SF3B6

SF3B6
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2F9D, 2F9J, 2FHO, 3LQV
Ідентифікатори
Символи	SF3B6, HSPC175, Ht006, P14, SAP14, SAP14a, SF3B14, SF3B14a, CGI-110, splicing factor 3b subunit 6
Зовнішні ІД	OMIM: 607835 MGI: 1913305 HomoloGene: 9360 GeneCards: SF3B6
Онтологія гена Молекулярна функція • nucleic acid binding • RNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • mRNA binding Клітинна компонента • catalytic step 2 spliceosome • U12-type spliceosomal complex • U2-type spliceosomal complex • precatalytic spliceosome • клітинне ядро • U2 snRNP • нуклеоплазма • spliceosomal complex Біологічний процес • mRNA splicing, via spliceosome • mRNA processing • blastocyst formation • Сплайсинг РНК Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	51639	66055
Ensembl	ENSG00000115128	ENSMUSG00000037361
UniProt	Q9Y3B4	P59708
RefSeq (мРНК)	NM_016047	NM_025323
RefSeq (білок)	NP_057131	NP_079599
Локус (UCSC)	Хр. 2: 24.07 – 24.08 Mb	Хр. 12: 4.87 – 4.88 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

SF3B6 (англ. Splicing factor 3b subunit 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 125 амінокислот, а молекулярна маса — 14 585.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MAMQAAKRAN		IRLPPEVNRI		LYIRNLPYKI		TAEEMYDIFG		KYGPIRQIRV
GNTPETRGTA		YVVYEDIFDA		KNACDHLSGF		NVCNRYLVVL		YYNANRAFQK
MDTKKKEEQL		KLLKEKYGIN		TDPPK

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін

Y: Тирозин

Задіяний у таких біологічних процесах як процесінг мРНК, сплайсінг мРНК, ацетиляція. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у ядрі.

Література

• Lai C.-H., Chou C.-Y., Ch'ang L.-Y., Liu C.-S., Lin W.-C. (2000). Identification of novel human genes evolutionarily conserved in Caenorhabditis elegans by comparative proteomics. Genome Res. 10: 703—713. PMID 10810093 DOI:10.1101/gr.10.5.703
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Golas M.M., Sander B., Will C.L., Luhrmann R., Stark H. (2003). Molecular architecture of the multiprotein splicing factor SF3b. Science. 300: 980—984. PMID 12738865 DOI:10.1126/science.1084155
• Schellenberg M.J., Dul E.L., MacMillan A.M. (2011). Structural model of the p14/SF3b155 - branch duplex complex. RNA. 17: 155—165. PMID 21062891 DOI:10.1261/rna.2224411

Див. також

• Хромосома 2