Bioinformatik: Biofizik & Biokimia Molekul 447b3 / 747b3

M Gerstein, http://bioinfo.mbb.yale.
edu/course
Biofizik & Biokimia Molekul

447b3 / 747b3
Bioinformatik
Mark Gerstein
Kelas # 1, 1/12/98
Universiti Yale
1
M Gerstein, http://bioinfo.mbb.yale.edu/course
Apa itu Bioinformatik?
• (Molekul) Bio - informatik

• Satu idea untuk definisi?
Bioinformatika mengkonseptualisasikan biologi dari
segi molekul (dalam pengertian fizikal-kimia) dan
kemudian menerapkan teknik "informatika" (berasal
dari disiplin seperti matematik terapan, CS, dan
statistik) untuk memahami dan mengatur maklumat
yang berkaitan dengan molekul ini, pada yang
berskala besar.
• Bioinformatik adalah "MIS" untuk
Maklumat Biologi Molekul
2
Biologi Molekul sebagai

Sains Maklumat
• Dogma Tengah • Paradigma Tengah

Biologi Molekul untuk Bioinformatik

DNA Maklumat Urutan Genom

-> RNA
-> Urutan Protein

-> Protein
-> Struktur Protein

-> Fungsi Protein

-> Fenotaip
-> Fenotaip

-> DNA
• Molekul • Banyak Maklumat

◊ Urutan, Struktur, ◊ Piawai

Fungsi ◊ Statistik
• Proses
◊ Mekanisme, Kekhususan, (idea dari D Brutlag, Stanford)

Peraturan
3
Maklumat Biologi Molekul - DNA
• Urutan DNA mentah atggcaattaaaattggtatcaatggttttggtcgtatcggccgtatcgtattccgtgc

◊ Pengekodan atau Tidak? gcacaacaccgtgatgacattgaagttgtaggtattaacgacttaatcgacgttgaatac
atggcttatatgttgaaatatgattcaactcacggtcgtttcgacggcactgttgaagt
◊ Dihuraikan ke dalam gen? aaagatggtaacttagtggttaatggtaaaactatccgtgtaactgcagaacgtgatcc
gcaaacttaaactggggtgcaatcggtgttgatatcgctgttgaagcgactggtttattc
◊ 4 asas: AGCT ttaactgatgaaactgctcgtaaacatatcactgcaggcgcaaaaaaagttgtattaact

ggcccatctaaagatgcaacccctatgttcgttcgtggtgtaaacttcaacgcatacgc
ggtcaagatatcgtttctaacgcatcttgtacaacaaactgtttagctcctttagcacgt
◊ ~ 1 K dalam gen, gttgttcatgaaactttcggtatcaaagatggtttaatgaccactgttcacgcaacgact
gcaactcaaaaaactgtggatggtccatcagctaaagactggcgcggcggccgcggtgc
tcacaaaacatcattccatcttcaacaggtgcagcgaaagcagtaggtaaagtattacct
~ 2 M dalam genom gcattaaacggtaaattaactggtatggctttccgtgttccaacgccaaacgtatctgtt
gttgatttaacagttaatcttgaaaaaccagcttcttatgatgcaatcaaacaagcaatc
aaagatgcagcggaaggtaaaacgttcaatggcgaattaaaaggcgtattaggttacact
gaagatgctgttgtttctactgacttcaacggttgtgctttaacttctgtatttgatgc
gacgctggtatcgcattaactgattctttcgttaaattggtatc. . .
. . . caaaaatagggttaatatgaatctcgatctccattttgttcatcgtattcaa
caacaagccaaaactcgtacaaatatgaccgcacttcgctataaagaacacggcttgtg
cgagatatctcttggaaaaactttcaagagcaactcaatcaactttctcgagcattgctt
gctcacaatattgacgtacaagataaaatcgccatttttgcccataatatggaacgttg
gttgttcatgaaactttcggtatcaaagatggtttaatgaccactgttcacgcaacgact
acaatcgttgacattgcgaccttacaaattcgagcaatcacagtgcctatttacgcaacc
aatacagcccagcaagcagaatttatcctaaatcacgccgatgtaaaaattctcttcgtc
ggcgatcaagagcaatacgatcaaacattggaaattgctcatcattgtccaaaattaca
aaaattgtagcaatgaaatccaccattcaattacaacaagatcctctttcttgcacttg
Maklumat Biologi Molekul:
Urutan Protein
• Huruf 20 huruf
◊ ACDEFGHIKLMNPQRSTVWY tetapi tidak BJOUXZ
• Rentetan ~ 300 aa dalam protein purata (dalam

bakteria), ~ 200 aa dalam domain
• ~ 200 K urutan protein yang diketahui
d1dhfa_
LNCIVAVSQ NM GIGKNGDLPW PP LRNEFRYFQRMT TTSSVEGKQ- NLVIMGKKTWFSI
d8dfr__ LNSIVAVCQ NM GIGKDGNLPW PP LRNEYKYFQRMT STSHVEGKQ- NS
d4dfra_ISLIAALAV DR VIGMENAMPW N- LPADLAWFKRNT L --------N KPVIMGRHTWESI
d3dfr__TAFLWAQDR DG LIGKDGHLPW H- LPDDLHYFRAQT V --------G KIMVVGRRTYESF
d1dhfa_
LNCIVAVSQ NM GIGKNGDLPW PP LRNEFRYFQRMT TTSSVEGKQ- NLVIMGKKTWFSI
d8dfr__ LNSIVAVCQ NM GIGKDGNLPW PP LRNEYKYFQRMT STSHVEGKQ- NS
d4dfra_ISLIAALAV DR VIGMENAMPW -N LPADLAWFKRNT LD-------- KPVIMGRHTWESI
d3dfr__TAFLWAQDR NG LIGKDGHLPW -H LPDDLHYFRAQT VG-------- KIMVVGRRTYESF
d1dhfa_ VPEKNRP LKGRINLVLS RELKEP PQGA H FLSRSLDDALKLTE QPELANKVD

MVWIVGGSSVYKEAM NHP d8dfr__ VPEKNRP LKDRINIVLS RELKEA PKGA H YLSKSLDDALALLD
SPELKSKVD MVWIVGGTAVYKAAM EKP d4dfra_
--- G-RP LPGRKNIILS -SQPGT DDRV - TWVKSVDEAIAACG DVP ------ EIMVIGGGRVYEQFL PKA
d3dfr__ --- PKRP LPERTNVVLT HQEDYQ AQGA - VVVHDVAAVFAYAK QHLDQ ---- ELVIAGGAQIFTAFK DDV
d1dhfa_
-PEKNRP LKGRINLVLS RELKEP PQGA H FLSRSLDDALKLTE QPELANKVD MVWIVGGSSVYKEAM NHP
d8dfr__
-PEKNRP LKDRINIVLS RELKEA PKGA H YLSKSLDDALALLD SPELKSKVD MVWIVGGTAVYKAAM EKP
d4dfra_-G--- RP LPGRKNIILS SSQPGT DDRV - TWVKSVDEAIAACG DVPE----- IMVIGGGRVYEQFL PKA
d3dfr__-P --KRP LPERTNVVLT HQEDYQ AQGA - VVVHDVAAVFAYAK QHLD ---- Q ELVIAGGAQIFTAFK DDV

Struktur Makromolekul
• DNA / RNA / Protein
◊ Hampir semua protein
(RNA Diadaptasi Dari Halaman Web D Soll,
Protein Tangan Kanan dari laman web M Levitt)
6

Perincian Struktur Protein
• Statistik Bilangan kembar tiga XYZ
Resid 200 residu / domain -> 200 atom CA, dipisahkan oleh 3,8 A
◊ Purata Residue adalah Leu: 4 atom tulang belakang + 4 atom rantai sisi, 150 kubik A.
• => ~ 1500 xyz triplet (= 8x200) setiap domain protein
Known 10 K domain yang diketahui, ~ 300 lipatan
ATOM 1 C ACE 0 9,401 30,166 60,595 1.00 49.88 1GKY 67

ATOM 2 O ACE 0 10,432 30,832 60,722 1.00 50.35 1GKY 68
ATOM 3 CH3 ACE 0 8,876 29,767 59,226 1.00 50.04 1GKY 69
ATOM 4 N SER 1 8,753 29,755 61,685 1.00 49.13 1GKY 70
ATOM 5 CA SER 1 9,242 30,200 62,974 1.00 46.62 1GKY 71
ATOM 6 C SER 1 10,453 29,500 63,579 1.00 41.99 1GKY 72
ATOM 7 O SER 1 10,593 29,607 64,814 1.00 43.24 1GKY 73
ATOM 8 CB SER 1 8052 30,189 63,974 1.00 53.00 1GKY 74
ATOM 9 OG SER 1 7,294 31.409 63,930 1.00 57.79 1GKY 75
ATOM 10 N ARG 2 11,360 28,819 62,827 1.00 36.48 1GKY 76
ATOM 11 CA ARG 2 12,548 28,316 63,532 1.00 30.20 1GKY 77
ATOM 12 C ARG 2 13,502 29,501 63,500 1.00 25.54 1GKY 78
...
ATOM 1444 CB LYS 186 13,836 22,263 57,567 1.00 55.06 1GKY1510
ATOM 1445 CG LYS 186 12,422 22,452 58,180 1.00 53.45 1GKY1511
ATOM 1446 CD LYS 186 11,531 21,198 58,185 1.00 49.88 1GKY1512
ATOM 1447 CE LYS 186 11,452 20,402 56,860 1.00 48.15 1GKY1513
ATOM 1448 NZ LYS 186 10,735 21,104 55,811 1.00 48.41 1GKY1514
ATOM 1449 OXT LYS 186 16,887 23,841 56,647 1.00 62.94 1GKY1515
TER 1450 LYS 186 1GKY1516

Genom Seluruh
• Revolusi Memacu Segala-galanya
Fleischmann , RD, Adams, MD, White, O., Clayton, RA, Kirkness, EF,
Kerlavage, AR, Bult, CJ, Tomb, JF, Dougherty, BA, Merrick, JM, McKenney, K.,
Sutton, G., Fitzhugh, W., Fields, C., Gocayne, JD, Scott, J., Shirley, R., Liu, LI, Glodek, A.,
Kelley, JM, Weidman, JF, Phillips, CA, Spriggs, T., Hedblom, E., Cotton, MD,
Utterback, TR, Hanna, MC, Nguyen, DT, Saudek, DM, Brandon, RC, Fine, LD,
Fritchman, JL, Fuhrmann, JL, Geoghagen, NSM, Gnehm, CL, McDonald, LA, Kecil,
Venter , JC ( 1995 ). " Penjujukan dan

KV, Fraser, CM, Smith, HO &
penyusun secara rawak seluruh genom Haemophilus influenzae rd."
Sains 269: 496-512.

(Gambar diadaptasi dari laman web
TIGR, http://www.tigr.org)
• Data Integratif
1995, HI (bakteria): 1.6 Mb & 1600 gen selesai
1997, ragi: 13 Mb & ~ 6000 gen untuk ragi
1998: 14 genom selesai!
1998, cacing: 75 daripada 100
Mb dilakukan dengan gen
13 K setakat ini
2003, manusia: gen 3Gb & 100K ... 8


Data Integratif Lain
• Maklumat untuk
memahami genom
◊ Jalur Metabolik
(glikolisis), biokimia
tradisional
◊ Rangkaian Peraturan
Yl Filogeni Seluruh
Organisma, zoologi
tradisional
◊ Persekitaran, Habitat,
ekologi
◊ Kesusasteraan
(PERUBATAN)
• Masa depan ....
(Lukisan laluan dari P Karp's EcoCyc, Phylogeny dari
SJ Gould, Dinosaur in a Haystack)

Redundansi dan Kepelbagaian
• Urutan yang berbeza Mempunyai Struktur yang Sama
• Organisma mempunyai banyak gen yang serupa
• Gen Tunggal Mungkin Mempunyai Pelbagai Fungsi
• Redundansi Urutan Genom kerana Kod Genetik
(idea dari D Brutlag, Stanford)
10
Pertumbuhan Data yang Sesuai
oleh Pembangunan Komputer
Teknologi
Internet
• CPU vs Disk & Net Tuan rumah
Important Sama
pentingnya dengan
peningkatan kelajuan
komputer,
kemampuan
menyimpan
sejumlah besar
maklumat di 4500 140
komputer lebih
Arahan
4000 120
3500
penting lagi 100
(Masa (ns
3000
• Driving Force masuk 2500
2000
80
60
Bioinformatik Bil.

1500
40
CPU
1000
Protein 500 20
(Gambar Internet yang diadaptasi
0 0
Domain dari D Brutlag,
Stanford) 1980 1985 1990 1995
Struktur
11
Paradigma Baru untuk

Pengkomputeran Ilmiah
• Kerana peningkatan data • Fizik
dan peningkatan ◊ Ramalan berdasarkan
komputer, pengiraan baru prinsip fizikal
menjadi mungkin ◊ Penentuan Tepat Lintasan
Roket
• Tetapi Bioinformatik ◊ Superkomputer, CPU
mempunyai gaya pengiraan
baru ... • Biologi
◊ Dua Paradigma ◊ Mengklasifikasikan
maklumat dan menemui
hubungan yang tidak
dijangka
◊ globin ~ colicin ~
plastocyanin ~ penindas
◊ rangkaian, pangkalan data "gabungan"
12
Jenis Umum "Informatik"

dalam Bioinformatik
• Pangkalan data • Geometri
◊ Bangunan, Pertanyaan ◊ Robotik
◊ Objek DB ◊ Grafik (Permukaan, Isipadu)
◊ Perbandingan dan
• Perbandingan Rentetan Teks
Pencocokan 3D (Penglihatan,
◊ Carian Teks
pengiktirafan)
◊ Penjajaran 1D
◊ Statistik Kepentingan
• Simulasi Fizikal
◊ Mekanik Newton
◊ Alta Vista, grep
◊ Elektrostatik
• Mencari Corak ◊ Algoritma Berangka
◊ Pembelajaran AI / Mesin ◊ Simulasi
◊ Pengelompokan
13
Format Kursus
• Bidang Baru, Tidak Disiplin • Projek Akhir

◊ Universal Canon No. ◊ kritikal Ulasan kawasan
◊ Tanpa Latar Belakang Sejagat ◊ Menganalisis Data secara Kritikal
• Perbincangan, BUKAN ◊ Cadangkan Pendekatan Baru
◊ Laksanakan Pendekatan Baru
Format Kuliah
◊ Latar Belakang Teori, Ideas •Pengekodan Komputer
◊ Interaktif ◊ Ringkaskan kawasan secara terperinci
• Pelaksanaan Komputer?
• Demo?
• Penyertaan Kelas
◊ Datang ke kelas! Bertanya soalan
◊ 1-2 Tugasan Ringkas Berkaitan
dengan ini
14
Latar belakang
Matematik Biologi
Perlu Tahu Pengiraan Sisihan Piawai, DNA, RNA, alpha- helix,
Hari Ini Taburan berbentuk inti sel,
Lonceng (skor ujian), ATP
vektor 3D
Apa yang Force adalah Derivatif (grad) Protein dibungkus

Anda akan Tenaga, Matriks Putaran (3D), dengan ketat, urutan
Pelajari nilai P dari 0,01 dan Pengagihan zon senja homologi,
Nilai Ekstrim keluarga protein
Tidak Perlu Persamaan Poisson-Boltzman , Apa yang dilakukan

sama sekali Reka Fungsi Hashing, Tulis oleh GroEL, cacing
Pengurai Keturunan Rekursif adalah metazoa, E.
coli gram negatif,
kemokin apa
15
Kebolehan komputer
• Laman Web Kursus

◊ http://bioinfo.mbb.yale.edu/course
◊ http://bioinfo.mbb.yale.edu/course/survey.txt
◊ [email protected]
◊ Beberapa Kuliah di http://bioinfo.mbb.yale.edu/course/classes
• Perlu membaca dan menulis laman web
◊ Baca sekarang, "pengkodan" HTML akan dijelaskan kemudian
◊ Baca fail PDF melalui pembaca akrobat
• http://www.adobe.com/prodindex/acrobat/readstep.html
◊ Letakkan Projek Akhir di Laman Web Kursus - Galeri Projek
• Pengaturcaraan dalam Pilihan C atau Perl
16
Tinjauan (Tugasan 0!)
• http://bioinfo.mbb.yale.edu/course/survey.txt
17
Masa berubah
• Format Lebih Panjang, Bermula Isnin depan
• Pilihan:
Isnin dan Rabu 9: 30-10: 45 , BUKAN

Jumaat
• Juga mungkin:
Isnin dan Rabu 9: 05-10: 20, BUKAN
Jumaat
18
Had
19
Topik Kursus Khusus - Urutan
• Penjajaran Urutan • Skema pemarkahan

◊ yang tidak tepat yang sepadan dan statistik
rentetan
Pencocokan
◊ Cara menyelaraskan dua tali dengan ◊ Bagaimana untuk mengetahui sama ada
optimum penjajaran atau
◊ melalui Pengaturcaraan Dinamik perlawanan adalah statistik
◊ Penjajaran Tempatan vs Global yang signifikan ◊ A P-nilai (atau
◊ Hashing untuk e-value)?
meningkatkan kelajuan ◊ Taburan Skor (Jauh
(BLAST) nilai.)
◊ Matrik pemarkahan ◊ Urutan Kerumitan Rendah
penggantian asid amino
• Struktur "Ramalan"
• Pelbagai Penjajaran
◊ Ramalan Struktur Sekunder,
dan Konsensus Kecenderungan
◊ Cara menyelaraskan lebih ◊ Penemuan heliks TM
dari satu urutan dan
◊ Tembok, mengapa struktur tersier
kemudian menyatukan
sangat keras?
hasilnya dalam perwakilan
konsensus • Pengiktirafan Lipat
• Threading
◊ HMM, Profil
20
Topik Kursus - Struktur
• Geometri Protein Asas dan • Penjajaran Struktur

Pemasangan ◊ Menyelaraskan urutan
Kuadrat Kurang berdasarkan struktur 3D.
◊ Jarak, Sudut, Paksi, ◊ DP tidak menyatu, tidak
Putaran seperti urutan, apa yang
harus dilakukan?
• Mengira paksi heliks dalam
3D melalui pemasangan ◊ Pendekatan Lain: Matriks
garis Jarak, Hashing
◊ LSQ patut 2 struktur • Simulasi Molekul
◊ Grafik Molekul ◊ Geometri -> Tenaga -> Angkatan
• Pengiraan Isipadu dan Inter Interaksi asas, fungsi
tenaga berpotensi
Permukaan
◊ Bagaimana struktur
◊ Cara mewakili kapal terbang
berubah dari masa ke
◊ Cara mewakili pepejal
masa?
◊ Cara mengira kawasan
• Bagaimana mengukur
◊ Sambungan dan Design perubahan dalam vektor
Drug sebagai Matching (kecerunan)
Surface ◊ Dinamika Molekul & MC
◊ Pengurangan Tenaga 21
Topik Kursus - Pangkalan Data
• Konsep Pangkalan • Penggabungan dan Pokok

Data Perhubungan ◊ Penggabungan asas
◊ Kekunci, Kekunci Asing • UPGMA
◊ SQL, OODBMS, paparan, • hubungan tunggal
bentuk, urus niaga, laporan, • hubungan berganda
indeks ◊ Kaedah Lain
◊ Bergabung dengan Jadual, • Kesunyian,
Normalisasi
Kemungkinan
• Natural Join sebagai maksimum
pilihan "mana" pada ◊ Implikasi evolusi
produk silang
• Rujukan Array (perl / dbm)
• Unit Protein? • Perbandingan Genom

◊ Apakah unit maklumat ◊ Keluarga Ortholog, laluan
biologi? ◊ Banci berskala besar
• urutan, struktur ◊ Analisis Perkataan Kerap
• motif, modul, domain ◊ Anotasi Genom
◊ Bagaimana dikelaskan: 22
lipatan, gerakan, laluan,
fungsi?
Adakah Mereka Atau Bukan Mereka

Bioinformatik? (# 1)
• Perpustakaan Digital
◊ Automated bibliografi Carian dan Teks Perbandingan
◊ Asas pengetahuan untuk sastera biologi
• Penemuan Menggunakan motif Persampelan Gibb
• Kaedah Penentuan Struktur
◊ Kristalografi Komputasi
• Penambahbaikan
◊ Penentuan Struktur NMR
• Geometri Jarak
• Simulasi Laluan Metabolik

• Komputer DNA
23

Bioinformatik? (# 1, Jawapan)
• (YA) Perpustakaan Digital
◊ Automated bibliografi Carian dan Teks Perbandingan
◊ Asas pengetahuan untuk sastera biologi
• (YA) Penemuan Motif Menggunakan Persampelan Gibb
• (TIDAK) Kaedah Penentuan Struktur
◊ Kristalografi Komputasi
• Penambahbaikan
◊ Penentuan Struktur NMR
• (YA) Geometri Jarak
• (YA) Simulasi Laluan Metabolik
• (TIDAK) Komputer DNA
24

• Pengenalan gen melalui pemeriksaan urutan
◊ Ramalan tapak penyambungan
• Kaedah DNA dalam forensik
• Pemodelan Populasi Organisma
◊ Pemodelan Ekologi
• Kaedah Penjujukan Genom
◊ Menyusun Pertandingan
◊ Pemetaan fizikal dan genetik
• Analisis Perkaitan
◊ Menghubungkan gen tertentu dengan pelbagai sifat
25

• (YA) Pengenalan gen melalui pemeriksaan urutan
◊ Ramalan tapak penyambungan
• (YA) Kaedah DNA dalam forensik
• (TIDAK) Pemodelan Populasi Organisma
◊ Pemodelan Ekologi
• (TIDAK?) Kaedah Penjujukan Genom
◊ Menyusun Pertandingan
◊ Pemetaan fizikal dan genetik
• (YA) Analisis Pautan
◊ Menghubungkan gen tertentu dengan pelbagai sifat
26

• Ramalan struktur RNA
Identifikasi mengikut
urutan
• Pemprosesan Imej Radiologi
◊ Perwakilan Komputasi untuk Anatomi Manusia (manusia yang kelihatan)
• Simulasi Kehidupan Buatan
◊ Imunologi Buatan / Keselamatan Komputer
Gor Algoritma genetik dalam biologi molekul
• Pemodelan homologi
• Penentuan Filogeni Berdasarkan
Karakteristik Organisma Bukan molekul
• Diagnosis Berkomputer berdasarkan Analisis Genetik
(Keturunan)

27

• (YA) Ramalan struktur RNA
Identifikasi mengikut urutan
• (TIDAK) Pemprosesan Imej Radiologi
◊ Perwakilan Komputasi untuk Anatomi Manusia (manusia yang kelihatan)
• (TIDAK) Simulasi Kehidupan Buatan
◊ Imunologi Buatan / Keselamatan Komputer
Gor Algoritma genetik dalam biologi molekul
• (YA) Pemodelan homologi
• (TIDAK) Penentuan Filogeni Berdasarkan
Karakteristik Organisma Bukan molekul
• (TIDAK) Diagnosis Berkomputer berdasarkan Genetik
Analisis (Keturunan)

28

Bioinformatik: Biofizik & Biokimia Molekul 447b3 / 747b3

Uploaded by

Copyright:

Available Formats

Bioinformatik: Biofizik & Biokimia Molekul 447b3 / 747b3

Uploaded by

Document Information

Original Description:

Original Title

Copyright

Available Formats

Share this document

Share or Embed Document

Sharing Options

Did you find this document useful?

Is this content inappropriate?

Copyright:

Available Formats

Bioinformatik: Biofizik & Biokimia Molekul 447b3 / 747b3

Uploaded by

Copyright:

Available Formats

M Gerstein, http://bioinfo.mbb.yale.

Bioﬁzik & Biokimia Molekul

Apa itu Bioinformatik?

• (Molekul) Bio - informatik

Biologi Molekul sebagai

• Molekul • Banyak Maklumat

◊ Mekanisme, Kekhususan, (idea dari D Brutlag, Stanford)

Maklumat Biologi Molekul - DNA

• Urutan DNA mentah atggcaattaaaattggtatcaatggttttggtcgtatcggccgtatcgtattccgtgc

◊ 4 asas: AGCT ttaactgatgaaactgctcgtaaacatatcactgcaggcgcaaaaaaagttgtattaact

• Rentetan ~ 300 aa dalam protein purata (dalam

d1dhfa_ VPEKNRP LKGRINLVLS RELKEP PQGA H FLSRSLDDALKLTE QPELANKVD

Maklumat Biologi Molekul:

Maklumat Biologi Molekul:

ATOM 1 C ACE 0 9,401 30,166 60,595 1.00 49.88 1GKY 67

Maklumat Biologi Molekul:

Venter , JC ( 1995 ). " Penjujukan dan

penyusun secara rawak seluruh genom Haemophilus inﬂuenzae rd."

Sains 269: 496-512.

Maklumat Biologi Molekul:

Maklumat Biologi Molekul:

(idea dari D Brutlag, Stanford)

Paradigma Baru untuk

Jenis Umum "Informatik"

• Bidang Baru, Tidak Disiplin • Projek Akhir

Apa yang Force adalah Derivatif (grad) Protein dibungkus

Tidak Perlu Persamaan Poisson-Boltzman , Apa yang dilakukan

• Laman Web Kursus

• Format Lebih Panjang, Bermula Isnin depan

Isnin dan Rabu 9: 30-10: 45 , BUKAN

Topik Kursus Khusus - Urutan

• Penjajaran Urutan • Skema pemarkahan

Topik Kursus - Struktur

• Geometri Protein Asas dan • Penjajaran Struktur

Topik Kursus - Pangkalan Data

• Konsep Pangkalan • Penggabungan dan Pokok

• Unit Protein? • Perbandingan Genom

Adakah Mereka Atau Bukan Mereka

• Simulasi Laluan Metabolik

Adakah Mereka Atau Bukan Mereka

Adakah Mereka Atau Bukan Mereka

Adakah Mereka Atau Bukan Mereka

Adakah Mereka Atau Bukan Mereka

Adakah Mereka Atau Bukan Mereka

You might also like