Entrez
Entrez全局查询跨数据库搜索系统是一个联合搜寻引擎。它能让使用者能一次搜寻NCBI网站上的许多不同的健康科学数据库[1]。该数据库能快速搜寻蛋白质的一级结构、高级结构，以及相关的参考资料。Entrez系统同时还提供基因的序列信息以及染色体定位。另外，可以从Entrez系统上获取一些教材。其名称“Entrez”（源自法语，意思为“进来吧！”）旨在表现该数据库欢迎公众搜寻NLM（国家医学图书馆）的内容的热情。
数据库
[编辑]Entrez会在下列数据库中进行搜寻：
- PubMed
- PMC（PubMed Central免费获取PubMed上的文章全文）
- 站点搜寻：NCBI网页以及FTP
- 在线图书
- 人类孟德尔遗传学 (OMIM)
- 核酸序列数据库 (GenBank)
- 蛋白质序列数据库
- Genome：人全基因组序列以及染色体定位
- Structure：大分子三维结构
- Taxonomy: GenBank中生物的分类学
- SNP:单核苷酸多态性
- Gene:[2]基因以及相关信息
- HomoloGene：真核生物同源群
- PubChem 小分子化学结构
- PubChem Substance（PCS）: 化学物质信息
- 基因组计划：基因组计划信息
- UniGene：转录序列的基因导向簇
- CDD：保守的蛋白质结构域数据库
- PopSet：群体研究资料集(流行病学)
- GEO Profiles：基因表现以及表现水平的数据
- GEO DataSets: GEO数据的实验数据集
- Sequence read archive（序列读取存盘）：高通量测序数据
- Cancer Chromosomes（癌症染色体）：细胞遗传学数据库cytogenetic databases
- PubChem BioAssay（PubChem生物测定）：化学物质的生物活性背景bioactivity screens of chemical substances
- Probe：序列特异性试剂
- NLM Catalog: NLM目录，包括总数达120万的期刊、图书、多媒体资料、计算机软件、电子资源，以及其他一些LocatorPlus上的资源，每周都会更新。
使用
[编辑]除了直接使用Entrez搜寻全局资料外，NCBI还提供了Entrez的编程工具[3]（eUtils）。使用这个工具能得到更精确的结果。
历史
[编辑]1991年，Entrez数据库以CD的形式开始运作。1993年，Entrez建立了因特网上的数据库。1994年，NCBI建立了网站，Entrez也自然成为网站的一部分。2001年，Entrez暑假上线。2003年，NCBI开发了Entrez基因数据库[4]。
参考
[编辑]- ^ NCBI Resource Coordinators. Database resources of the National Center for Biotechnology Information. Nucleic Acids Research. 2012, 41 (Database issue): D8–D20. PMC 3531099
. PMID 23193264. doi:10.1093/nar/gks1189.
- ^ Home - Gene - NCBI. [2017-01-25]. （原始内容存档于2017-01-24）.
- ^ Entrez Utilities. [2017-01-25]. （原始内容存档于2017-01-18）.
- ^ Smith, Kent. A Brief History of NCBI’s Formation and Growth. The NCBI Handbook [Internet]. 2nd edition. [3 May 2014]. （原始内容存档于2019-01-13）.
