AlkB homolog 3 alfa-ketoglutarat dioksigenaze je protein koji je kod ljudi kodiran genom ALKBH3.[5]

ALKBH3
Dostupne strukture
PDBPretraga ortologa: PDBe RCSB
Spisak PDB ID kodova

2IUW

Identifikatori
AliasiALKBH3
Vanjski ID-jeviOMIM: 610603 MGI: 1916363 HomoloGene: 16393 GeneCards: ALKBH3
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 11 (čovjek)
Hrom.Hromosom 11 (čovjek)[1]
Hromosom 11 (čovjek)
Genomska lokacija za ALKBH3
Genomska lokacija za ALKBH3
Bend11p11.2Početak43,880,811 bp[1]
Kraj43,920,274 bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 2 (miš)
Hrom.Hromosom 2 (miš)[2]
Hromosom 2 (miš)
Genomska lokacija za ALKBH3
Genomska lokacija za ALKBH3
Bend2|2 E1Početak93,810,895 bp[2]
Kraj93,841,152 bp[2]
Ontologija gena
Molekularna funkcija GO:0001948, GO:0016582 vezivanje za proteine
L-ascorbic acid binding
dioxygenase activity
vezivanje iona metala
DNA-N1-methyladenine dioxygenase activity
oxidoreductase activity
ferrous iron binding
mRNA N1-methyladenosine dioxygenase activity
2-oxoglutarate-dependent dioxygenase activity
cytosine C-5 DNA demethylase activity
Ćelijska komponenta jedro
mitohondrija
nukleoplazma
citoplazma
citosol
Biološki proces Ćelijska proliferacija
cellular response to DNA damage stimulus
DNA dealkylation involved in DNA repair
oxidative single-stranded DNA demethylation
oxidative single-stranded RNA demethylation
GO:0100026 Popravka DNK
Izvori:Amigo / QuickGO
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_139178

NM_026944

RefSeq (bjelančevina)

NP_631917

NP_081220

Lokacija (UCSC)Chr 11: 43.88 – 43.92 MbChr 2: 93.81 – 93.84 Mb
PubMed pretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

Aminokiselinska sekvenca

uredi

Dužina polipeptidnog lanca je 286 aminokiselina, a molekulska težina 33.375 Da.[6]

1020304050
MEEKRRRARVQGAWAAPVKSQAIAQPATTAKSHLHQKPGQTWKNKEHHLS
DREFVFKEPQQVVRRAPEPRVIDREGVYEISLSPTGVSRVCLYPGFVDVK
EADWILEQLCQDVPWKQRTGIREDITYQQPRLTAWYGELPYTYSRITMEP
NPHWHPVLRTLKNRIEENTGHTFNSLLCNLYRNEKDSVDWHSDDEPSLGR
CPIIASLSFGATRTFEMRKKPPPEENGDYTYVERVKIPLDHGTLLIMEGA
TQADWQHRVPKEYHSREPRVNLTFRTVYPDPRGAPW

Funkcija

uredi

AlkB protein Escherichia coli štiti od citotoksičnosti metilacijskih agenasa, popravljanjem specifičnih molekulskih lezija DNK, nastalih u jednolančanoj DNK. ALKBH2 (MIM 610602) i ALKBH3 su homolozi AlkB-a 'E. coli koji kataliziraju uklanjanje 1-metiladenina i 3-metilcitozina (Duncan et al., 2002 PubMed 12486230]).

Reference

uredi
  1. ^ a b c GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000166199 - Ensembl, maj 2017
  2. ^ a b c GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000040174 - Ensembl, maj 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^ "Entrez Gene: AlkB homolog 3, alpha-ketoglutaratedependent dioxygenase". Pristupljeno 4. 3. 2017.
  6. ^ "UniProt, Q96Q83". Pristupljeno 15. 8. 2021.

Dopunska literatura

uredi