Discussion :

[salma1990]

bonjour,

je suis en train de traduire l'algorithme d'alignement local "smith_waterman" en un programme c++ mais je suis vraiment coinc�e l�!
l'algorithme ne doit pas rester tel qu'il est! il y a des modifications � faire.
en effet:
-le score d'alignement est �gal �: 100/(nombre de caract�res de la promi�re s�quence) dans le cas d'un match
-le score d'alignement est �gal �: -(100/(nombre de caract�res de la promi�re s�quence)) dans le cas d'un mismatch.
d'une mani�re � ce que le score maximal existant dans la matrice ne d�passe pas 100.

Mon probl�me c'est que je trouve des valeurs sup�rieures � 100 dans la matrice ce qui n'est pas admissible.

qui parmi vous aura l'amabilit� de m'aider s'il vous plait?

merci,

[GeantVert13]

l'erreur est l�: suis la direction de mon doigt...

Plus s�rieusement, �a va �tre dur de t'aider sans voir ce que tu as fait.

[salma1990]

vous voulez que je vous copie tout le programme?

[GeantVert13]

vous voulez que je vous copie tout le programme?

ben au moins la partie qui alimente la matrice

[GeantVert13]

juste une tentative dans le vide... es-tu sure que "nombre de caract�res de la premi�re s�quence" est toujours > 0 ?

[salma1990]

oui oui! en fait c'est l'utilisateur qui tape les deux s�quences comme entr�es � chaque fois que je fais un essai je tape deux s�quences qui ne sont pas vides