RUFY1

RUFY1
Наявні структури PDB Пошук ортологів: PDBe RCSB Список кодів PDB 2YQM, 2YW8
Ідентифікатори
Символи	RUFY1, RABIP4, ZFYVE12, RUN and FYVE domain containing 1
Зовнішні ІД	OMIM: 610327 MGI: 2429762 HomoloGene: 23522 GeneCards: RUFY1
Онтологія гена Молекулярна функція • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • зв'язування з іоном металу • lipid binding • SH3 domain binding • SH2 domain binding Клітинна компонента • внутрішньоклітинна мембранна органела • мембрана • цитоплазма • гіалоплазма • nuclear speck • early endosome membrane • ендосома • клітинне ядро Біологічний процес • protein transport • ендоцитоз • phosphatidylinositol biosynthetic process • regulation of endocytosis • small GTPase mediated signal transduction Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	80230	216724
Ensembl	ENSG00000284260 ENSG00000176783	ENSMUSG00000020375
UniProt	Q96T51	Q8BIJ7
RefSeq (мРНК)	NM_001040451 NM_001040452 NM_025158	NM_172557
RefSeq (білок)	NP_001035541 NP_001035542 NP_079434	NP_766145
Локус (UCSC)	Хр. 5: 179.55 – 179.61 Mb	Хр. 11: 50.28 – 50.32 Mb
PubMed search
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

RUFY1 (англ. RUN and FYVE domain containing 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми. Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 708 амінокислот, а молекулярна маса — 79 818.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MADREGGCAA		GRGRELEPEL		EPGPGPGSAL		EPGEEFEIVD		RSQLPGPGDL
RSATRPRAAE		GWSAPILTLA		RRATGNLSAS		CGSALRAAAG		LGGGDSGDGT
ARAASKCQMM		EERANLMHMM		KLSIKVLLQS		ALSLGRSLDA		DHAPLQQFFV
VMEHCLKHGL		KVKKSFIGQN		KSFFGPLELV		EKLCPEASDI		ATSVRNLPEL
KTAVGRGRAW		LYLALMQKKL		ADYLKVLIDN		KHLLSEFYEP		EALMMEEEGM
VIVGLLVGLN		VLDANLCLKG		EDLDSQVGVI		DFSLYLKDVQ		DLDGGKEHER
ITDVLDQKNY		VEELNRHLSC		TVGDLQTKID		GLEKTNSKLQ		EELSAATDRI
CSLQEEQQQL		REQNELIRER		SEKSVEITKQ		DTKVELETYK		QTRQGLDEMY
SDVWKQLKEE		KKVRLELEKE		LELQIGMKTE		MEIAMKLLEK		DTHEKQDTLV
ALRQQLEEVK		AINLQMFHKA		QNAESSLQQK		NEAITSFEGK		TNQVMSSMKQ
MEERLQHSER		ARQGAEERSH		KLQQELGGRI		GALQLQLSQL		HEQCSSLEKE
LKSEKEQRQA		LQRELQHEKD		TSSLLRMELQ		QVEGLKKELR		ELQDEKAELQ
KICEEQEQAL		QEMGLHLSQS		KLKMEDIKEV		NQALKGHAWL		KDDEATHCRQ
CEKEFSISRR		KHHCRNCGHI		FCNTCSSNEL		ALPSYPKPVR		VCDSCHTLLL
QRCSSTAS

A: Аланін
C: Цистеїн
D: Аспарагінова кислота
E: Глутамінова кислота
F: Фенілаланін
G: Гліцин
H: Гістидин
I: Ізолейцин
K: Лізин
L: Лейцин
M: Метіонін
N: Аспарагін
P: Пролін
Q: Глутамін
R: Аргінін
S: Серин
T: Треонін
V: Валін
W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, ендоцитоз, альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з ліпідами, іонами металів, іоном цинку. Локалізований у цитоплазмі, мембрані, ендосомах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI:10.1101/gr.2596504
• Yang J., Kim O., Wu J., Qiu Y. (2002). Interaction between tyrosine kinase Etk and a RUN-domain and FYVE-domain containing protein RUFY1. A possible role of Etk in regulation of vesicle trafficking. J. Biol. Chem. 277: 30219—30226. PMID 11877430 DOI:10.1074/jbc.M111933200

Див. також

• Хромосома 5