Int�grer un script python dans du code java

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30/05/2011, 15h13
Thomas77380

Int�grer un script python dans du code java

Bonjour � tous,

je dois int�grer un script python au coeur d'un code java en utilisant ceci:

Code:

String [] cmd2 = new String[]{commande python, arguments = X Y)};

A l'aide de cette commande 2 je dois pouvoir importer mon script python puis lui passer mes diff�rents arguments (X,Y ect....) cependant je n'ai aucune id�e de la mani�re dont je dois importer ce script, je pensais faire un "import nom_de_mon_script" mais dans la partie "commande python" je met quoi ?
Le script en python est une fonction permettant l'affichage de motifs en prenant 2 arguments en entr�e.
30/05/2011, 19h15
laurent_m

Pas tr�s claire comme question ;)

Peut-�tre voir au niveau de JYton qui est une Saveur de python dont le code peut rouler sur la VM JAVA
30/05/2011, 22h04
Thomas77380

En fait peu importe la m�thode j'aimerai pouvoir executer mon script python, j'ai lu quelque tuto sur Jython et j'ai peur que ce soit trop complexe, n'y aurait'il pas une autre solution ?
31/05/2011, 10h47
thelvin

Euh... Java c'est pour programmer en Java, hein... On peut appeler des scripts en d'autres langages, mais la liaison est un peu compliqu�e, forc�ment.
Surtout que Python n'est pas un des langages de scripts int�gr�s � Java.
31/05/2011, 10h51
Thomas77380

Donc je peux abandonner l'id�e d'importer mon script Python dans mon code java ? :?
31/05/2011, 11h05
thelvin

Comme tu veux, mais... Tu trouveras pas plus simple que Jython.

Juste pour info : une fois que la biblioth�que Jython est en place, �a peut s'appeler comme �a : http://wiki.python.org/jython/UserGuide#using-jsr-223

merci pour votre r�ponse, je viens d'installer Jython � l'instant, les seules librairies dont j'ai besoin sont donc celles de l'exemples :

Code:

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import javax.script.ScriptEngine;
import javax.script.ScriptEngineManager;
import javax.script.ScriptException;

?

Le probl�me c'est que dans mon fichier java il n'y a pas de main (alors que c'est � l'interieur de celui ci qu'on appel notre script si j'ai bien compris).

Voici l'extrait du code ou j'aimerais appeler mon script :

Code:

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BufferedReader reader = new BufferedReader(new InputStreamReader(process.getInputStream()));
						String line = "";
						setOutput("");
						try {
							while((line = reader.readLine()) != null) {
								/** Outpuut stream processing of miRNAFold **/
								Rrrr R1 = new Rrrr(line);
								PyhtonScriptInterpreter interpreter = new PyhtonScriptInterpreter();
								String motifs = interpreter.executeScript("alignement_final.py " + R1.getresult());
								//String [] cmd2 = new String[]{      ,R1.getresult()};
								 motifs = getOutput2();
								setOutput( getOutput()+"<br>"+line+"<br>"+ getOutput2());
							}
						} finally {
							reader.close();
						}
					} catch(IOException ioe) {
						ioe.printStackTrace();
					}

Je fais appel a ma classe Rrrr qui me permet de r�cup�rer des arguments que j'aimerai ensuite passer a mon script python pour qu'il s'execute et qu'il me renvoie des r�sultats (getoutput2).

Je vais modifier ma ligne

Code:

PyhtonScriptInterpreter interpreter = new PyhtonScriptInterpreter();

qui est inutile, mais je voulais vous montrer la strat�gie que je voudrais employer (globalement).

EDIT : en fait je pense que l'importation devrait se faire dans ma classe Rrrr directement je pense, l� o� se situe mon main, voici cette classe (je viens d'y importer les diff�rentes librairies):

Code:

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package paquet;
import javax.script.ScriptEngine;
import javax.script.ScriptEngineManager;
import javax.script.ScriptException;
 
 
public class Rrrr {
 
	/**
         * @param args
         * 
         * 
         **
         */ 
	private String positionDebut; 
	private String positionFin;
	private String Fin;
 
	public Rrrr (String ligne){
 
 
 
 
		String[] valeur = ligne.split(" ");  
 
		if (valeur.length >= 3) {
		   this.positionDebut=valeur[0];
		    this.positionFin=valeur[1];
		    this.Fin = valeur[valeur.length - 1];
		}
 
		}
 
	  public String getresult(){
 
		 String result = this.positionDebut + " " + this.positionFin + " "+  this.Fin ;
		  return result;
 
	  }
 
	public static void main(String[] args) {
 
 
 
 
		//String ligne ="53 130 + [-27.3] ((((.(.(((((((.((..((((.........(((..(((....))).)))...))))..)).))))))).)..)))";
 
		//Rrrr test = new Rrrr(ligne);
 
}
}

Merci encore

01/06/2011, 13h32
Thomas77380

Mon cas est un peu compliqu� en fait, je voudrais savoir si quelqu'un avait d�j� r�ussis a importer un simple script python dans son code java et a le faire tourner, et si oui la proc�dure qu'il a utilis� car je suis le tutoriel suivant:
http://wiki.python.org/jython/UserGuide#using-jsr-223

seulement je ne vois pas l'importation d'un script mais plut�t la d�finition d'un script m�me a l'int�rieur du code, de plus lorsque j'essaie d'ex�cuter ce code je re�ois le message d'erreur suivant:

Code:

Exception in thread "main" java.lang.NullPointerException

apparemment le import sys ne passe pas :/

Bref si quelqu'un poss�dant une experience de Jython pouvait m'aider :?