend11p12Početak43,311,963 bp[1]
Kraj43,344,529 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 2 (miš)
Hrom.Hromosom 2 (miš)[2]
Hromosom 2 (miš)
Genomska lokacija za API5
Genomska lokacija za API5
Bend2|2 E1Početak94,242,027 bp[2]
Kraj94,268,481 bp[2]
Ontologija gena
Molekularna funkcija fibroblast growth factor binding
GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
vezivanje sa RNK
Ćelijska komponenta citoplazma
spliceosomal complex
membrana
jedro
nuclear speck
Biološki proces negative regulation of fibroblast apoptotic process
negative regulation of apoptotic process
GO:0097285 apoptoza
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_001142930
NM_001142931
NM_001243747
NM_006595

NM_007466
NM_001305258
NM_001349003

RefSeq (bjelančevina)

NP_001136402
NP_001136403
NP_001230676
NP_006586

NP_001292187
NP_031492
NP_001335932

Lokacija (UCSC)Chr 11: 43.31 – 43.34 MbChr 2: 94.24 – 94.27 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Ovaj gen kodira inhibitorni protein apoptoze, čija ekspresija sprječava apoptozu nakon lišavanja faktora rasta. ovaj protein potiskuje apoptozu izazvanu transkripcijskim faktorom E2F1, a također stupa u interakciju i negativno regulira acinus, jedarni faktor koji je uključen u apopto fragmentacijutskku DNK . Njegovo iscrpljivanje pojačava citotoksično djelovanje hemoterapijskih lijekova. Kristalna struktura API5 pokazala je funkciju interakcije protein-protein.[7]

Bolesti povezane sa API5 uključuju adenokarcinom debelog crijeva i rak grlića materice.

API5 funkcionira u eksportu jedarne iRNK.[8]

Aminokiselinska sekvenca

uredi

Dužina polipeptidnog lanca je 524 aminokiseline, a molekulska težina 59.005 Da.[9].

1020304050
MPTVEELYRNYGILADATEQVGQHKDAYQVILDGVKGGTKEKRLAAQFIP
KFFKHFPELADSAINAQLDLCEDEDVSIRRQAIKELPQFATGENLPRVAD
ILTQLLQTDDSAEFNLVNNALLSIFKMDAKGTLGGLFSQILQGEDIVRER
AIKFLSTKLKTLPDEVLTKEVEELILTESKKVLEDVTGEEFVLFMKILSG
LKSLQTVSGRQQLVELVAEQADLEQTFNPSDPDCVDRLLQCTRQAVPLFS
KNVHSTRFVTYFCEQVLPNLGTLTTPVEGLDIQLEVLKLLAEMSSFCGDM
EKLETNLRKLFDKLLEYMPLPPEEAENGENAGNEEPKLQFSYVECLLYSF
HQLGRKLPDFLTAKLNAEKLKDFKIRLQYFARGLQVYIRQLRLALQGKTG
EALKTEENKIKVVALKITNNINVLIKDLFHIPPSYKSTVTLSWKPVQKVE
IGQKRASEDTTSGSPPKKSSAGPKRDARQIYNPPSGKYSSNLGNFNYEQR
GAFRGSRGGRGWGTRGNRSRGRLY

Reference

uredi
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000166181 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000027193 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ Tewari M, Yu M, Ross B, Dean C, Giordano A, Rubin R (septembar 1997). "AAC-11, a novel cDNA that inhibits apoptosis after growth factor withdrawal". Cancer Research. 57 (18): 4063–9. PMID 9307294.
  6. ^ "Entrez Gene: API5 apoptosis inhibitor 5".
  7. ^ Han BG, Kim KH, Lee SJ, Jeong KC, Cho JW, Noh KH, Kim TW, Kim SJ, Yoon HJ, Suh SW, Lee S, Lee BI (mart 2012). "Helical repeat structure of apoptosis inhibitor 5 reveals protein-protein interaction modules". The Journal of Biological Chemistry. 287 (14): 10727–37. doi:10.1074/jbc.M111.317594. PMC 3322819. PMID 22334682.
  8. ^ Bong SM, Bae SH, Song B, Gwak H, Yang SW, Kim S, Nam S, Rajalingam K, Oh SJ, Kim TW, Park S, Jang H, Lee BI (2020). "Regulation of mRNA Export Through API5 and Nuclear FGF2 Interaction". Nucleic Acids Res. 48 (11): 6340–6352. doi:10.1093/nar/gkaa335. PMC 7293033. PMID 32383752.
  9. ^ "UniProt, Q9BZZ5". Pristupljeno 15. 8. 2021.

Dopunska literatura

uredi