SOX4

SOX4
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 3U2B
Ідентифікатори
Символи	SOX4, EVI16, SRY-box 4, SRY-box transcription factor 4, CSS10
Зовнішні ІД	OMIM: 184430 MGI: 98366 HomoloGene: 2338 GeneCards: SOX4
Онтологія гена Молекулярна функція • DNA binding • GO:0001105 transcription coactivator activity • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000975 transcription cis-regulatory region binding • core promoter sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • protein heterodimerization activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding Клітинна компонента • цитоплазма • нуклеоплазма • мітохондрія • клітинне ядро Біологічний процес • skeletal system development • noradrenergic neuron differentiation • DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in cell cycle arrest • cardiac ventricle formation • glial cell development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • limb bud formation • regulation of protein stability • sympathetic nervous system development • somatic stem cell population maintenance • glucose homeostasis • positive regulation of canonical Wnt signaling pathway • ventricular septum morphogenesis • protein stabilization • ascending aorta morphogenesis • negative regulation of cell death • mitral valve morphogenesis • positive regulation of translation • transcription, DNA-templated • neuroepithelial cell differentiation • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • positive regulation of Wnt signaling pathway • negative regulation of protein ubiquitination • heart development • pro-B cell differentiation • atrial septum primum morphogenesis • T cell differentiation • kidney morphogenesis • positive regulation of cell population proliferation • spinal cord development • positive regulation of apoptotic process • glial cell proliferation • canonical Wnt signaling pathway • positive regulation of N-terminal peptidyl-lysine acetylation • spinal cord motor neuron differentiation • cardiac right ventricle morphogenesis • neural tube formation • cellular response to glucose stimulus • endocrine pancreas development • negative regulation of cell population proliferation • positive regulation of insulin secretion • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • transcription by RNA polymerase II • диференціація клітин Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6659	20677
Ensembl	ENSG00000124766	ENSMUSG00000076431
UniProt	Q06945	Q06831
RefSeq (мРНК)	NM_003107	NM_009238
RefSeq (білок)	NP_003098	NP_033264
Локус (UCSC)	Хр. 6: 21.59 – 21.6 Mb	Хр. 13: 29.13 – 29.14 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SOX4 (англ. SRY-box 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 474 амінокислот, а молекулярна маса — 47 263.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MVQQTNNAEN		TEALLAGESS		DSGAGLELGI		ASSPTPGSTA		STGGKADDPS
WCKTPSGHIK		RPMNAFMVWS		QIERRKIMEQ		SPDMHNAEIS		KRLGKRWKLL
KDSDKIPFIR		EAERLRLKHM		ADYPDYKYRP		RKKVKSGNAN		SSSSAAASSK
PGEKGDKVGG		SGGGGHGGGG		GGGSSNAGGG		GGGASGGGAN		SKPAQKKSCG
SKVAGGAGGG		VSKPHAKLIL		AGGGGGGKAA		AAAAASFAAE		QAGAAALLPL
GAAADHHSLY		KARTPSASAS		ASSAASASAA		LAAPGKHLAE		KKVKRVYLFG
GLGTSSSPVG		GVGAGADPSD		PLGLYEEEGA		GCSPDAPSLS		GRSSAASSPA
AGRSPADHRG		YASLRAASPA		PSSAPSHASS		SASSHSSSSS		SSGSSSSDDE
FEDDLLDLNP		SSNFESMSLG		SFSSSSALDR		DLDFNFEPGS		GSHFEFPDYC
TPEVSEMISG		DWLESSISNL		VFTY

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до активаторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транскрипція, регуляція транскрипції. Білок має сайт для зв'язування з ДНК. Локалізований у ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504

Див. також

• Хромосома 6