SNUPN

SNUPN
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 1XK5, 2P8Q, 2Q5D, 2QNA, 3GB8, 3GJX, 3LWW, 3NBY, 3NBZ, 3NC0
Ідентифікатори
Символи	SNUPN, KPNBL, RNUT1, Snurportin1, snurportin 1
Зовнішні ІД	OMIM: 607902 MGI: 1913319 HomoloGene: 4166 GeneCards: SNUPN
Онтологія гена Молекулярна функція • RNA cap binding • RNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • nuclear import signal receptor activity Клітинна компонента • цитоплазма • гіалоплазма • ядерна пора • клітинне ядро • внутрішньоклітинний Біологічний процес • snRNA import into nucleus • protein import into nucleus • spliceosomal snRNP assembly • import into nucleus Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	10073	66069
Ensembl	ENSG00000169371	ENSMUSG00000055334
UniProt	O95149	Q80W37
RefSeq (мРНК)	NM_005701 NM_001042581 NM_001042588	NM_178374
RefSeq (білок)	NP_001036046 NP_001036053 NP_005692	NP_848461
Локус (UCSC)	Хр. 15: 75.6 – 75.63 Mb	Хр. 9: 56.86 – 56.89 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SNUPN (англ. Snurportin 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 15-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 360 амінокислот, а молекулярна маса — 41 143.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MEELSQALAS		SFSVSQDLNS		TAAPHPRLSQ		YKSKYSSLEQ		SERRRRLLEL
QKSKRLDYVN		HARRLAEDDW		TGMESEEENK		KDDEEMDIDT		VKKLPKHYAN
QLMLSEWLID		VPSDLGQEWI		VVVCPVGKRA		LIVASRGSTS		AYTKSGYCVN
RFSSLLPGGN		RRNSTAKDYT		ILDCIYNEVN		QTYYVLDVMC		WRGHPFYDCQ
TDFRFYWMHS		KLPEEEGLGE		KTKLNPFKFV		GLKNFPCTPE		SLCDVLSMDF
PFEVDGLLFY		HKQTHYSPGS		TPLVGWLRPY		MVSDVLGVAV		PAGPLTTKPD
YAGHQLQQIM		EHKKSQKEGM		KEKLTHKASE		NGHYELEHLS		TPKLKGSSHS
PDHPGCLMEN

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Narayanan U., Ospina J.K., Frey M.R., Hebert M.D., Matera A.G. (2002). SMN, the spinal muscular atrophy protein, forms a pre-import snRNP complex with snurportin1 and importin beta. Hum. Mol. Genet. 11: 1785—1795. PMID 12095920 DOI:10.1093/hmg/11.15.1785
• Strasser A., Dickmanns A., Luehrmann R., Ficner R. (2005). Structural basis for m3G-cap-mediated nuclear import of spliceosomal UsnRNPs by snurportin1. EMBO J. 24: 2235—2243. PMID 15920472 DOI:10.1038/sj.emboj.7600701
• Mitrousis G., Olia A.S., Walker-Kopp N., Cingolani G. (2008). Molecular basis for the recognition of snurportin 1 by importin beta. J. Biol. Chem. 283: 7877—7884. PMID 18187419 DOI:10.1074/jbc.M709093200
• Bhardwaj A., Cingolani G. (2010). Conformational selection in the recognition of the snurportin importin beta binding domain by importin beta. Biochemistry. 49: 5042—5047. PMID 20476751 DOI:10.1021/bi100292y

Див. також

• Хромосома 15