Discussion :

[anibal]

Bonjour je suis en train d'essayer de compiler un code source mais j'ai des problemes lors de la compilation que je comprends pas le code a �t� d�velopp� sous VC et je l'ai adapt� sous linux.

Voici le message d'erreur

Code :

S�lectionner tout - Visualiser dans une fen�tre � part

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g++ -c Analysis.cpp -o Analysis.o
Analysis.cpp: In function 'void DiscardMotif()':
Analysis.cpp:108: error: no match for 'operator=' in 'MotifIter = MotifMap. std::map<_Key, _Tp, _Compare, _Alloc>::erase [with _Key = int, _Tp = MotifItem_t, _Compare = std::less<int>, _Alloc = std::allocator<std::pair<const int, MotifItem_t> >](MotifIter)'
/usr/lib/gcc/x86_64-redhat-linux/4.1.2/../../../../include/c++/4.1.2/bits/stl_tree.h:152: note: candidates are: std::_Rb_tree_iterator<std::pair<const int, MotifItem_t> >& std::_Rb_tree_iterator<std::pair<const int, MotifItem_t> >::operator=(const std::_Rb_tree_iterator<std::pair<const int, MotifItem_t> >&)
Analysis.cpp: In function 'void UniqueMotif()':
Analysis.cpp:126: error: no match for 'operator=' in 'Next = MotifMap. std::map<_Key, _Tp, _Compare, _Alloc>::erase [with _Key = int, _Tp = MotifItem_t, _Compare = std::less<int>, _Alloc = std::allocator<std::pair<const int, MotifItem_t> >](Next)'
/usr/lib/gcc/x86_64-redhat-linux/4.1.2/../../../../include/c++/4.1.2/bits/stl_tree.h:152: note: candidates are: std::_Rb_tree_iterator<std::pair<const int, MotifItem_t> >& std::_Rb_tree_iterator<std::pair<const int, MotifItem_t> >::operator=(const std::_Rb_tree_iterator<std::pair<const int, MotifItem_t> >&)
make: *** [Analysis.o] Error 1

Merci de votre aide

[koala01]

Salut,

En gros, il se plaint du fait qu'il n'y a pas d'op�rateur d'affectation...

Il te signale que ce l'op�rateur d'affectation possible passe par un it�rateur de type std::pair.

Visiblement, si on en croit les renseignements donn�s, tu essaie de supprimer une entr�e dans un tableau associatif de type std::map<int, MotifItem_t>.

La fonction erase de la std::map utilise un it�rateur, et il est donc vraissemblable que tu doive disposer d'un it�rateur sur l'�l�ment � supprimer:

• Soit en tant que membre de ta classe
• Soit fournis comme param�tre � ta fonction
• Soit recherch� dans la fonction sur base d'une cl� fournie en param�tre de la fonction

PS: Il aurait �t� beaucoup plus facile pour tout le monde si tu avais fournis le code des fonctions incrimin�es, � savoir DiscardMotif et UniqueMotif

[anibal]

pas de probleme les voici :

Code :

S�lectionner tout - Visualiser dans une fen�tre � part

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void DiscardMotif()
{
	map<int,MotifItem_t>::iterator MotifIter;
	bool bAdd;
 
	for(MotifIter=MotifMap.begin();MotifIter!=MotifMap.end();bAdd?MotifIter++:MotifIter)
	{
		bAdd=false;
		if((int)(unsigned int)(*MotifIter).second.ProteinID.size()<Motif_MemberSize)
			MotifIter = MotifMap.erase(MotifIter);
		else
			bAdd=true;
	}
}
 
void UniqueMotif()
{
	map<int, MotifItem_t>::iterator MotifIter, Next;
	bool bAdd;
 
	for(MotifIter=MotifMap.begin();MotifIter!=MotifMap.end();MotifIter++)
	{
		Next=MotifIter;
		for(++Next;Next!=MotifMap.end();bAdd?Next++:Next)
		{
			bAdd=false;
			if((*MotifIter).second.ProteinID==(*Next).second.ProteinID && (*MotifIter).second.ProteinPos[0]==(*Next).second.ProteinPos[0])
				Next=MotifMap.erase(Next);
			else
				bAdd=true;
		}
	}
}

[anibal]

j'ai enlev� "MotifIter =" dans la premi�re et "Next=" et il rale plus

[anibal]

par contre lors de la compilation en verufuant les bugs un par un j'ai obtenu �a comme message d'erreur

g++ -c Analysis.cpp -o Analysis.o
g++ -c MotifFinding5.cpp -o MotifFinding5.o
g++ -c ReadProteinFile.cpp -o ReadProteinFile.o
g++ -c stdafx.cpp -o stdafx.o
g++ -c SubstitutionMatrix.cpp -o SubstitutionMatrix.o
g++ -c Tools.cpp -o Tools.o
g++ -o motif Analysis.o MotifFinding5.o ReadProteinFile.o stdafx.o SubstitutionMatrix.o Tools.o -g -g -lm -L blosum.h blosum62.h stdafx.h structure.h
/usr/lib/gcc/x86_64-redhat-linux/4.1.2/../../../../lib64/crt1.o: In function `_start':
(.text+0x20): undefined reference to `main'
collect2: ld returned 1 exit status
make: *** [motif] Error 1

[anibal]

j'ai trouv� le probl�me.

Merci tout de meme de votre message