1.

 ________ is commonly used as an oxidizing agent in catabolic pathways while ________ is commonly 
used as a reducing agent in anabolic pathways.
NAD+/FAD;NADH 

2.A substitution mutation occurs in the GRE (glucocorticoid response element) making it unrecognizable to
the glucocorticoid receptor. What impact would this have on the transcription of the gene downstream of 
this element?
Prohibit the cell from reproduction and lead to death, Moreover, if the mutation occurs in the region of the 
gene where transcriptional machinery binds to the protein, the mutation can affect the binding of the 
transcription factors because the short nucleotide sequences recognized by the transcription factors will be 
altered. Mutations in this region can affect rate of efficiency of gene transcription, which in turn can alter 
levels of mRNA and, thus, protein levels in general.  If the mutation occurs in the region of the gene where 
transcriptional machinery binds to the protein, the mutation can affect the way in which transcription 
factors bind to the protein. The mechanisms of transcription bind to a protein through recognition of short 
nucleotide sequences. A mutation in this region may alter these sequences and, thus, change the way the 
transcription factors bind to the protein. 

3. In the liver, at the same time that epinephrine activates the β­receptors it also binds to  α1­receptors, 

m
which leads to:

er as
>The phosphorylation and inactivation of glycogen synthase >The activation of phosphorylase kinase by 

co
Ca++­calmodulin >The increase in inositol trisphosphate and release of Ca++ from the endoplasmic 

eH w
reticulum >The activation of phospholipase C and the production of diacylglycerol 

o.
4.When the pancreatic beta cells sense an increase in glucose, the release of insulin is facilitated through 
rs e
which of the following mechanisms?
ou urc
Increase in intracellular Ca2+ 

5.Which of the following types of tissue can use glucose, but not fatty acids, as a source of fuel? Brain 
o

tissue, red blood cells 
aC s

6.Inositol triphosphate (IP3) binds to _______ channels in the endoplasmic reticulum while diacylglycerol 
vi y re

(DAG) activates ___________.
ligand­gated Ca2+ channels, the influx of extracellular cations in T­lymphocytes OR protein kinase C 

7.When Ca++ increases in muscle cells, muscle contracts and all of the following happen EXCEPT:
ed d

Isocitrate dehydrogenase and alpha­keto glutarate dehydrogenase are allosterically activated by 
increases in NADH 
ar stu

What is the oxidizing agent? Whichever product is reduced, i.e. gains an electron (­ / H+) 
is

9.The primary GLUT transporter used by the liver is ____________ and the primary GLUT transporter 
used by the skeletal muscle is _______________: GLUT 2; GLUT 4
Th

 10. You have identified a mutation in the c subunit in the ATP synthase. The mutation changes the 
glutamate residue, (that facilitates proton pumping into the mitochondrial matrix), to a glycine. The 
inability to dissipate the proton gradient will have which of the following impacts on the electron transport 
sh

chain? decreased ATP synthesis 

12.The mechanism of action of the pyruvate dehydrogenase complex (PDC) relies on the use of three 
prosthetic groups in the enzyme active site. Which of the following lists these three groups in the order that 
they are utilized during the oxidation of pyruvate?
1.E1: Pyruvate dehydrogenase which uses thiamine pyrophosphate (TPP) as its prosthetic group.  2.E2: 
Dihydrolipoyl transacetylase which uses lipoamide and coenzyme A (also known as coASH) as its 

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 prosthetic groups. 3.E3: Dihydrolipoyl dehydrogenase which uses flavin adenine dinucleotide (FAD) and 
nicotinamide adenine dinucleotide (NAD+) as its cofactors. 

13.When glucagon binds its receptor there is an increase in the second messenger, cAMP. cAMP levels can
be decreased by which of the following enzymes?
cAMP­dependent phosphodiesterase 

14.NADPH is used by most cells as:
A reducing agent in detoxification reactions 

15.Certain conditions such as excessive alcohol consumption can increase the ratio of NADH/NAD+ in the 
mitochondria. This will directly inhibit which of the following enzymes?
PDC­ Pyruvate Dehydrogenase Complex 

16.The addition of rotenone to the electron transport chain will do all of the following EXCEPT:
inhibits transfer of electrons from complex 1 to CoQ (prevents NADH from entering complex 1); ­H+ 
movement ceases, ­ATP not synthesized 

m
17.Which of the following statements best describes the action of epinephrine? increased release of 

er as
glucose 

co
eH w
18.All of the following are disaccharides EXCEPT: ARE disaccharides: Lactose, Maltose, Sucrose NOT: 
Agarose, Cellulose, Chitin, Glycogen, Insulin 

o.
rs e
19.Which of the following activators is correctly paired with the glycolytic or TCA cycle enzyme that it 
ou urc
activates?
Glycolytic: Hexokinase (1,2,3,4 glucokinase), phosphoglucose isomerase, phosphofructokinase, fructose­
biphosphate aldolase, triosephosphate isomerase, glyceraldehyde 3­phosphate dehydrogenase, 
o

phosphoglycerate kinase, phosphoglycerate mutase, enolase, pyruvate kinase. 2­phosphoglycerate, 
phosphoenolpyruvate; Glucose 6­phosphate, Fructose 6­phosphate; dihydroxylacetone phosphate, 
aC s

glyceraldehyde 3­phosphate. TCA cycle: Pyruvate Dehydrogenase Complex (PDH)/ acetyl­CoA/Ca2+; 
vi y re

Citrate Synthase/acetyl coA; Isocitrate Dehydrogenase/ ADP and NAD+; alpha Ketoglutarate 
Dehydrogenase Complex/ 

20.Following a meal, fructose 2, 6 bisphosphate levels will be elevated in the liver. Under these metabolic 
ed d

conditions, all of the following enzymes will be active EXCEPT:
Protein kinase A, PFK2 
ar stu

21.When a muscle cell contracts, all of the following will increase glycogenolysis EXCEPT:
is

WILL INCREASE: Increase in Ca2+ calmodulin, Increase in epinephrine, Increase in cAMP
Th

 22. Given the following enzyme pathway, A→B→C→D And given that the ΔG0' for A→B is ­8; for 
B→C is +6; and for C→D is +1 Then the ΔG0' for A→D is: ­1

 23.Hereditary fructose intolerance (HFI) is a rare recessive disorder that is caused by a mutation in the 
sh

aldolase B gene. As a result of this disorder individuals may have all of the following symptoms
SYMPTOMS INCLUDE: low blood sugar (hypoglycemia), especially after eating fruits, fructose, 
sucrose, jaundice, excessive sleepiness, convulsions, irritability 

24. Under conditions of strenuous exercise, gluconeogenesis occurs primarily in the _______ using 
_______ formed in the skeletal muscle. liver; lactate 

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 25.In the red blood cell, glucose can be oxidized to two primary products. One of the oxidation products is 
ribulose 5­phosphate, and the other is which of the following compounds? Lactate

 26.Several TCA cycle intermediates can be used as a substrate for the synthesis of other compounds. 
Succinyl CoA is an intermediate that is directly used for the synthesis of which of the following 
compounds? porphyrin, heme,and ketone body biosynthesis 

27.Under conditions when a cell only needs to use the nonoxidative portion of the pentose phosphate 
pathway to synthesize ribose 5­phosphate, the elevated levels of NADPH in the cell will inhibit which of 
the following enzymes? Ribose 5­P only needed, so only the nonoxidative reactions. High NADPH 
inhibits glucose­6­phosphate dehydrogenase, so transketolase and transaldolase are used to convert fructose
6­P and glyceraldehyde 3­P to ribose 5­P. 

28.A newly characterized inducible operon is regulated by levels of iron. In this system, iron is determined 
to function as the inducer. When iron levels are elevated which of the following will occur? The 
inducer combines with the repressor and inactivates the repressor. 

29.In the liver, the pyruvate dehydrogenase complex (PDC) would be dephosphorylated and active when 

m
which of the following compounds or hormones is elevated? Glucagon 

er as
co
30.The enzyme in the TCA cycle that catalyzes a substrate level phosphorylation is Succinate 

eH w
thiokinase 

o.
31.Phenylketonuria (PKU) is an autosomal recessive disorder that can be caused by a defect in 
rs e
phenylalanine hydroxylase. Phenylketonuria can also present due to a deficiency in which of the following 
ou urc
vitamins or cofactors? tetrahydrobiopterin (BH4) 

32. An individual with a deficiency in Pyruvate Dehydrogenase Complex (PDC) will have elevated levels 
o

of which metabolite after consuming a meal high in carbohydrates? Lactate 
aC s

33.Chronic smokers have an elevation of guanine residues associated with a benzopyrene ring. This bulky 
vi y re

distortion to the DNA is repaired through which of the following mechanisms? Nucleotide Excision 
Repair 

34.Glycogen synthesis and degradation in the liver and muscle is very similar. Which of the following 
ed d

enzymes is NOT used in both muscle and liver for these metabolic pathways? G6Pase (Glucose 6 
Phosphatase) 
ar stu

35.A 3­year­old boy who presented with generalized hypotonia, severe psychomotor development delay, 
and severe lactic acidosis following ingestion of a high carbohydrate meal was diagnosed with a deficiency 
is

in pyruvate dehydrogenase (X­linked recessive). Supplementation of which vitamin may be beneficial to 
this individual: Vitamin D
Th

 36.All of the following statements are true with regards to the malate­aspartate shuttle EXCEPT:
electrons enter the electron transport chain of the mitochondria via reduction equivalents to 
generate ATP. The shuttle system is required because the mitochondrial inner membrane is impermeable to
sh

NADH, the primary reducing equivalent of the electron transport chain. To circumvent this, malate carries 
the reducing equivalents across the membrane. The shuttle consists of four protein parts:  malate 
dehydrogenase in the mitochondrial matrix and intermembrane space.  aspartate aminotransferase in the 
mitochondrial matrix and intermembrane space.  malate­alpha­ketoglutarate antiporter in the cytosol.  
glutamate­aspartate antiporter in the inner membrane 

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 37.All of the following are part of the Cori Cycle EXCEPT: ATP is produced by the conversion of 
lactate to glucose 

38.Which of the following intermediates is a feed­forward activator of pyruvate kinase? Fructose­1,6­ 
bisphosphate 

39.Within the red blood cell, NADPH is required for which of the following processes? Reducing 
glutathione (protection against oxidative stress) 

40.A thiamine deficiency will result in decreased activity of: Pyruvate dehydrogenase; transketolase 
41.During an overnight fast, which of the following pathways is the primary source of glucose required for 
the maintenance of blood glucose levels? Liver glycogen is broken down for gluconeogenesis. 

42.Dinitrophenol is an uncoupler of the electron transport chain. The addition of dinitrophenol will have 
which of the following impacts to the cell? Increase oxygen consumption 

43.Insulin is a peptide hormone secreted by the beta cells of the pancreas in response to elevated levels of 
blood glucose. Locally, insulin will inhibit the release of glucagon from alpha cells in the pancreas, and it 

m
will also impact the metabolism of many peripheral tissues. The actions of insulin are best described as 

er as
which of the following? Insulin acts as a messenger to instruct the body's cells to absorb glucose, in 

co
effect reducing blood glucose levels. 

eH w
44. Which of the following is true regarding single point mutations to a genomic DNA sequence? single 

o.
nucleotide changes to the DNA sequence may have no impact on the primary sequence of a protein
rs e
ou urc
 45.The oxidation of glucose produces NADH. NADH can be oxidized in the mitochondria and in this 
process the terminal electron acceptor in the electron transport chain is which of the following compounds?
O2 
o

46.A 2­year­old boy is recently diagnosed with red­green color blindness which is an X­linked recessive 
aC s

disorder. If neither of his parents are colorblind what is the chance that this boy's sister is colorblind?
vi y re

0% 

47.Which of the following hormones binds to a receptor tyrosine kinase? Peptide/protein hormones;
nerve growth factor (NGF), platelet­derived growth factor (PDGF), fibroblast growth factor (FGF), 
ed d

epidermal growth factor (EGF), and insulin. 
ar stu

48.Besides its role in glycogen synthesis, which of the following directly relies on UDP­glucose?
Galactose Metabolism 
is

49.Under fasting conditions, individuals with a deficiency in hepatic glucose 6­phosphatase can not 
dephosphorylate glucose 6­phosphate generated from liver glycogenolysis. As a result of this disorder, 
Th

which of the following is most likely to occur in this individual when the ratio of insulin to glucagon is 
low? Glucose 6­P ­­> glucose, not occurring Free glucose is not being produced, so glucose can't leave 
the cell to raise blood glucose levels. 
sh

50.There are several anaplerotic reactions required to replenish intermediates of the TCA cycle. All of the 
following compounds can be be used for these anaplerotic reactions EXCEPT: CAN BE USED: 
Pyruvate, Aspartate, Glutamate, Beta Oxidation of fatty acids, adenylosuccinate; PEP carboxylase and 
malate dehydrogenase; Glutamine

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