Στο Αριστοτέλειο Πανεπιστήμιο Θεσσαλονίκης  δραστηριοποιούνται οι ακόλουθοι σύλλογοι εργαζομένων:

• Ενιαίος Συλλόγος Διδακτικού και Ερευνητικού Προσωπικού του ΑΠΘ | Ε.Σ.Δ.Ε.Π. ΑΠΘ
• Σύλλογος Διοικητικού Προσωπικού ΑΠΘ
• Σύλλογος Ειδικού Τεχνικού Εργαστηριακού Προσωπικού | Ε.Τ.Ε.Π.
• Σύλλογος Ειδικού Εκπαιδευτικού Προσωπικού | Ε.Ε.Π. ΑΠΘ
• Σύλλογος Εργαστηριακού Διδακτικού Προσωπικού | Σ.Ε.ΔΙ.Π ΑΠΘ